More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_0928 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_0928  thiamine-monophosphate kinase  100 
 
 		 340 aa  659    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1047  thiamine-monophosphate kinase  100 
 
 		 340 aa  659    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0061049 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0585  thiamine monophosphate kinase  49.35 
 
 		 320 aa  225  8e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0885  thiamine monophosphate kinase  44.44 
 
 		 323 aa  216  2.9999999999999998e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3087  thiamine monophosphate kinase  44.27 
 
 		 324 aa  211  2e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1903  thiamine monophosphate kinase  48.21 
 
 		 324 aa  210  2e-53  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1843  thiamine monophosphate kinase  48.21 
 
 		 324 aa  210  3e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.523623  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1075  thiamine monophosphate kinase  43.24 
 
 		 327 aa  207  2e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.255519  hitchhiker  0.000417977 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3047  thiamine monophosphate kinase  48.22 
 
 		 325 aa  205  7e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0521  thiamine monophosphate kinase  45.48 
 
 		 326 aa  205  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0460  thiamine monophosphate kinase  45.48 
 
 		 326 aa  205  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0458  thiamine monophosphate kinase  45.48 
 
 		 326 aa  204  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.703911  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0466  thiamine monophosphate kinase  45.48 
 
 		 326 aa  204  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0479  thiamine monophosphate kinase  44.55 
 
 		 325 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01423  thiamine monophosphate kinase  41.83 
 
 		 321 aa  203  4e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.281467  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1188  thiamine monophosphate kinase  46.51 
 
 		 333 aa  202  5e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1316  thiamine-monophosphate kinase  40.92 
 
 		 336 aa  202  6e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0448  thiamine monophosphate kinase  43.87 
 
 		 325 aa  202  7e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3155  thiamine-monophosphate kinase  40.61 
 
 		 323 aa  202  7e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000840757  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3216  thiamine monophosphate kinase  43.87 
 
 		 325 aa  202  7e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000150062 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00365  thiamine monophosphate kinase  43.87 
 
 		 325 aa  202  8e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.532124  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3192  thiamine-monophosphate kinase  43.87 
 
 		 325 aa  202  8e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00369  hypothetical protein  43.87 
 
 		 325 aa  202  8e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.381421  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0338  thiamine monophosphate kinase  43.87 
 
 		 325 aa  202  8e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.859955  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0453  thiamine monophosphate kinase  43.87 
 
 		 325 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1216  thiamine-monophosphate kinase  40.3 
 
 		 323 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000120227  normal  0.180356 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0499  thiamine monophosphate kinase  43.87 
 
 		 325 aa  200  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0556  thiamine monophosphate kinase  45.48 
 
 		 334 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.301311 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3114  thiamine monophosphate kinase  42.41 
 
 		 329 aa  201  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3153  thiamine-monophosphate kinase  40.61 
 
 		 323 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000108532  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3477  thiamine monophosphate kinase  47.4 
 
 		 333 aa  200  3e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.695085  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2478  thiamine monophosphate kinase  47.4 
 
 		 333 aa  200  3e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.152794  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1257  thiamine monophosphate kinase  47.4 
 
 		 333 aa  200  3e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3475  thiamine monophosphate kinase  47.4 
 
 		 333 aa  200  3e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1028  thiamine monophosphate kinase  42.3 
 
 		 326 aa  200  3e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3282  thiamine monophosphate kinase  42.6 
 
 		 326 aa  200  3e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1167  thiamine-monophosphate kinase  40.91 
 
 		 318 aa  200  3e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0557102  normal  0.261644 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3308  thiamine monophosphate kinase  47.4 
 
 		 333 aa  200  3e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3440  thiamine monophosphate kinase  47.4 
 
 		 333 aa  200  3e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.721251  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0397  thiamine monophosphate kinase  47.4 
 
 		 333 aa  200  3e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.100912  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3298  thiamine-monophosphate kinase  40.61 
 
 		 323 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000889615  decreased coverage  0.000117497 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3464  thiamin-monophosphate kinase  42.48 
 
 		 318 aa  199  5e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3400  thiamine monophosphate kinase  45.79 
 
 		 332 aa  199  7e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0357932 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0488  thiamine monophosphate kinase  43.55 
 
 		 325 aa  199  7.999999999999999e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04395  thiamine monophosphate kinase  49.52 
 
 		 365 aa  198  9e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.813953  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3255  thiamine monophosphate kinase  42.77 
 
 		 329 aa  198  9e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.05609  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0832  thiamine-monophosphate kinase  41.25 
 
 		 335 aa  198  9e-50  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000411831  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0927  thiamine-monophosphate kinase  39.87 
 
 		 330 aa  198  1.0000000000000001e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.93501  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2773  thiamine-monophosphate kinase  40.61 
 
 		 323 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00271748  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3166  thiamine monophosphate kinase  42.45 
 
 		 329 aa  198  1.0000000000000001e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1101  thiamine-monophosphate kinase  40.3 
 
 		 318 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00155289  normal  0.489485 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2605  thiamine monophosphate kinase  43.93 
 
 		 331 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.807884  normal  0.0305329 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1101  thiamine-monophosphate kinase  40.3 
 
