More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4536 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_4536  30S ribosomal protein S18  100 
 
 		 123 aa  245  2e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.298082  normal  0.325201 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2379  ribosomal protein S18  56.41 
 
 		 112 aa  102  2e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.5089799999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2608  30S ribosomal protein S18  56.25 
 
 		 110 aa  102  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0113564  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2460  SSU ribosomal protein S18P  62.03 
 
 		 106 aa  101  4e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.168294 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2843  30S ribosomal protein S18  53.12 
 
 		 106 aa  100  8e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000270954  hitchhiker  0.0000000000000931425 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0666  30S ribosomal protein S18  53.76 
 
 		 103 aa  98.2  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0759  30S ribosomal protein S18  51.58 
 
 		 94 aa  97.1  7e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000168995  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1356  ribosomal protein S18  40 
 
 		 113 aa  95.5  2e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2976  30S ribosomal protein S18  62.12 
 
 		 80 aa  95.9  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000357277  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2654  30S ribosomal protein S18  62.12 
 
 		 80 aa  95.9  2e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000144955  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1477  30S ribosomal protein S18  55.95 
 
 		 92 aa  93.6  9e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00897037 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2763  30S ribosomal protein S18  55.95 
 
 		 92 aa  93.6  9e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3677  30S ribosomal protein S18  59.7 
 
 		 91 aa  92  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0799478  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0057  30S ribosomal protein S18  50.57 
 
 		 97 aa  91.7  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000101407  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1338  30S ribosomal protein S18  55.07 
 
 		 76 aa  89.7  1e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0621321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1031  30S ribosomal protein S18  55.07 
 
 		 76 aa  89.7  1e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1641  30S ribosomal protein S18  55.88 
 
 		 75 aa  89  2e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0283547  normal  0.0346788 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2185  30S ribosomal protein S18  56.06 
 
 		 94 aa  89.4  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000547556  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1361  ribosomal protein S18  60 
 
 		 84 aa  88.2  3e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000314469  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1044  30S ribosomal protein S18  49.38 
 
 		 147 aa  87.8  4e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000893397  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2136  ribosomal protein S18  61.9 
 
 		 76 aa  88.2  4e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000146821  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1528  30S ribosomal protein S18  59.7 
 
 		 90 aa  87.4  6e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.602669  normal  0.0304472 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0927  30S ribosomal protein S18  49.38 
 
 		 147 aa  87  8e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000227736  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0075  30S ribosomal protein S18  51.28 
 
 		 96 aa  87  8e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000152962  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0638  30S ribosomal protein S18  56.34 
 
 		 75 aa  87  8e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000000348226  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2095  30S ribosomal protein S18  61.54 
 
 		 92 aa  87  8e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000537782  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_915  ribosomal protein S18  49.38 
 
 		 147 aa  86.7  1e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000043534  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2103  30S ribosomal protein S18  45.16 
 
 		 95 aa  85.9  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.499514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2392  30S ribosomal protein S18  60.66 
 
 		 88 aa  85.5  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000479009  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1676  30S ribosomal protein S18  53.25 
 
 		 89 aa  84.3  4e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000141185  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3421  ribosomal protein S18  52.94 
 
 		 75 aa  84.3  5e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.169339 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3415  30S ribosomal protein S18  53.25 
 
 		 78 aa  84.3  6e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000533335  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1934  ribosomal protein S18  56.52 
 
 		 74 aa  84  6e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.250727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0652  ribosomal protein S18  57.14 
 
 		 81 aa  84  6e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.144122  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3559  30S ribosomal protein S18  57.58 
 
 		 78 aa  84  7e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.842484 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3400  30S ribosomal protein S18  58.46 
 
 		 90 aa  83.6  8e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.612251  normal  0.528873 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3306  30S ribosomal protein S18  57.14 
 
 		 77 aa  83.6  9e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0014501  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0024  ribosomal protein S18  52.31 
 
 		 86 aa  83.6  9e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000175752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0130  30S ribosomal protein S18  55.56 
 
 		 75 aa  83.6  9e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00643171  normal  0.424629 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2928  ribosomal protein S18  57.14 
 
 		 76 aa  83.6  9e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.296568  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5599  30S ribosomal protein S18  55.26 
 
 		 77 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00341857  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5623  30S ribosomal protein S18  55.26 
 
 		 77 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00085236  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2914  SSU ribosomal protein S18P  53.85 
 
 		 74 aa  83.2  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000742104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4012  30S ribosomal protein S18  55.26 
 
 		 77 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.211645  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1998  ribosomal protein S18  56.45 
 
 		 91 aa  83.2  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.471934  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5660  30S ribosomal protein S18  55.26 
 
 		 77 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000002548  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23340  ribosomal protein S18  56.72 
 
