296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3087 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_0452  heat shock protein 90  62.27 
 
 
629 aa  732    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0960  heat shock protein 90  59.16 
 
 
626 aa  671    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.515332  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3087  heat shock protein 90  100 
 
 
606 aa  1218    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1155  heat shock protein 90  58.99 
 
 
626 aa  672    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1028  heat shock protein 90  59.16 
 
 
626 aa  675    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.162426  normal  0.169491 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0044  heat shock protein 90  62.41 
 
 
611 aa  723    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0195468 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0044  heat shock protein 90  62.13 
 
 
611 aa  727    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5467  heat shock protein 90  62.01 
 
 
610 aa  718    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.306325  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0072  heat shock protein 90  47.08 
 
 
626 aa  531  1e-149  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0873  heat shock protein 90  45.07 
 
 
628 aa  503  1e-141  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000721641  normal  0.181903 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1017  heat shock protein 90  45.07 
 
 
628 aa  503  1e-141  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000769643  normal  0.045663 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3632  heat shock protein 90  46.29 
 
 
638 aa  502  1e-141  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6025  heat shock protein 90  44.59 
 
 
630 aa  500  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2812  heat shock protein 90  45.45 
 
 
637 aa  501  1e-140  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4692  heat shock protein 90  45.04 
 
 
628 aa  499  1e-140  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.595162  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4402  heat shock protein 90  44.95 
 
 
628 aa  496  1e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.626215  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4673  heat shock protein 90  45.95 
 
 
631 aa  497  1e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.25549  normal  0.0194601 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1326  heat shock protein 90  45.6 
 
 
624 aa  490  1e-137  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5351  heat shock protein 90  45.37 
 
 
630 aa  491  1e-137  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.514382 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1592  heat shock protein 90  45.05 
 
 
633 aa  489  1e-137  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5302  heat shock protein 90  44.43 
 
 
628 aa  490  1e-137  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1127  heat shock protein 90  43.3 
 
 
636 aa  482  1e-135  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.618251  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1718  heat shock protein 90  43.81 
 
 
634 aa  483  1e-135  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0826  heat shock protein 90  44.18 
 
 
657 aa  482  1e-135  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.257658 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1609  heat shock protein 90  41.79 
 
 
630 aa  482  1e-134  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4272  heat shock protein 90  44.43 
 
 
643 aa  477  1e-133  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1407  Heat shock protein Hsp90-like protein  41.15 
 
 
623 aa  477  1e-133  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1078  heat shock protein 90  42.81 
 
 
633 aa  477  1e-133  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0117405  normal  0.359208 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1313  heat shock protein 90  43.36 
 
 
637 aa  476  1e-133  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.145243  normal  0.133282 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0860  heat shock protein Hsp90  45.1 
 
 
628 aa  477  1e-133  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2208  heat shock protein HtpG  42.81 
 
 
635 aa  472  1e-132  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.741152  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2017  heat shock protein 90  42.81 
 
 
637 aa  473  1e-132  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.655724 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1625  heat shock protein 90  42.18 
 
 
634 aa  472  1e-132  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0598838 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1526  heat shock protein 90  42.47 
 
 
638 aa  473  1e-132  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00178213  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2002  Heat shock protein Hsp90-like protein  44.98 
 
 
626 aa  474  1e-132  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000463529  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2007  heat shock protein 90  44.21 
 
 
652 aa  473  1e-132  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3502  heat shock protein 90  43 
 
 
634 aa  475  1e-132  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.791518  normal  0.824555 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1798  heat shock protein 90  42.22 
 
 
637 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000145006 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0703  heat shock protein 90  40.26 
 
 
609 aa  471  1.0000000000000001e-131  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1428  heat shock protein 90  41.81 
 
 
637 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000680402  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2586  heat shock protein 90  41.75 
 
 
637 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000082742  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0435  ATP-binding region ATPase domain protein  43.67 
 
 
640 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1375  heat shock protein 90  41.81 
 
 
645 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000122327  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2663  heat shock protein 90  41.75 
 
 
637 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0275177  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2849  heat shock protein 90  41.56 
 
 
638 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000520054  decreased coverage  0.00000000518986 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2390  heat shock protein 90  42.13 
 
 
650 aa  468  9.999999999999999e-131  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4179  heat shock protein 90  42.39 
 
 
634 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.745481  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2893  heat shock protein 90  43.02 
 
 
624 aa  466  9.999999999999999e-131  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.661781  normal  0.181179 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0625  heat shock protein 90  40.3 
 
 
608 aa  467  9.999999999999999e-131  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2016  heat shock protein 90  41.97 
 
 
637 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3750  heat shock protein 90  42.39 
 
 
634 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2491  heat shock protein 90  43.2 
 
