35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_R0043 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_R0043  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0045  tRNA-Leu  92.05 
 
 		 87 bp  111  3e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.612739  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0045  tRNA-Leu  97.62 
 
 		 86 bp  75.8  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0038  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 86 bp  60  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0037  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 85 bp  58  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4571  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 85 bp  58  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0933967  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0019  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 85 bp  58  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0025  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 86 bp  58  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.137331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0025  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.511347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0032  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  54  0.000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R48  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331195 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0021  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.148955  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0058  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.555666  normal  0.0187408 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0023  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 86 bp  50.1  0.00009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.473121  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0041  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 89 bp  50.1  0.00009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.168959  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt34  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt34  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0051  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 89 bp  48.1  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0034  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00470609  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna29  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 84 bp  48.1  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.181713  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0025  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0926964  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0025  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.262204  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0047  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0037  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0022  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000237873  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t36  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0727385  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0022  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000036656  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0005  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0046  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0039  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.217803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0027  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.161341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA43  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.815799  normal  0.0189224 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0025  tRNA-Leu  89.47 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0007  tRNA-Leu  88.1 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.90958 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0001  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>