81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_2307 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_2307  cyclase/dehydrase  100 
 
 		 147 aa  300  6.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.812492  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2219  cyclase/dehydrase  97.96 
 
 		 147 aa  294  3e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.16761  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1641  cyclase/dehydrase  97.28 
 
 		 147 aa  292  1e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2170  cyclase/dehydrase  65.54 
 
 		 148 aa  204  2e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.950805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1386  cyclase/dehydrase  32.64 
 
 		 144 aa  70.9  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.339684  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4867  cyclase/dehydrase  32.76 
 
 		 152 aa  58.9  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0585071 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3329  cyclase/dehydrase  30.56 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3112  cyclase/dehydrase  28.57 
 
 		 146 aa  59.3  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1938  hypothetical protein  29.87 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.788927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3547  cyclase/dehydrase  33.81 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.464077 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3233  cyclase/dehydrase  27.59 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00925332  hitchhiker  0.0000878109 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2551  cyclase/dehydrase  30.63 
 
 		 146 aa  55.1  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00422597 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1257  cyclase/dehydrase  30.63 
 
 		 146 aa  55.1  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0922177  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24890  polyketide cyclase / dehydrase family protein  30.97 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.370837  normal  0.466231 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2698  hypothetical protein  27.4 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.707169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2964  cyclase/dehydrase  33.85 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6066  cyclase/dehydrase  25.71 
 
 		 146 aa  51.6  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1678  cyclase/dehydrase  30.63 
 
 		 146 aa  50.8  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.613724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1822  cyclase/dehydrase  31.25 
 
 		 148 aa  50.1  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.292754 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3276  cyclase/dehydrase  30.36 
 
 		 147 aa  49.7  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.253678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0938  cyclase/dehydrase  26.36 
 
 		 160 aa  49.3  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.567828  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2678  Polyketide cyclase/dehydrase  29.82 
 
 		 153 aa  48.9  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.368637  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3373  cyclase/dehydrase  27.93 
 
 		 159 aa  47.4  0.00008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4500  cyclase/dehydrase  26.13 
 
 		 148 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4587  cyclase/dehydrase  26.13 
 
 		 148 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.467747 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4883  cyclase/dehydrase  26.13 
 
 		 148 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0833406 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3902  cyclase/dehydrase  26.14 
 
 		 147 aa  46.2  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0670112 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3508  cyclase/dehydrase  29.57 
 
 		 150 aa  45.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0149064 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3099  hypothetical protein  22.97 
 
 		 158 aa  45.1  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.31721  normal  0.377691 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4884  cyclase/dehydrase  28.21 
 
 		 148 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.130016 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3044  cyclase/dehydrase  28.72 
 
 		 145 aa  45.4  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0955  cyclase/dehydrase  28.1 
 
 		 191 aa  45.1  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1306  cyclase/dehydrase  27.14 
 
 		 145 aa  44.7  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.138672  normal  0.43501 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1457  cyclase/dehydrase  28.71 
 
 		 149 aa  44.7  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2031  cyclase/dehydrase  26.04 
 
 		 145 aa  44.3  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.137857  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1998  cyclase/dehydrase  27.08 
 
 		 145 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.315392  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6079  cyclase/dehydrase  27.08 
 
 		 145 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5073  cyclase/dehydrase  26.45 
 
 		 156 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.053477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4588  cyclase/dehydrase  27.35 
 
 		 148 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.464947 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3008  hypothetical protein  21.62 
 
 		 145 aa  43.1  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00761479  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4456  cyclase/dehydrase  26 
 
 		 202 aa  43.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2698  cyclase/dehydrase  30.77 
 
 		 148 aa  43.5  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0875708  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2437  cyclase/dehydrase  29.29 
 
 		 148 aa  43.5  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3859  hypothetical protein  21.62 
 
 		 158 aa  43.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0524065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4501  cyclase/dehydrase  27.35 
 
 		 148 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2777  hypothetical protein  23.89 
 
 		 145 aa  42.7  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000964625  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2903  hypothetical protein  21.62 
 
 		 145 aa  43.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.247962  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1280  cyclase/dehydrase  24.44 
 
 		 159 aa  43.5  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1703  hypothetical protein  26.04 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.656237  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02471  hypothetical protein  23.89 
 
 		 158 aa  42.7  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.19522  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3100  cyclase/dehydrase  23.91 
 
 		 146 aa  42.4  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0103  cyclase/dehydrase  39.02 
 
 		 148 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.137668 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1056  cyclase/dehydrase  23.89 
 
 		 158 aa  42.7  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.454837  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02507  hypothetical protein  23.89 
 
 		 158 aa  42.7  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.1621  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3630  cyclase/dehydrase  24.74 
 
 		 144 aa  42  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10871  hypothetical protein  26.17 
 
 		 147 aa  42.4  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0253989 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0113  hypothetical protein  39.02 
 
 		 148 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0122  cyclase/dehydrase  39.02 
 
 		 148 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.367353  normal  0.0154258 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1278  cyclase/dehydrase  25.53 
 
 		 145 aa  42.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.775786  normal  0.639124 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1065  hypothetical protein  23.89 
 
 		 158 aa  42.7  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.341298  normal  0.549802 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3174  hypothetical protein  26.87 
 
 		 153 aa  42  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0686  cyclase/dehydrase  21.68 
 
 		 186 aa  42  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.593679 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5308  cyclase/dehydrase  25.53 
 
 		 145 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.225873  normal  0.133474 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1860  cyclase/dehydrase  26.73 
 
 		 145 aa  41.6  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852927  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2434  cyclase/dehydrase  26.04 
 
 		 145 aa  41.6  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.37725  normal  0.141169 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3291  cyclase/dehydrase  32.43 
 
 		 145 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.16801 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2771  hypothetical protein  23.21 
 
 		 158 aa  41.6  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.117856  normal  0.130491 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3342  cyclase/dehydrase  32.43 
 
 		 145 aa  41.2  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.330453  normal  0.30543 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3280  cyclase/dehydrase  32.43 
 
 		 145 aa  41.2  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2050  cyclase/dehydrase superfamily  25 
 
 		 145 aa  41.2  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0938384  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1425  cyclase/dehydrase  30 
 
 		 143 aa  40.8  0.006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2201  hypothetical protein  32.1 
 
 		 151 aa  40.8  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000302172 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43040  hypothetical protein  24.74 
 
 		 144 aa  40.8  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2018  hypothetical protein  26.43 
 
 		 151 aa  40.8  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.45378  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3095  cyclase/dehydrase  26.27 
 
 		 144 aa  40.4  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.848378 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3014  hypothetical protein  24.78 
 
 		 158 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2832  hypothetical protein  24.78 
 
 		 158 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0555762  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2882  hypothetical protein  24.78 
 
 		 158 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.194151 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2902  hypothetical protein  24.78 
 
 		 158 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.51613 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2900  hypothetical protein  24.78 
 
 		 158 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2291  cyclase/dehydrase  25.23 
 
 		 147 aa  40.4  0.009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.784882  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>