More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3631 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_3631  GTP cyclohydrolase  100 
 
 		 267 aa  553  1e-157  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.125261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0808  GTP cyclohydrolase I  88.36 
 
 		 241 aa  432  1e-120  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.780663  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0879  GTP cyclohydrolase  88.36 
 
 		 241 aa  432  1e-120  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.133005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0912  GTP cyclohydrolase I  85.22 
 
 		 240 aa  418  1e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.447351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0869  GTP cyclohydrolase  86.22 
 
 		 240 aa  414  9.999999999999999e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.356902 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1329  GTP cyclohydrolase I  83.84 
 
 		 267 aa  412  1e-114  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.104361  hitchhiker  0.00333374 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5449  GTP cyclohydrolase I  79.67 
 
 		 243 aa  404  1.0000000000000001e-112  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1301  GTP cyclohydrolase I  82.25 
 
 		 242 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.744793  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4119  GTP cyclohydrolase I  79.08 
 
 		 243 aa  404  1.0000000000000001e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1074  GTP cyclohydrolase  76.52 
 
 		 243 aa  391  1e-108  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.149271 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1830  GTP cyclohydrolase I  77.38 
 
 		 250 aa  378  1e-104  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.043372 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3671  GTP cyclohydrolase  69.3 
 
 		 247 aa  344  8.999999999999999e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.773299  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0295  GTP cyclohydrolase I  66.96 
 
 		 262 aa  335  2.9999999999999997e-91  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.711054  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3990  GTP cyclohydrolase I  67.67 
 
 		 241 aa  334  9e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.497334  normal  0.07815 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5834  GTP cyclohydrolase I  62.83 
 
 		 243 aa  305  6e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1027  GTP cyclohydrolase  54.95 
 
 		 248 aa  268  8.999999999999999e-71  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06001  putative GTP cyclohydrolase I  55.5 
 
 		 248 aa  266  2e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14731  GTP cyclohydrolase I  55.5 
 
 		 248 aa  265  5e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0919672 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05621  putative GTP cyclohydrolase I  54.05 
 
 		 246 aa  265  8e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05921  putative GTP cyclohydrolase I  54.05 
 
 		 246 aa  265  8.999999999999999e-70  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18971  GTP cyclohydrolase I  54.5 
 
 		 248 aa  264  1e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0536  GTP cyclohydrolase  54.05 
 
 		 246 aa  263  2e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07841  putative GTP cyclohydrolase I  52.84 
 
 		 257 aa  260  1e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.987944 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0732  GTP cyclohydrolase  56.42 
 
 		 249 aa  259  3e-68  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.128009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1631  GTP cyclohydrolase I  54.59 
 
 		 251 aa  248  5e-65  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6263  GTP cyclohydrolase I  51.38 
 
 		 223 aa  219  3e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1233  GTP cyclohydrolase I  39.33 
 
 		 186 aa  130  2.0000000000000002e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.520451  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0553  GTP cyclohydrolase I  39.47 
 
 		 188 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3354  GTP cyclohydrolase  41.34 
 
 		 219 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11630  GTP cyclohydrolase I  39.13 
 
 		 198 aa  129  7.000000000000001e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0408  GTP cyclohydrolase  39.55 
 
 		 185 aa  127  1.0000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.503604  normal  0.0142935 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0955  GTP cyclohydrolase  38.92 
 
 		 229 aa  125  1e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.14078  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1333  GTP cyclohydrolase I  36.26 
 
 		 227 aa  124  1e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00848552 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0594  GTP cyclohydrolase I  43.56 
 
 		 190 aa  124  1e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2660  GTP cyclohydrolase I  42.44 
 
 		 212 aa  124  2e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00979899  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0314  GTP cyclohydrolase I  40.74 
 
 		 209 aa  123  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.974125  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1014  GTP cyclohydrolase I  41.51 
 
 		 189 aa  123  3e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00675  GTP cyclohydrolase I  35.14 
 
 		 227 aa  122  4e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4743  GTP cyclohydrolase I  41.46 
 
 		 219 aa  122  4e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.449289  hitchhiker  0.000172466 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0055  GTP cyclohydrolase I  31.98 
 
 		 223 aa  122  4e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_987  GTP cyclohydrolase I  39.88 
 
 		 189 aa  122  6e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1204  GTP cyclohydrolase I  40.88 
 
 		 189 aa  122  7e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35640  GTP cyclohydrolase I  41.36 
 
 		 222 aa  122  7e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.289677  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3446  GTP cyclohydrolase I  43.75 
 
 		 194 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0793851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0849  GTP cyclohydrolase I  38.12 
 
 		 220 aa  121  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.989382  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0617  GTP cyclohydrolase I  40.12 
 
 		 206 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0811  GTP cyclohydrolase I  40.12 
 
