37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0364 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_0364  hypothetical protein  100 
 
 		 305 aa  609  1e-173  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.947228  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1209  hypothetical protein  34.92 
 
 		 286 aa  131  2.0000000000000002e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.116621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3624  tol-pal system protein YbgF  25.34 
 
 		 333 aa  71.6  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3493  tol-pal system protein YbgF  24.09 
 
 		 328 aa  64.7  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.250731  normal  0.0902147 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3198  tol-pal system protein YbgF  28.42 
 
 		 329 aa  63.2  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3508  TPR repeat-containing protein  30.57 
 
 		 336 aa  60.5  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.024508  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2625  Tol-Pal system YbgF  32.18 
 
 		 345 aa  58.9  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.610072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0688  hypothetical protein  30.94 
 
 		 309 aa  58.5  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.17746  normal  0.110027 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3636  tol-pal system protein YbgF  31.11 
 
 		 395 aa  58.2  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.655529  normal  0.139464 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3169  tetratricopeptide TPR_2  25.61 
 
 		 334 aa  58.2  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2414  hypothetical protein  27.6 
 
 		 291 aa  57.4  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2124  Tol-Pal system YbgF  32.95 
 
 		 301 aa  57.4  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.186495  normal  0.327311 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1096  hypothetical protein  23.72 
 
 		 279 aa  56.2  0.0000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.2221  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2713  TPR repeat-containing protein  27.92 
 
 		 305 aa  55.8  0.0000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0957329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1637  TPR repeat-containing molluscan rhodopsin  30.25 
 
 		 488 aa  54.7  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1693  hypothetical protein  30.25 
 
 		 488 aa  54.7  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1221  Tol-Pal system YbgF  24.71 
 
 		 505 aa  54.3  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5489  tol-pal system protein YbgF  23.93 
 
 		 304 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.39153  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3081  Tol-Pal system YbgF  27.73 
 
 		 307 aa  54.3  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6876  hypothetical protein  27.82 
 
 		 348 aa  53.1  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.617207  normal  0.0553562 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2363  tetratricopeptide TPR_2  28.99 
 
 		 283 aa  53.5  0.000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.574477 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5388  tol-pal system protein YbgF  30.4 
 
 		 339 aa  53.1  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.986897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5310  tol-pal system protein YbgF  29.6 
 
 		 341 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4842  tol-pal system protein YbgF  29.6 
 
 		 341 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.29028  normal  0.989146 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4747  hypothetical protein  26.97 
 
 		 323 aa  50.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4333  tol-pal system protein YbgF  30.92 
 
 		 329 aa  50.4  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.105755 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1315  tol-pal system protein YbgF  27.78 
 
 		 345 aa  49.7  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1113  Tol-Pal system YbgF  29.79 
 
 		 272 aa  49.3  0.00008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.636864  normal  0.58924 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4143  hypothetical protein  27.07 
 
 		 345 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0281  tol-pal system protein YbgF  28.8 
 
 		 313 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.433103  normal  0.0147653 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0778  tol-pal system protein YbgF  26.62 
 
 		 386 aa  48.1  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0520444 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2320  hypothetical protein  34.23 
 
 		 274 aa  47.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.152947  normal  0.674714 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0667  hypothetical protein  34.23 
 
 		 274 aa  47.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0564  hypothetical protein  34.23 
 
 		 274 aa  47.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.85427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1597  hypothetical protein  23.82 
 
 		 313 aa  46.2  0.0007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.214914 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4425  tol-pal system protein YbgF  30.16 
 
 		 283 aa  44.3  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.667598 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0977  hypothetical protein  25.57 
 
 		 281 aa  43.5  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0268883  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>