149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0297 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_0297  GerA spore germination protein  100 
 
 
512 aa  1023    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3659  GerA spore germination protein  48.48 
 
 
510 aa  465  9.999999999999999e-131  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0585  GerA spore germination protein  49.11 
 
 
552 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.70288  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0139  spore germination protein KA  47.84 
 
 
523 aa  456  1e-127  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0054  GerA spore germination protein  46.23 
 
 
544 aa  434  1e-120  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0803  GerA spore germination protein  43.31 
 
 
511 aa  433  1e-120  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.905177  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2167  GerA spore germination protein  45.07 
 
 
541 aa  425  1e-118  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.087983  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2042  GerA spore germination protein  45.85 
 
 
560 aa  423  1e-117  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.480991 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2464  GerA spore germination protein  42.66 
 
 
541 aa  413  1e-114  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2278  GerA spore germination protein  42.35 
 
 
537 aa  410  1e-113  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0846  GerA spore germination protein  41.25 
 
 
540 aa  409  1e-113  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00100  GerA spore germination protein  43.22 
 
 
531 aa  408  1.0000000000000001e-112  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3160  spore germination protein GerAA  42.32 
 
 
524 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.275074 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3138  spore germination protein GerAA  41.6 
 
 
524 aa  403  1e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2101  spore germination protein GerAA  41.99 
 
 
524 aa  402  1e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2853  spore germination protein  41.58 
 
 
524 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0927787  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1461  GerA spore germination protein  43.94 
 
 
558 aa  399  9.999999999999999e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3167  spore germination protein GerAA  41.38 
 
 
524 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.580414  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1014  GerA spore germination protein  42.59 
 
 
533 aa  398  1e-109  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000120979 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3202  spore germination protein KA  44.17 
 
 
530 aa  397  1e-109  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2438  GerA spore germination protein  45.15 
 
 
587 aa  385  1e-106  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2928  spore germination protein GerAA  46.36 
 
 
437 aa  373  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2904  GerA family spore germination protein  46.6 
 
 
437 aa  375  1e-102  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0141963  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3150  spore germination protein GerAA  46.36 
 
 
437 aa  373  1e-102  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1194  grkA; spore germination protein, GrkA  40.04 
 
 
537 aa  374  1e-102  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.616884  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3282  GerA spore germination protein  41.61 
 
 
499 aa  375  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000691632  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2663  GerA spore germination protein  37.97 
 
 
517 aa  369  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0876  GerA spore germination protein  38.34 
 
 
530 aa  367  1e-100  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0438  GerA spore germination protein  41.49 
 
 
599 aa  367  1e-100  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.561382  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0078  germination protein  40.4 
 
 
517 aa  364  3e-99  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0597  GerA spore germination protein  39.83 
 
 
488 aa  362  9e-99  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2765  GerA spore germination protein  38.72 
 
 
490 aa  362  1e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000513551  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0837  spore germination protein GerLA  38.63 
 
 
489 aa  362  1e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0603  GerA spore germination protein  41.21 
 
 
534 aa  361  2e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0675  spore germination protein GerLA  39.06 
 
 
478 aa  359  5e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0709  spore germination protein GerLA  39.06 
 
 
478 aa  359  5e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1971  GerA spore germination protein  36.76 
 
 
592 aa  359  7e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0763  spore germination protein GerLA  39.06 
 
 
489 aa  359  8e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000217603 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0619  spore germination protein  38.97 
 
 
492 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2062  GerA spore germination protein  37.73 
 
 
511 aa  358  9.999999999999999e-98  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0619  spore germination protein  38.28 
 
 
492 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2456  GerA spore germination protein  36.9 
 
 
520 aa  356  5e-97  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0057  GerA spore germination protein  40.45 
 
 
523 aa  354  2e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0604  GerA spore germination protein  38.13 
 
 
534 aa  350  4e-95  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0778  spore germination protein GerLA  39.14 
 
 
492 aa  349  5e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0624  GerA spore germination protein  40.49 
 
 
492 aa  347  3e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4594  spore germination protein GerLA  38.97 
 
 
492 aa  347  4e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3070  GerA spore germination protein  47.37 
 
 
496 aa  346  6e-94  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0743  spore germination protein GerLA  38.41 
 
 
492 aa  346  6e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.702364  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2953  GerA spore germination protein  36.17 
 
