More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1092 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_1092  ABC-1 domain protein  100 
 
 
559 aa  1103    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.444876  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2723  ABC-1 domain protein  34.65 
 
 
464 aa  215  1.9999999999999998e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.232174  normal  0.409257 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1241  hypothetical protein  35.29 
 
 
451 aa  213  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.279292 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0954  hypothetical protein  35.34 
 
 
452 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0975  hypothetical protein  35.94 
 
 
455 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.127437  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0972  hypothetical protein  35.34 
 
 
452 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0247745 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10660  hypothetical protein  36.36 
 
 
488 aa  209  8e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0203819  normal  0.0597798 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4556  ABC-1 domain protein  38.9 
 
 
456 aa  208  2e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1172  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  33.69 
 
 
558 aa  206  1e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0170  hypothetical protein  33.33 
 
 
588 aa  202  9.999999999999999e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5111  hypothetical protein  33.49 
 
 
455 aa  200  6e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.448603 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4587  hypothetical protein  32.53 
 
 
610 aa  200  7e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0690861  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1648  2-octaprenylphenol hydroxylase  30.71 
 
 
559 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0647  hypothetical protein  32.07 
 
 
565 aa  197  5.000000000000001e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000186884  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1817  hypothetical protein  33.96 
 
 
571 aa  196  7e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.457399  normal  0.0626146 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2342  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  31.35 
 
 
563 aa  196  1e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000602733  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1015  hypothetical protein  31.69 
 
 
432 aa  195  2e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000662027  hitchhiker  0.000135792 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0295  ABC-1 domain protein  29.9 
 
 
558 aa  194  3e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1871  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  34.13 
 
 
568 aa  194  4e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1733  hypothetical protein  31.76 
 
 
557 aa  194  5e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00187554  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1606  ABC-1 domain protein  32.76 
 
 
566 aa  193  9e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1159  hypothetical protein  31.17 
 
 
453 aa  192  1e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0152108 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3247  ABC-1 domain protein  32.16 
 
 
558 aa  191  2e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000474003  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1693  ABC-1 domain protein  33.91 
 
 
565 aa  189  8e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.12515  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5305  ABC-1 domain protein  33.91 
 
 
565 aa  189  8e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2582  ABC-1 domain protein  33.52 
 
 
583 aa  189  9e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0176  2-octaprenylphenol hydroxylase  31.81 
 
 
547 aa  189  1e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1232  protein kinase  30.65 
 
 
451 aa  189  2e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.963703 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2205  hypothetical protein  33.42 
 
 
552 aa  187  3e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0003  hypothetical protein  31.61 
 
 
423 aa  187  3e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00161336  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2578  2-octaprenylphenol hydroxylase  31.62 
 
 
559 aa  187  5e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.152488  normal  0.0679255 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00151  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  32.18 
 
 
558 aa  186  7e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15860  predicted unusual protein kinase  35.08 
 
 
550 aa  186  1.0000000000000001e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0841  ABC-1 domain-containing protein  33.5 
 
 
652 aa  184  3e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4898  ABC1 family protein  26.63 
 
 
558 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2106  hypothetical protein  32.88 
 
 
559 aa  184  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00766182 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_86278  predicted protein  31.61 
 
 
620 aa  183  8.000000000000001e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1333  ABC-1 domain protein  34.23 
 
 
543 aa  182  1e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.333757 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1843  hypothetical protein  33.15 
 
 
549 aa  182  1e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.295975  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1088  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  33.42 
 
 
561 aa  181  2e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0289446  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2561  ABC-1 domain protein  32.28 
 
 
558 aa  182  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2150  ABC-1 domain protein  34.21 
 
 
557 aa  181  2e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.181383  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2240  ABC-1 domain protein  34.21 
 
 
557 aa  181  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.319336  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2664  2-octaprenylphenol hydroxylase  30.08 
 
 
573 aa  181  2.9999999999999997e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.948881  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3928  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  33.42 
 
 
520 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.875977  normal  0.133275 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2690  ABC-1 domain protein  32.37 
 
 
582 aa  181  4e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.066858  normal  0.0662715 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1699  2-octaprenylphenol hydroxylase  33.95 
 
 
557 aa  181  4e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21207  predicted protein  33.16 
 
 
517 aa  181  4e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3494  2-octaprenylphenol hydroxylase  34.54 
 
 
530 aa  181  4e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0994  2-octaprenylphenol hydroxylase  31.37 
 
