81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2220 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_1565  hypothetical protein  45.65 
 
 
1151 aa  819    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.184188  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2031  hypothetical protein  63.17 
 
 
1125 aa  1294    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2220  hypothetical protein  100 
 
 
1120 aa  2184    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0950228  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17240  hypothetical protein  57.54 
 
 
1114 aa  1191    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0273  hypothetical protein  36.79 
 
 
1146 aa  536  1e-150  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.930301  decreased coverage  0.00283769 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3162  putative ATP-binding protein  29.14 
 
 
1124 aa  316  1.9999999999999998e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26370  hypothetical protein  27.83 
 
 
1128 aa  291  5.0000000000000004e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4003  hypothetical protein  29.26 
 
 
1126 aa  289  2e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.417635  normal  0.020693 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03539  putative ATP-binding protein  29.97 
 
 
1143 aa  283  9e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.12714  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3940  putative ATP-binding protein  27.79 
 
 
1154 aa  278  6e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0424  hypothetical protein  26.99 
 
 
1181 aa  275  3e-72  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.924929  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3738  putative ATP-binding protein  27.92 
 
 
1153 aa  273  1e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0868  hypothetical protein  26.05 
 
 
1137 aa  255  4.0000000000000004e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0063  putative ATP-binding protein  25.5 
 
 
1136 aa  251  5e-65  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1172  hypothetical protein  25.73 
 
 
1120 aa  237  8e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.381954  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5159  hypothetical protein  25.49 
 
 
1126 aa  234  7.000000000000001e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.236742  normal  0.119537 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2064  hypothetical protein  28.96 
 
 
1120 aa  230  1e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.203107  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0863  hypothetical protein  25.51 
 
 
1120 aa  228  3e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0880  hypothetical protein  25.51 
 
 
1120 aa  228  3e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0869  hypothetical protein  25.32 
 
 
1118 aa  228  7e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1133  hypothetical protein  26.01 
 
 
1123 aa  189  3e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.802022 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1809  hypothetical protein  24.56 
 
 
1121 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2513  hypothetical protein  26 
 
 
1121 aa  179  2e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.844396  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2294  hypothetical protein  24.35 
 
 
1125 aa  167  6.9999999999999995e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.237724 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0015  conserved hypothetical cytosolic protein  24.37 
 
 
1124 aa  167  8e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1628  conserved hypothetical cytosolic protein  24.64 
 
 
1130 aa  167  1.0000000000000001e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0051  conserved hypothetical cytosolic protein  25.75 
 
 
1140 aa  166  3e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.609156  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03270  hypothetical protein  25.71 
 
 
1045 aa  165  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.000014033  unclonable  1.7381799999999998e-20 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49810  hypothetical protein  25.4 
 
 
979 aa  163  1e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0735  hypothetical protein  23.04 
 
 
1122 aa  159  4e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00640704 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0782  hypothetical protein  23.01 
 
 
1121 aa  158  5.0000000000000005e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0843  hypothetical protein  22.99 
 
 
1125 aa  155  2.9999999999999998e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0516  hypothetical protein  24.09 
 
 
1121 aa  152  3e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.536264 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03620  hypothetical protein  25.11 
 
 
1166 aa  149  3e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.688607 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1444  hypothetical protein  23.68 
 
 
1121 aa  149  4.0000000000000006e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0892  hypothetical protein  22.82 
 
 
1121 aa  146  3e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2280  hypothetical protein  22.44 
 
 
1144 aa  145  4e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2187  hypothetical protein  22.78 
 
 
1143 aa  140  1e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.671764  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3697  hypothetical protein  26.26 
 
 
694 aa  140  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000334148 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1125  conserved hypothetical cytosolic protein  21.72 
 
 
1133 aa  137  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.371233 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0224  hypothetical protein  25.34 
 
 
1133 aa  136  3e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00190066 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22910  hypothetical protein  32.07 
 
 
1118 aa  117  2.0000000000000002e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3696  hypothetical protein  26.61 
 
 
406 aa  68.9  0.0000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000237881 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0741  hypothetical protein  28.64 
 
 
352 aa  66.2  0.000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0875  hypothetical protein  24.7 
 
 
462 aa  58.9  0.0000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2434  hypothetical protein  33.09 
 
 
1159 aa  53.9  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.78848  normal  0.0878063 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0583  SMC domain-containing protein  24.23 
 
 
1109 aa  53.5  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2156  hypothetical protein  33.09 
 
 
1159 aa  53.9  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0795  hypothetical protein  32.28 
 
 
1145 aa  53.1  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.517535 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0670  chromosome segregation ATPase-like protein  22.79 
 
 
1159 aa  51.6  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4398  M protein-like MukB domain-containing protein  21.62 
 
 
1093 aa  50.1  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4582  Sigma 54 interacting domain protein  29.25 
 
 
1228 aa  48.9  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0775  MukB N-terminal domain/M protein repeat protein  23.9 
 
 
1113 aa  48.1  0.0008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0308162 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0490  chromosome segregation ATPases-like  23.62 
 
 
1207 aa  47.8  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2051  cell division protein MukB  39.13 
 
 
1479 aa  47.8  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0962316  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1779  cell division protein MukB  39.13 
 
 
1479 aa  47.8  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2299  cell division protein MukB  39.13 
 
 
1478 aa  48.1  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2655  cell division protein MukB  37.68 
 
 
1485 aa  46.6  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2565  cell division protein MukB  37.68 
 
 
1485 aa  46.6  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2198  cell division protein MukB  37.68 
 
 
1477 aa  47  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1971  cell division protein MukB  37.68 
 
 
1485 aa  46.6  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1027  cell division protein MukB  36.23 
 
 
1488 aa  46.6  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.111328 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1092  cell division protein MukB  36.23 
 
 
1488 aa  47  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.549482 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1059  cell division protein MukB  36.23 
 
 
1484 aa  46.6  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.779782  normal  0.0146679 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1000  cell division protein MukB  36.23 
 
 
1488 aa  46.6  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.102163  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1108  cell division protein MukB  36.23 
 
 
1488 aa  46.6  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2400  cell division protein MukB  36.23 
 
 
1486 aa  46.6  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00928  cell division protein MukB  36.23 
 
 
1486 aa  46.6  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.517636  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2196  cell division protein MukB  36.23 
 
 
1486 aa  46.6  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.548904  normal  0.255095 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2672  cell division protein MukB  36.23 
 
 
1486 aa  46.6  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.610096  normal  0.11245 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1443  cell division protein MukB  36.23 
 
 
1482 aa  46.2  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.573648  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1031  cell division protein MukB  36.23 
 
 
1486 aa  46.6  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.847541  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1085  cell division protein MukB  36.23 
 
 
1486 aa  46.6  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0721824  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00935  hypothetical protein  36.23 
 
 
1486 aa  46.6  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.615336  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1725  cell division protein MukB  37.68 
 
 
1482 aa  46.6  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.819223  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1023  cell division protein MukB  36.23 
 
 
1486 aa  46.6  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000909326  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2719  chromosome segregation and condensation protein MukB domain protein  36.23 
 
 
1486 aa  46.6  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0499442  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0979  MukB N- domain/M protein repeat protein  21.31 
 
 
1107 aa  45.8  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.653871  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2223  hypothetical protein  26.56 
 
 
1138 aa  45.1  0.007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.651164 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0866  cell division protein MukB  34.78 
 
 
1468 aa  44.7  0.009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01589  cell division protein MukB  37.31 
 
 
1489 aa  44.7  0.01  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>