More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1933 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_1933  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
272 aa  506  9.999999999999999e-143  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.198455  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2498  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.23 
 
 
263 aa  137  1e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.105162 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2122  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.48 
 
 
259 aa  133  3e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.184482  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1848  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.78 
 
 
267 aa  129  7.000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2190  ABC transporter, permease protein  41.31 
 
 
267 aa  125  5e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.277433  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0708  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40 
 
 
251 aa  107  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.514017  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0641  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.46 
 
 
268 aa  105  8e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.24033  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2241  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.76 
 
 
260 aa  105  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8651  ABC transporter related  35.64 
 
 
615 aa  103  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1405  NifC-like ABC-type porter  32.65 
 
 
268 aa  100  3e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.158337  normal  0.495211 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1226  NifC-like ABC-type porter  33.33 
 
 
273 aa  99.8  4e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000058663 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1189  ABC molybdenum transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  38 
 
 
620 aa  97.4  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0831674  normal  0.645361 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0650  NifC-like ABC-type porter  31.7 
 
 
270 aa  97.1  3e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0108436  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1654  NifC-like ABC-type porter  29.26 
 
 
279 aa  94.7  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1021  NifC-like ABC-type porter  34.2 
 
 
279 aa  93.6  3e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.884483  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1232  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  32.75 
 
 
286 aa  92.4  7e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.177888  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1151  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.55 
 
 
260 aa  91.3  2e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.607907  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0378  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.22 
 
 
269 aa  89.4  6e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3463  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  32.39 
 
 
275 aa  89  7e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00996182  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0526  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
272 aa  89.4  7e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0009  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.1 
 
 
250 aa  89  9e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0056  tungstate/molybdate transport system permease protein  25.66 
 
 
280 aa  87.4  2e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0767  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.55 
 
 
255 aa  85.1  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2230  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  30.85 
 
 
604 aa  85.1  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.064577  normal  0.730422 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2168  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  30.85 
 
 
604 aa  84.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1023  tungstate/molybdate transport system permease protein  27.1 
 
 
269 aa  83.6  0.000000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.154984  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0832  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.35 
 
 
255 aa  83.2  0.000000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0257  NifC-like ABC-type porter  30.66 
 
 
270 aa  81.6  0.00000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2651  NifC-like ABC-type porter  30.9 
 
 
279 aa  81.6  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1404  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.33 
 
 
325 aa  80.9  0.00000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.343545  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1599  NifC-like ABC-type porter  24.64 
 
 
278 aa  79.3  0.00000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2207  NifC-like ABC-type porter  31.11 
 
 
272 aa  79  0.00000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1979  NifC-like ABC-type porter  27.36 
 
 
263 aa  78.2  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.200297 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2056  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.46 
 
 
256 aa  77  0.0000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.412786  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2546  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  32.14 
 
 
282 aa  76.3  0.0000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.914305 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2086  ABC-type sulfate transport system, permease component  26.83 
 
 
282 aa  76.3  0.0000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00102691  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2345  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  29.67 
 
 
223 aa  76.3  0.0000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2303  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  29.67 
 
 
223 aa  76.3  0.0000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2498  NifC-like ABC-type porter  34.12 
 
 
244 aa  75.5  0.0000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2783  ABC-type transport systems, permease component  32.09 
 
 
261 aa  74.7  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000474953  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4148  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  32.67 
 
 
628 aa  75.1  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.75217  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4969  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  33.52 
 
 
271 aa  74.3  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4306  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  34.68 
 
 
272 aa  73.6  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.96212 
 
 
-
 
NC_002936  DET1160  molybdenum ABC transporter, permease protein  28.43 
 
 
222 aa  73.2  0.000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0311194  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1823  NifC-like ABC-type porter  29.06 
 
 
263 aa  73.2  0.000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1736  NifC-like ABC-type porter  26.58 
 
 
270 aa  72.8  0.000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2733  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  34.25 
 
 
282 aa  72  0.000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.160119 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0125  ABC type transporter  28.34 
 
 
304 aa  72  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000364812 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4991  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  29.7 
 
 
615 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2900  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  33 
 
