67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0112 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_0112  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 487 aa  1004    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0699636 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3715  twin-arginine translocation pathway signal  42.54 
 
 		 550 aa  364  2e-99  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.697054  normal  0.0792167 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5265  amine oxidase  41.92 
 
 		 543 aa  313  4.999999999999999e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0250  hypothetical protein  39.58 
 
 		 562 aa  306  6e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.280339 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1568  twin-arginine translocation pathway signal  34.95 
 
 		 536 aa  304  2.0000000000000002e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4735  amine oxidase  39.66 
 
 		 582 aa  295  2e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4231  amine oxidase  38.32 
 
 		 540 aa  278  2e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.179579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4119  amine oxidase  38.32 
 
 		 540 aa  278  2e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.670379  normal  0.0166866 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4093  twin-arginine translocation pathway signal  37.96 
 
 		 583 aa  275  1.0000000000000001e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.139116 
 
 
-
 
NC_003296  RS04763  hypothetical protein  37.33 
 
 		 540 aa  271  2e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05692  putative transmembrane protein  37.33 
 
 		 540 aa  271  2e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0815  hypothetical protein  36.69 
 
 		 539 aa  259  6e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.198934  normal  0.440167 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5392  hypothetical protein  36.22 
 
 		 539 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4274  hypothetical protein  37.06 
 
 		 539 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.928776  normal  0.0737697 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4801  hypothetical protein  36.86 
 
 		 539 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.717214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4894  hypothetical protein  36.22 
 
 		 539 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3472  hypothetical protein  36.22 
 
 		 539 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3462  hypothetical protein  37.07 
 
 		 556 aa  253  7e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4784  twin-arginine translocation pathway signal  35.44 
 
 		 580 aa  237  4e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.370329  normal  0.538612 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3305  hypothetical protein  35.23 
 
 		 555 aa  228  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0711795  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5074  amine oxidase, flavin-containing protein  25.27 
 
 		 625 aa  67  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0455  amine oxidase  24.91 
 
 		 624 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1544  amine oxidase  23.01 
 
 		 504 aa  58.5  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.268529 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4856  amine oxidase  24.36 
 
 		 619 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.314626  normal  0.125904 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4983  amine oxidase  24 
 
 		 619 aa  53.9  0.000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2225  hypothetical protein  51.79 
 
 		 58 aa  53.9  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.444853  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5032  amine oxidase  24 
 
 		 616 aa  53.9  0.000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0482  amine oxidase  23.81 
 
 		 565 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2308  glycine/D-amino acid oxidases  50 
 
 		 58 aa  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1929  hypothetical protein  50 
 
 		 58 aa  51.2  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1722  hypothetical protein  50 
 
 		 58 aa  51.2  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1656  hypothetical protein  50 
 
 		 58 aa  51.2  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1178  amine oxidase  22.51 
 
 		 454 aa  50.8  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0392628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5286  amine oxidase  23.08 
 
 		 592 aa  50.8  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.456502  normal  0.921895 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0893  amine oxidase  37.33 
 
 		 431 aa  50.8  0.00006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000373233 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3835  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.89 
 
 		 485 aa  48.5  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0705  hypothetical protein  49.06 
 
 		 53 aa  47.8  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2082  amine oxidase  50 
 
 		 382 aa  47.8  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.255698  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4608  FAD dependent oxidoreductase  44.26 
 
 		 556 aa  47.8  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4526  flavin-containing monooxygenase FMO  30.43 
 
 		 526 aa  47.4  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.249427 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0544  amine oxidase  30 
 
 		 525 aa  46.2  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00189501  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40191  amine oxidase  50 
 
 		 468 aa  45.8  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.389508  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1116  hypothetical protein  35 
 
 		 492 aa  45.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.993784 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4724  amine oxidase  47.73 
 
 		 421 aa  45.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.519629  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07290  predicted flavoprotein involved in K+ transport  39.66 
 
 		 447 aa  45.1  0.003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.160769  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0956  amine oxidase  27.38 
 
 		 434 aa  45.1  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.618507  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4019  FAD dependent oxidoreductase  28.99 
 
 		 525 aa  45.1  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.122722  normal  0.797146 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05480  hypothetical protein  22.56 
 
 		 496 aa  44.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0638  hypothetical protein  36.54 
 
 		 426 aa  44.3  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000186691  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0521  hypothetical protein  22.56 
 
 		 496 aa  44.3  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4068  flavin-containing monooxygenase FMO  29.71 
 
 		 529 aa  44.3  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.252567 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0826  flavin-containing monooxygenase FMO  39.66 
 
 		 487 aa  43.9  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.378044 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5033  amine oxidase  25.73 
 
 		 452 aa  43.9  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4945  amine oxidase  25.73 
 
 		 452 aa  43.9  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5326  amine oxidase  25.73 
 
 		 452 aa  43.9  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.778847  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06658  flavin containing polyamine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03510)  40.35 
 
 		 536 aa  43.9  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.182585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5626  flavin-containing monooxygenase FMO  29.71 
 
 		 526 aa  43.5  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0554215  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6151  amine oxidase  41.51 
 
 		 387 aa  43.5  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.275464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0378  FAD dependent oxidoreductase  37.84 
 
 		 422 aa  43.5  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0322129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3694  flavin-containing monooxygenase FMO  29.71 
 
 		 526 aa  43.5  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.920418  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3473  amine oxidase  36.67 
 
 		 516 aa  43.5  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6444  amine oxidase  44.9 
 
 		 387 aa  43.5  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.138786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4674  flavin-containing monooxygenase FMO  29.71 
 
 		 526 aa  43.5  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.727347  normal  0.236948 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1145  flavin-containing monooxygenase FMO  28.99 
 
 		 529 aa  43.5  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.854282  normal  0.14107 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1498  flavin-binding monooxygenase-like protein  35.87 
 
 		 524 aa  43.5  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.967842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1454  twin-arginine translocation pathway signal  34.58 
 
 		 612 aa  43.1  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3301  flavocytochrome c flavin subunit  47.37 
 
 		 499 aa  43.1  0.01  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>