 
622 aa  340  2.9999999999999998e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1732  GerA spore germination protein  37.95 
 
 
633 aa  337  2.9999999999999997e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0667  GerA spore germination protein  37.01 
 
 
589 aa  336  5.999999999999999e-91  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4666  spore germination protein GerKA  36.82 
 
 
500 aa  332  9e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  1.5266399999999997e-20 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1558  GerA spore germination protein  43.34 
 
 
495 aa  332  1e-89  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0765  spore germination protein GerKA  36.31 
 
 
500 aa  330  4e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0654  GerA spore germination protein  36.81 
 
 
530 aa  330  5.0000000000000004e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0671  spore germination protein GerKA  35.58 
 
 
500 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0546  spore germination protein KA  36.31 
 
 
500 aa  326  7e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0521  GerA spore germination protein  35.49 
 
 
578 aa  325  1e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0691  spore germination protein GerKA  37.24 
 
 
500 aa  325  2e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0602  spore germination protein GerKA  36.09 
 
 
500 aa  324  2e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0546  spore germination protein KA  37.24 
 
 
500 aa  325  2e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0635  spore germination protein GerKA  36.09 
 
 
500 aa  324  2e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3014  GerA spore germination protein  37.34 
 
 
519 aa  322  9.999999999999999e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1936  GerA spore germination protein  38.09 
 
 
596 aa  322  9.999999999999999e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0548  GerA spore germination protein  43.79 
 
 
500 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1709  GerZA  36.79 
 
 
497 aa  310  4e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000504866 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0829  GerA spore germination protein  39.95 
 
 
492 aa  310  5e-83  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1767  GerA spore germination protein  35.93 
 
 
504 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2341  GerA spore germination protein  42.45 
 
 
502 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0532317  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3599  spore germination protein  36.38 
 
 
512 aa  306  7e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0892  GerA spore germination protein  34.36 
 
 
504 aa  303  3.0000000000000004e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1956  GerA spore germination protein  37.01 
 
 
531 aa  303  4.0000000000000003e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1962  GerA spore germination protein  35.59 
 
 
525 aa  301  1e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.346602  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1634  spore germination protein  36.38 
 
 
512 aa  301  2e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3369  spore germination protein  36.54 
 
 
512 aa  298  2e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0478776  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3633  spore germination protein  36.54 
 
 
512 aa  298  2e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5573  GerA spore germination protein  33.97 
 
 
515 aa  297  3e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.32214 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3282  spore germination protein  36.32 
 
 
512 aa  296  8e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3332  spore germination protein  36.11 
 
 
512 aa  295  1e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3582  spore germination protein  36.11 
 
 
512 aa  295  2e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3682  spore germination protein  35.89 
 
 
512 aa  293  7e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0157  spore germination protein xa  32.48 
 
 
492 aa  286  5.999999999999999e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3142  spore germination protein, GerA family  37.89 
 
 
481 aa  282  9e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.401489 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2116  spore germination protein, GerA family  40.1 
 
 
499 aa  282  1e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2888  GerA family spore germination protein  34.76 
 
 
499 aa  278  1e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0644485  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3121  spore germination protein QA  35.16 
 
 
499 aa  277  3e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0643  GerA spore germination protein  35.47 
 
 
503 aa  270  5.9999999999999995e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2753  spore germination protein XA  35.9 
 
 
454 aa  269  7e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.32378  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0236  spore germination protein, gerabka family  32.72 
 
 
511 aa  268  1e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0199  spore germination protein, gerabka family  32.72 
 
 
511 aa  268  1e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4630  spore germination protein GerHA  36.83 
 
 
747 aa  267  4e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4483  spore germination protein  35.56 
 
 
735 aa  267  4e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4984  spore germination protein GerHA  36.83 
 
 
747 aa  267  4e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4464  spore germination protein  37.07 
 
 
773 aa  266  5.999999999999999e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4852  spore germination protein GerHA  35.73 
 
 
455 aa  266  7e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4874  spore germination protein GerHA  37.89 
 
 
734 aa  265  1e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0392  spore germination protein IA  36.1 
 
 
754 aa  263  8e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4869  spore germination protein GerHA  35.01 
 
 
455 aa  262  1e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4844  spore germination protein gerIA  36.69 
 
 
754 aa  262  1e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0520951  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>