 
559 aa  180  4.999999999999999e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.380493  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1464  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  28.99 
 
 
555 aa  180  5.999999999999999e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00546242  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3964  ABC-1 domain-containing protein  30.93 
 
 
561 aa  179  1e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.871344  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0233  2-octaprenylphenol hydroxylase  35.39 
 
 
554 aa  179  1e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4296  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  33.42 
 
 
521 aa  179  1e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.156569 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1021  hypothetical protein  33.42 
 
 
556 aa  179  1e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.396117  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4402  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  33.17 
 
 
520 aa  178  2e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2586  ABC-1 domain protein  32.56 
 
 
562 aa  179  2e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0769  ABC-1 domain protein  33.42 
 
 
543 aa  178  2e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.477502 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5113  ABC-1 domain protein  33.6 
 
 
544 aa  177  3e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0222  ABC-1 domain protein  29.67 
 
 
571 aa  177  4e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.164391  normal  0.703829 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1388  hypothetical protein  30.29 
 
 
561 aa  177  5e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000298772  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0696  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  30.61 
 
 
514 aa  177  6e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3020  hypothetical protein  33.24 
 
 
544 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.087256 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0760  2-octaprenylphenol hydroxylase  32.41 
 
 
561 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1110  ABC-1 domain protein  31.27 
 
 
599 aa  175  1.9999999999999998e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4208  2-octaprenylphenol hydroxylase  33.96 
 
 
509 aa  175  1.9999999999999998e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2068  ABC-1 domain protein  29.31 
 
 
586 aa  174  5e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0240  ABC-1 domain protein  32.2 
 
 
544 aa  173  5.999999999999999e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7056  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  34.93 
 
 
517 aa  173  5.999999999999999e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0318  hypothetical protein  31.89 
 
 
592 aa  173  6.999999999999999e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0340511  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4721  hypothetical protein  28.5 
 
 
562 aa  173  7.999999999999999e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3869  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  33.74 
 
 
506 aa  171  2e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.838483 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1709  hypothetical protein  27.96 
 
 
514 aa  172  2e-41  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0661252 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2852  ubiquinone biosynthesis protein  29.89 
 
 
559 aa  172  2e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3417  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  32.52 
 
 
547 aa  172  2e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_2153  predicted protein  30.85 
 
 
397 aa  171  3e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.104794 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1598  hypothetical protein  30.02 
 
 
591 aa  171  4e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.429743  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2782  ABC-1 domain protein  31.28 
 
 
613 aa  171  4e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95149  normal  0.892849 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3367  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  33.87 
 
 
509 aa  170  5e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1207  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  30.79 
 
 
553 aa  170  5e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.842555  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5555  2-octaprenylphenol hydroxylase  30.81 
 
 
584 aa  171  5e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0825  ABC-1 domain protein  30.08 
 
 
558 aa  170  5e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0626  ABC-1 domain protein  28.95 
 
 
585 aa  171  5e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2905  ABC-1 domain-containing protein  32.43 
 
 
574 aa  170  6e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3956  ABC-1 domain protein  28.67 
 
 
552 aa  170  6e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.186201 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0400  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  33.77 
 
 
546 aa  169  9e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4049  hypothetical protein  29.6 
 
 
556 aa  169  1e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.240057  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3415  hypothetical protein  33.06 
 
 
560 aa  168  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00362763 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6251  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  34.49 
 
 
517 aa  168  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.900931  normal  0.0207356 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1337  2-octaprenylphenol hydroxylase  33.06 
 
 
549 aa  168  2e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0324  ABC-1 domain protein  31.7 
 
 
581 aa  168  2e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2071  ABC-1 domain protein  31.55 
 
 
581 aa  168  2e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0987216  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0061  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  30.79 
 
 
558 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3381  hypothetical protein  28.35 
 
 
578 aa  168  2.9999999999999998e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12230  2-octaprenylphenol hydroxylase  28.84 
 
 
559 aa  167  4e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0168037  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0918  serine/threonine protein kinase  28.24 
 
 
526 aa  167  4e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2382  ABC-1 domain protein  31.87 
 
 
557 aa  167  5.9999999999999996e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.423464  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1474  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  29.95 
 
 
561 aa  167  6.9999999999999995e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.604813 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3680  ABC-1 domain protein  32.56 
 
 
670 aa  166  6.9999999999999995e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0594  2-octaprenylphenol hydroxylase  31.35 
 
 
519 aa  166  1.0000000000000001e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.282335  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>