26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4120 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_4120  bacteriophage DNA transposition B protein  100 
 
 
250 aa  501  1e-141  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000206213 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2908  bacteriophage DNA transposition B protein  98.4 
 
 
250 aa  494  1e-139  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00692562  normal  0.135602 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0714  bacteriophage DNA transposition B protein  36.19 
 
 
260 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3753  prophage MuSo1, DNA transposition protein, putative  29.46 
 
 
241 aa  106  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0644  prophage MuSo1, DNA transposition protein, putative  29.29 
 
 
239 aa  97.4  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2069  prophage MuSo1, DNA transposition protein, putative  31.37 
 
 
240 aa  91.3  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00213879  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2116  prophage MuSo1, DNA transposition protein, putative  31.37 
 
 
240 aa  91.3  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0480615  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2381  AAA ATPase family protein  29.61 
 
 
251 aa  84.7  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3351  bacteriophage DNA transposition B protein, putative  29.02 
 
 
234 aa  72.8  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.382717  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2954  prophage MuMc02, transposition protein B  26.36 
 
 
223 aa  69.3  0.00000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1265  bacteriophage DNA transposition B protein, putative  28.44 
 
 
233 aa  65.9  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.01342e-16 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1280  hypothetical protein  24.63 
 
 
260 aa  65.5  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2120  hypothetical protein  24.63 
 
 
260 aa  65.5  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0647  transposase protein B  26.19 
 
 
256 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1989  AAA ATPase  24.39 
 
 
268 aa  54.7  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1895  Uncharacterized ATPase putative transposase  26.06 
 
 
283 aa  53.5  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.292876  normal  0.903317 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3367  transposase protein B  26.7 
 
 
264 aa  52  0.000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0215  XRE family transcriptional regulator  26.37 
 
 
296 aa  48.9  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.046425  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0412  putative phage DNA transposition protein  30.77 
 
 
343 aa  46.6  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00594514  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0269  bacteriophage DNA transposition protein B, putative  27.63 
 
 
307 aa  44.7  0.002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0253  hypothetical protein  30.15 
 
 
301 aa  42.7  0.005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0071  ATP-binding protein  27.46 
 
 
270 aa  42.7  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.721813  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1664  DNA transposition protein (gpB)  27.07 
 
 
324 aa  42.4  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4809  ATPase  29.32 
 
 
460 aa  42.4  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2645  SARP family transcriptional regulator  37.5 
 
 
819 aa  42  0.009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.38915  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2655  prophage MuSo2, DNA transposition protein, putative  25 
 
 
318 aa  42  0.01  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>