 		 318 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00285593  normal  0.797182 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3712  thiamine monophosphate kinase  44.61 
 
 		 332 aa  196  3e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.957704  normal  0.0722604 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1167  thiamine-monophosphate kinase  40.2 
 
 		 319 aa  197  3e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00022874  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1387  thiamine-monophosphate kinase  41.83 
 
 		 319 aa  196  6e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0324994  unclonable  0.0000000216996 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0598  thiamine monophosphate kinase  45.06 
 
 		 332 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.516909  normal  0.343428 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0223  thiamine-monophosphate kinase  42.81 
 
 		 339 aa  195  1e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2805  thiamine-monophosphate kinase  43.27 
 
 		 331 aa  194  2e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.707056  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1149  thiamine-monophosphate kinase  40.2 
 
 		 318 aa  194  2e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.017464  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0531  thiamine monophosphate kinase  46.58 
 
 		 332 aa  194  3e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0147  thiamine monophosphate kinase  44.77 
 
 		 332 aa  192  9e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0630  thiamine monophosphate kinase  44.77 
 
 		 332 aa  192  9e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0555  thiamine monophosphate kinase  46.27 
 
 		 344 aa  192  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0895  thiamine-monophosphate kinase  47.52 
 
 		 324 aa  191  1e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0369638  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1021  thiamine-phosphate kinase  39.3 
 
 		 333 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0674633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2755  thiamine monophosphate kinase  45.82 
 
 		 332 aa  189  7e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.281901  normal  0.6872 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1192  thiamine-monophosphate kinase  41.69 
 
 		 323 aa  188  1e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0510899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0432  thiamine-monophosphate kinase  46.06 
 
 		 326 aa  188  1e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0313115  normal  0.821004 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0692  thiamine-monophosphate kinase  41.18 
 
 		 327 aa  187  2e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00384986  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2848  thiamine monophosphate kinase  47.57 
 
 		 326 aa  187  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0604  thiamine monophosphate kinase  37.9 
 
 		 325 aa  187  2e-46  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0648083  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0013  thiamine-monophosphate kinase  44.41 
 
 		 341 aa  186  5e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0581  thiamine-monophosphate kinase  41.88 
 
 		 320 aa  186  5e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.384161  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1576  thiamine-monophosphate kinase  41.88 
 
 		 320 aa  186  5e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000735175  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2768  thiamine monophosphate kinase  45.42 
 
 		 332 aa  186  7e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.086077  normal  0.517414 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2896  thiamine monophosphate kinase  40.29 
 
 		 324 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2241  thiamine-monophosphate kinase  42.56 
 
 		 335 aa  184  1.0000000000000001e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.705808 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0605  thiamine-monophosphate kinase  43.53 
 
 		 324 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.926757  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6802  thiamine-monophosphate kinase  46.46 
 
 		 328 aa  184  3e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.826688 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0619  thiamine-monophosphate kinase  42.95 
 
 		 323 aa  184  3e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  5.18956e-35 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0487  thiamine-monophosphate kinase  44.95 
 
 		 319 aa  183  3e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1533  thiamine-monophosphate kinase  40.51 
 
 		 320 aa  183  4.0000000000000006e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0750268  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1278  thiamine-phosphate kinase  38.39 
 
 		 319 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000168907  unclonable  0.0000000000863796 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2193  thiamine-monophosphate kinase  46.69 
 
 		 317 aa  181  2e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00454297  hitchhiker  0.00000617808 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3740  thiamine-monophosphate kinase  44.59 
 
 		 325 aa  180  2.9999999999999997e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.129038 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1564  thiamine-monophosphate kinase  46.26 
 
 		 315 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.929436  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1653  thiamine-monophosphate kinase  44.06 
 
 		 325 aa  179  7e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0108412  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0380  thiamine-monophosphate kinase  47.4 
 
 		 321 aa  179  7e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.450658  normal  0.175688 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3194  thiamine monophosphate kinase  40 
 
 		 328 aa  179  8e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3213  thiamine-monophosphate kinase  45.52 
 
 		 329 aa  179  8e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.330996  hitchhiker  0.00000000031057 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2602  thiamine-monophosphate kinase  38.48 
 
 		 333 aa  178  1e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0259397  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2915  thiamine-monophosphate kinase  41.37 
 
 		 338 aa  178  2e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0468053  hitchhiker  0.00439314 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0163  thiamine-monophosphate kinase  37.9 
 
 		 338 aa  177  2e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.959025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1040  thiamine-monophosphate kinase  36.5 
 
 		 318 aa  177  3e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000743717  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1856  thiamine monophosphate kinase  38.66 
 
 		 334 aa  177  3e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0710389  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0711  thiamine-monophosphate kinase  46.13 
 
 		 321 aa  176  7e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7541  thiamine-monophosphate kinase  45.49 
 
 		 330 aa  175  8e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.301752  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2604  thiamine monophosphate kinase  45.93 
 
 		 361 aa  176  8e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0796602  normal  0.511018 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3014  thiamine monophosphate kinase  45.6 
 
 		 361 aa  175  9e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.783652 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>