 		 188 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000676289  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0242  GTP cyclohydrolase I  43.03 
 
 		 206 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.850043 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6827  GTP cyclohydrolase I  38.5 
 
 		 211 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4454  GTP cyclohydrolase I  41.52 
 
 		 209 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.402948 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0468  GTP cyclohydrolase I  34.21 
 
 		 214 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00942975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0121  GTP cyclohydrolase I  41.88 
 
 		 189 aa  120  3e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.952569  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2103  GTP cyclohydrolase I  38.97 
 
 		 200 aa  120  3e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00785  GTP cyclohydrolase I  33 
 
 		 225 aa  119  3.9999999999999996e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4504  GTP cyclohydrolase I  41.1 
 
 		 210 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0043  GTP cyclohydrolase I  39.13 
 
 		 242 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1799  GTP cyclohydrolase I  46.83 
 
 		 198 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.982751  hitchhiker  0.00000626036 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1549  GTP cyclohydrolase I  37.63 
 
 		 292 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0064  GTP cyclohydrolase I  37.63 
 
 		 236 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.262666  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1197  GTP cyclohydrolase I  37.63 
 
 		 292 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.980634  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1480  GTP cyclohydrolase I  37.63 
 
 		 292 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.668242  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0051  GTP cyclohydrolase I  37.63 
 
 		 292 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.974177  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0053  GTP cyclohydrolase I  37.63 
 
 		 292 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5291  GTP cyclohydrolase I  38.95 
 
 		 209 aa  119  6e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.797621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1758  GTP cyclohydrolase I  39.89 
 
 		 187 aa  119  6e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1234  GTP cyclohydrolase I  37.97 
 
 		 189 aa  119  7e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00505478  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2117  GTP cyclohydrolase I  38.27 
 
 		 203 aa  119  7e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0466  GTP cyclohydrolase I  44.38 
 
 		 188 aa  118  7.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1006  GTP cyclohydrolase I  33.51 
 
 		 241 aa  118  9e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.961128  normal  0.53094 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0043  GTP cyclohydrolase I  39.75 
 
 		 258 aa  118  9e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0910  GTP cyclohydrolase I  33.52 
 
 		 218 aa  118  9e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.834078  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2894  GTP cyclohydrolase I  39.51 
 
 		 207 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3132  GTP cyclohydrolase I  39.13 
 
 		 210 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13641  GTP cyclohydrolase I  41.4 
 
 		 202 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012115 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5116  GTP cyclohydrolase I  39.13 
 
 		 211 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.19568  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4769  GTP cyclohydrolase I  36.82 
 
 		 201 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4480  GTP cyclohydrolase I  39.13 
 
 		 211 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5743  GTP cyclohydrolase I  39.13 
 
 		 211 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0917084  normal  0.199786 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4855  GTP cyclohydrolase I  36.82 
 
 		 201 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32080  GTP cyclohydrolase I  41.98 
 
 		 219 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3155  GTP cyclohydrolase I  38.51 
 
 		 209 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5155  GTP cyclohydrolase I  36.87 
 
 		 201 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.780248 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2270  GTP cyclohydrolase I  32.45 
 
 		 223 aa  117  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.759649  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0641  GTP cyclohydrolase  41.21 
 
 		 212 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.104084 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0703  GTP cyclohydrolase I  40.74 
 
 		 200 aa  117  1.9999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.659577 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5014  GTP cyclohydrolase I  38.51 
 
 		 209 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.386359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0205  GTP cyclohydrolase I  40.74 
 
 		 200 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.224052 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4850  GTP cyclohydrolase  40.12 
 
 		 218 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4310  GTP cyclohydrolase I  40 
 
 		 212 aa  116  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.208107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0380  GTP cyclohydrolase I  34.9 
 
 		 219 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000683928 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9174  GTP cyclohydrolase I  40.62 
 
 		 193 aa  116  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2153  GTP cyclohydrolase I  43.83 
 
 		 188 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000314147  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2639  GTP cyclohydrolase I  36.63 
 
 		 211 aa  115  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0530307  normal  0.512289 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2203  GTP cyclohydrolase I  37.27 
 
 		 187 aa  115  5e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000128412  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1435  GTP cyclohydrolase I  37.5 
 
 		 189 aa  115  5e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0775791  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1638  GTP cyclohydrolase I  36.9 
 
 		 189 aa  115  6e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00226958  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0539  GTP cyclohydrolase I  42.59 
 
 		 205 aa  115  6e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.610758  normal  0.222886 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1393  GTP cyclohydrolase I  36.9 
 
 		 189 aa  115  6e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000162982  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1532  GTP cyclohydrolase I  36.9 
 
 		 189 aa  115  6e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0324228  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1674  GTP cyclohydrolase I  36.9 
 
 		 189 aa  115  6e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000600048  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>