27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0950 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_0950  sporulation domain-containing protein  100 
 
 
292 aa  561  1.0000000000000001e-159  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0442  Sporulation domain protein  41.03 
 
 
308 aa  67.4  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0903  sporulation domain-containing protein  27.99 
 
 
318 aa  65.5  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.278567  normal  0.0611372 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2481  sporulation domain-containing protein  27.55 
 
 
463 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0175577  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1913  sporulation domain-containing protein  26.14 
 
 
277 aa  61.6  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3123  sporulation domain-containing protein  41.89 
 
 
273 aa  60.5  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.293314  normal  0.174152 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3023  sporulation domain-containing protein  26.06 
 
 
276 aa  58.5  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.150433  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1508  hypothetical protein  37.18 
 
 
342 aa  57.4  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.677673  normal  0.363583 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1908  sporulation related  39.19 
 
 
467 aa  56.2  0.0000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.278011  normal  0.340405 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3063  tetratricopeptide TPR_4  35.64 
 
 
440 aa  55.8  0.0000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1869  sporulation domain-containing protein  40.74 
 
 
389 aa  54.7  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.646599  normal  0.945616 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1806  proline-rich protein  29.35 
 
 
470 aa  54.7  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.321143  normal  0.323939 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3934  sporulation domain-containing protein  41.77 
 
 
264 aa  53.5  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2749  proline-rich region  29.55 
 
 
505 aa  53.1  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.174945  normal  0.312279 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1467  sporulation domain-containing protein  25 
 
 
237 aa  51.6  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0998342  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3588  Sporulation domain protein  24.25 
 
 
474 aa  52  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.903239  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1727  hypothetical protein  27.72 
 
 
314 aa  51.2  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0294059  normal  0.318955 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0577  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  28.57 
 
 
448 aa  48.1  0.0001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0872646  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1681  Sporulation domain protein  32.56 
 
 
1079 aa  48.9  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.393299  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2350  sporulation domain-containing protein  24.79 
 
 
993 aa  47.8  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.17698  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3706  Sporulation domain protein  24.52 
 
 
472 aa  47  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0876978  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2766  sporulation domain-containing protein  35.14 
 
 
458 aa  46.2  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.170586 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1371  peptidase S11, D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase 1  32.88 
 
 
465 aa  45.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0352  peptidase S11 D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase 1  35.44 
 
 
498 aa  43.5  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.23276  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2796  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  34.15 
 
 
558 aa  43.1  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.204271  normal  0.530411 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1139  sporulation related  39.19 
 
 
242 aa  43.1  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2179  Sporulation domain protein  28.21 
 
 
468 aa  43.5  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.89837  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>