 
634 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.222444  normal  0.0870185 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2548  heat shock protein 90  41.59 
 
 
637 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00763476  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4929  heat shock protein 90  44.86 
 
 
620 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.621243 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2414  heat shock protein 90  39.31 
 
 
644 aa  465  9.999999999999999e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0405  heat shock protein 90  42.76 
 
 
624 aa  466  9.999999999999999e-131  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.103102  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3195  heat shock protein 90  43.02 
 
 
624 aa  466  9.999999999999999e-131  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.228822  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2143  heat shock protein 90  41.02 
 
 
644 aa  468  9.999999999999999e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000328119  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1689  heat shock protein 90  42.39 
 
 
634 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.05546  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0958  heat shock protein 90  40.19 
 
 
617 aa  466  9.999999999999999e-131  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0546  heat shock protein 90  40.46 
 
 
608 aa  467  9.999999999999999e-131  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.325036  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00424  heat shock protein 90  42.76 
 
 
624 aa  464  1e-129  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.318011  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3137  heat shock protein Hsp90  42.76 
 
 
624 aa  464  1e-129  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.145833  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2480  heat shock protein 90  41.26 
 
 
640 aa  462  1e-129  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2299  heat shock protein 90  41.81 
 
 
637 aa  464  1e-129  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000323275  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3055  heat shock protein 90  43.25 
 
 
622 aa  464  1e-129  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0550  heat shock protein 90  42.76 
 
 
624 aa  464  1e-129  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0208648  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2498  heat shock protein 90  42.04 
 
 
650 aa  463  1e-129  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000559019  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1109  heat shock protein 90  41.3 
 
 
639 aa  462  1e-129  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0564  heat shock protein 90  42.76 
 
 
624 aa  464  1e-129  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0215188  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0516  heat shock protein 90  42.76 
 
 
624 aa  464  1e-129  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0117874  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2099  heat shock protein 90  41.16 
 
 
635 aa  462  1e-129  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0130933  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00429  hypothetical protein  42.76 
 
 
624 aa  464  1e-129  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.304335  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3143  heat shock protein 90  42.76 
 
 
624 aa  464  1e-129  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00327164  normal  0.0320085 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2232  heat shock protein 90  40.96 
 
 
639 aa  462  1e-129  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000100055  hitchhiker  0.000273756 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43850  heat shock protein 90  42.39 
 
 
634 aa  463  1e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0511  heat shock protein 90  42.6 
 
 
624 aa  462  1e-129  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00679401  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1728  heat shock protein 90  41.19 
 
 
645 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000167687  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1803  heat shock protein 90  39.94 
 
 
644 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0102063 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3158  heat shock protein HtpG  41.88 
 
 
629 aa  459  9.999999999999999e-129  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.705865  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3036  heat shock protein 90  42.39 
 
 
629 aa  459  9.999999999999999e-129  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2113  heat shock protein 90  42.23 
 
 
630 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.230497 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2755  heat shock protein Hsp90  41.88 
 
 
629 aa  459  9.999999999999999e-129  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.613989  hitchhiker  0.00227659 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1796  heat shock protein 90  41.09 
 
 
638 aa  462  9.999999999999999e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000064656  unclonable  0.0000000164624 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00313  heat shock protein 90  43.78 
 
 
634 aa  459  9.999999999999999e-129  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3678  heat shock protein 90  42.23 
 
 
634 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.371141  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1264  heat shock protein 90  39.45 
 
 
630 aa  459  9.999999999999999e-129  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0853768  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0953  heat shock protein 90  41.73 
 
 
624 aa  459  9.999999999999999e-129  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.298384  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0266  heat shock protein 90  43.32 
 
 
636 aa  460  9.999999999999999e-129  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.48191  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1771  heat shock protein 90  42.44 
 
 
633 aa  459  9.999999999999999e-129  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000171528  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0296  heat shock protein 90  43.32 
 
 
636 aa  460  9.999999999999999e-129  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2251  heat shock protein 90  41.49 
 
 
637 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000711928  normal  0.266626 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2323  heat shock protein 90  41.49 
 
 
637 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000423215  hitchhiker  0.000689405 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2443  heat shock protein 90  41.65 
 
 
637 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000425948  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1413  heat shock protein 90  40.3 
 
 
608 aa  462  9.999999999999999e-129  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.276817  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1548  heat shock protein 90  42.67 
 
 
630 aa  455  1e-127  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00180815  normal  0.134338 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3329  heat shock protein 90  42.1 
 
 
634 aa  458  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0538  heat shock protein 90  42.11 
 
 
624 aa  457  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.132733  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2263  heat shock protein 90  42.58 
 
 
632 aa  456  1e-127  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1054  heat shock protein 90  42.42 
 
 
630 aa  457  1e-127  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.374422  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>