 
263 aa  72  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3448  NifC-like ABC-type porter  30.77 
 
 
269 aa  70.9  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3092  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  26.79 
 
 
293 aa  70.9  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2633  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.17 
 
 
271 aa  70.9  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000135254  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1618  NifC-like ABC-type porter  27.04 
 
 
266 aa  70.5  0.00000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.156172  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0385  NifC-like ABC-type porter  20.81 
 
 
266 aa  69.3  0.00000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1738  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  28.71 
 
 
224 aa  68.9  0.00000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.537538  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0506  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  34.78 
 
 
292 aa  68.9  0.00000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.933061 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0192  molybdenum ABC transporter, permease  27.83 
 
 
224 aa  68.9  0.00000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0201  molybdenum ABC transporter permease  28.16 
 
 
229 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0188  molybdenum ABC transporter, permease  28.16 
 
 
224 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1881  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.48 
 
 
254 aa  68.2  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2009  NifC-like ABC-type porter  27.04 
 
 
271 aa  68.6  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.744846  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0220  molybdate ABC transporter, permease protein  28.16 
 
 
224 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2343  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  27.44 
 
 
221 aa  68.2  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.367672  normal  0.691187 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0199  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  26.83 
 
 
223 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1527  NifC-like ABC-type porter  21.27 
 
 
266 aa  68.2  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00122012 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0221  molybdenum ABC transporter, permease protein, putative  27.36 
 
 
224 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0243  molybdate ABC transporter permease  27.94 
 
 
601 aa  67.4  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3044  molybdate ABC transporter inner membrane subunit  27.45 
 
 
602 aa  67.4  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.929745  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1553  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  24.18 
 
 
277 aa  67.8  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2821  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  31.88 
 
 
262 aa  68.2  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000164471  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4340  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  31.01 
 
 
226 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.991243 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1445  NifC-like ABC-type porter  20.81 
 
 
266 aa  67.8  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.452382  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1877  molybdate ABC transporter inner membrane protein  29.38 
 
 
224 aa  67.4  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.613271  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0891  NifC-like ABC-type porter  28.57 
 
 
273 aa  67  0.0000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.966064  normal  0.181406 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3445  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  30.67 
 
 
223 aa  67  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0570  molybdate ABC transporter permease  31.94 
 
 
238 aa  66.6  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0185  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  26.36 
 
 
224 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2974  molybdate ABC transporter, permease protein  30.38 
 
 
226 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.111033  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1949  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  29.94 
 
 
259 aa  66.2  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.644349  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1046  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  27.7 
 
 
294 aa  66.2  0.0000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0227  molybdate ABC transporter, permease protein  27.36 
 
 
224 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1185  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  26.87 
 
 
293 aa  65.5  0.0000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2079  molybdenum ABC transporter permease protein  32.12 
 
 
229 aa  64.7  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2757  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.01 
 
 
226 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.129462  normal  0.0470639 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1159  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  25.25 
 
 
224 aa  65.5  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000255894  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1306  molybdate ABC transporter, permease protein  25.96 
 
 
268 aa  65.1  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.606425 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1532  molybdate ABC transporter permease  29.95 
 
 
221 aa  64.7  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.633851  normal  0.0430142 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1442  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  26.38 
 
 
232 aa  65.1  0.000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3985  molybdate ABC transporter permease  30.1 
 
 
338 aa  65.1  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.108268  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0055  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  32.43 
 
 
220 aa  65.5  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5100  molybdate ABC transporter, permease protein  26.89 
 
 
224 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0752  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.65 
 
 
274 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.71715  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1116  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.37 
 
 
274 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.437968  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0767  sulfate/thiosulfate transporter permease subunit  25.1 
 
 
288 aa  65.1  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1233  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.65 
 
 
274 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.225385  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0211  NifC-like ABC-type porter  27.4 
 
 
288 aa  65.1  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.86371  normal  0.768111 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2748  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  26.54 
 
 
282 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2783  molybdate ABC transporter permease  29.75 
 
 
228 aa  63.9  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00057215  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1332  NifC-like ABC-type porter  25.7 
 
 
264 aa  64.3  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.77649  normal  0.0142467 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>