 		 70 aa  83.2  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000096386  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5336  30S ribosomal protein S18  55.26 
 
 		 77 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000178788  hitchhiker  0.000000190479 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11540  SSU ribosomal protein S18P  50.77 
 
 		 87 aa  82.8  0.000000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0244306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1788  30S ribosomal protein S18  46.51 
 
 		 91 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.685938  normal  0.111131 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2588  30S ribosomal protein S18  52.17 
 
 		 76 aa  82.4  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.752864 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5325  30S ribosomal protein S18  55.26 
 
 		 77 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0312656  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5153  30S ribosomal protein S18  55.26 
 
 		 77 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000135632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5169  30S ribosomal protein S18  55.26 
 
 		 77 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00278275  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5582  30S ribosomal protein S18  55.26 
 
 		 77 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46232e-17 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5721  30S ribosomal protein S18  55.26 
 
 		 77 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000587708  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5265  30S ribosomal protein S18  55.26 
 
 		 77 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0224612  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4505  ribosomal protein S18  53.85 
 
 		 105 aa  82.8  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.743108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3667  30S ribosomal protein S18  50.7 
 
 		 91 aa  82  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0312817  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9355  30S ribosomal protein S18  56.06 
 
 		 78 aa  81.6  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.792157 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4353  30S ribosomal protein S18  52.38 
 
 		 76 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0584  30S ribosomal protein S18  52.94 
 
 		 74 aa  81.6  0.000000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.501506  hitchhiker  6.40936e-16 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4934  30S ribosomal protein S18  54.1 
 
 		 76 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000030625  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2051  30S ribosomal protein S18  52.17 
 
 		 76 aa  81.3  0.000000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.255921  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1086  30S ribosomal protein S18  53.73 
 
 		 73 aa  81.6  0.000000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000857615  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0924  ribosomal protein S18  50 
 
 		 74 aa  81.6  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.373301  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2823  ribosomal protein S18  51.35 
 
 		 92 aa  81.3  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.408333  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2132  30S ribosomal protein S18  52.17 
 
 		 76 aa  81.3  0.000000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.157171  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0928  30S ribosomal protein S18  53.73 
 
 		 73 aa  81.6  0.000000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0375041  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00745  30S ribosomal protein S18  50.72 
 
 		 76 aa  81.3  0.000000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.613411  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1436  30S ribosomal protein S18  51.47 
 
 		 75 aa  81.3  0.000000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00709518  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2445  ribosomal protein S18  51.35 
 
 		 92 aa  81.3  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0042166 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1549  30S ribosomal protein S18  52.11 
 
 		 75 aa  80.9  0.000000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1434  30S ribosomal protein S18  52.11 
 
 		 75 aa  80.9  0.000000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1781  30S ribosomal protein S18  47.67 
 
 		 91 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.708911  normal  0.881884 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0140  30S ribosomal protein S18  54.17 
 
 		 75 aa  81.3  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1351  30S ribosomal protein S18  54.17 
 
 		 75 aa  81.3  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0404596  normal  0.254507 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0850  SSU ribosomal protein S18P  52.94 
 
 		 81 aa  81.3  0.000000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1809  30S ribosomal protein S18  47.67 
 
 		 91 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.356271  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1773  30S ribosomal protein S18  54.17 
 
 		 75 aa  81.3  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0656  30S ribosomal protein S18  51.47 
 
 		 74 aa  80.9  0.000000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2454  30S ribosomal protein S18  46.51 
 
 		 91 aa  80.5  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0427357  normal  0.323715 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0673  30S ribosomal protein S18  53.85 
 
 		 76 aa  80.9  0.000000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00258481  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0890  30S ribosomal protein S18  54.17 
 
 		 75 aa  80.9  0.000000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0721689  normal  0.483607 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3062  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 75 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.382795  normal  0.211294 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1044  30S ribosomal protein S18  54.17 
 
 		 75 aa  80.5  0.000000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.143453 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2214  ribosomal protein S18  53.97 
 
 		 75 aa  80.5  0.000000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3282  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 75 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0561913  hitchhiker  0.000203056 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0021  ribosomal protein S18  52.31 
 
 		 90 aa  80.1  0.000000000000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00224831  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3791  ribosomal protein S18  50 
 
 		 75 aa  79.7  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00509801  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4811  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 75 aa  79.7  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0274683  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3928  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 75 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3641  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 75 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000922351  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4672  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 75 aa  79.7  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.998059 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1895  30S ribosomal protein S18  46.51 
 
 		 91 aa  79.3  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00156223  hitchhiker  0.0000000574659 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4753  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 75 aa  79.7  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0729519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0517  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 75 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.370813  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0734  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 75 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0213573  hitchhiker  0.0000000101296 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0703  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 75 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000172761  hitchhiker  0.00040257 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0713  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 75 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.348938  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>