40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_0156 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_0156  hypothetical protein  100 
 
 
306 aa  594  1e-169  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0145  hypothetical protein  98.69 
 
 
306 aa  585  1e-166  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.185076  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0138  hypothetical protein  96.73 
 
 
306 aa  573  1.0000000000000001e-163  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.650511  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0142  hypothetical protein  72.94 
 
 
323 aa  434  1e-120  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.253672 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0266  hypothetical protein  28.09 
 
 
263 aa  91.7  2e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1653  hypothetical protein  23.83 
 
 
500 aa  85.9  8e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.189804  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4725  putative Sir2-like transcriptional silencer protein  31.9 
 
 
272 aa  84  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0045977 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2483  putative Sir2-like transcriptional silencer protein  32.03 
 
 
286 aa  83.2  0.000000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000992077  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5775  hypothetical protein  30.93 
 
 
328 aa  80.5  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.314122  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1597  putative Sir2-like transcriptional silencer protein  27.65 
 
 
286 aa  79.3  0.00000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.417903  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0144  Sir2 family NAD-dependent protein deacetylase  30.43 
 
 
275 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.144703  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1037  hypothetical protein  24.34 
 
 
477 aa  65.9  0.0000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.960638  normal  0.0242167 
 
 
-
 
NC_010504  Mrad2831_6511  hypothetical protein  30 
 
 
497 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0373  hypothetical protein  25 
 
 
481 aa  62  0.00000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0167  hypothetical protein  21.37 
 
 
632 aa  60.8  0.00000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.427298  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3361  hypothetical protein  24.78 
 
 
482 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4364  hypothetical protein  25.69 
 
 
484 aa  54.3  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.945805  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0866  hypothetical protein  30.04 
 
 
511 aa  52.8  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0855  hypothetical protein  30.47 
 
 
511 aa  52.8  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.823491  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0849  hypothetical protein  29.91 
 
 
480 aa  52.8  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.338117  n/a   
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4173  hypothetical protein  21.7 
 
 
479 aa  52.4  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0983315  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4438  hypothetical protein  22.69 
 
 
476 aa  51.2  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.35414  normal  0.628211 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1992  hypothetical protein  20.42 
 
 
518 aa  51.6  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3482  hypothetical protein  32.73 
 
 
325 aa  51.2  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5662  hypothetical protein  26.69 
 
 
442 aa  50.4  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.834109  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6364  hypothetical protein  30.42 
 
 
606 aa  49.7  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.038941  normal  0.601528 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3403  hypothetical protein  20.86 
 
 
532 aa  46.2  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00805318  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1324  hypothetical protein  23.21 
 
 
716 aa  45.8  0.0008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.772779 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2550  hypothetical protein  29.1 
 
 
302 aa  45.8  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0605029  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3018  hypothetical protein  27.31 
 
 
441 aa  45.4  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00034439  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2279  hypothetical protein  25.73 
 
 
1160 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00522466 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1168  hypothetical protein  21.88 
 
 
549 aa  44.3  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3820  hypothetical protein  28.11 
 
 
541 aa  44.3  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01367  hypothetical protein  23.72 
 
 
459 aa  44.3  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.667542  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2752  hypothetical protein  25.63 
 
 
1160 aa  43.9  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.923311  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2999  hypothetical protein  25.62 
 
 
1161 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0128545  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3005  hypothetical protein  26.47 
 
 
1160 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.386641  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2750  hypothetical protein  25.21 
 
 
305 aa  43.9  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.595373  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2961  hypothetical protein  26.47 
 
 
1160 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2355  hypothetical protein  24.58 
 
 
534 aa  42.4  0.01  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.750444  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>