34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_00928 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001637  EcDH1_2719  chromosome segregation and condensation protein MukB domain protein  99.87 
 
 
1486 aa  3017    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0499442  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1779  cell division protein MukB  80.8 
 
 
1479 aa  2389    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2299  cell division protein MukB  81.23 
 
 
1478 aa  2399    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00935  hypothetical protein  100 
 
 
1486 aa  3019    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.615336  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2198  cell division protein MukB  79.97 
 
 
1477 aa  2352    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2051  cell division protein MukB  80.19 
 
 
1479 aa  2382    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0962316  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1085  cell division protein MukB  99.93 
 
 
1486 aa  3018    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0721824  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0727  cell division protein MukB  58.59 
 
 
1490 aa  1730    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.381088  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1059  cell division protein MukB  94.48 
 
 
1484 aa  2786    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.779782  normal  0.0146679 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1000  cell division protein MukB  94.76 
 
 
1488 aa  2804    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.102163  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1108  cell division protein MukB  94.69 
 
 
1488 aa  2801    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1092  cell division protein MukB  94.69 
 
 
1488 aa  2803    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.549482 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1027  cell division protein MukB  94.69 
 
 
1488 aa  2800    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.111328 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00928  cell division protein MukB  100 
 
 
1486 aa  3019    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.517636  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2400  cell division protein MukB  99.73 
 
 
1486 aa  3013    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2196  cell division protein MukB  99.66 
 
 
1486 aa  3011    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.548904  normal  0.255095 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2672  cell division protein MukB  100 
 
 
1486 aa  3019    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.610096  normal  0.11245 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2655  cell division protein MukB  81.03 
 
 
1485 aa  2372    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1971  cell division protein MukB  81.03 
 
 
1485 aa  2372    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1725  cell division protein MukB  80.9 
 
 
1482 aa  2391    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.819223  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1023  cell division protein MukB  99.8 
 
 
1486 aa  3014    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000909326  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1031  cell division protein MukB  99.93 
 
 
1486 aa  3017    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.847541  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01589  cell division protein MukB  59.16 
 
 
1489 aa  1738    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2565  cell division protein MukB  81.1 
 
 
1485 aa  2374    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1317  cell division protein MukB  59.59 
 
 
1491 aa  1750    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1443  cell division protein MukB  91.29 
 
 
1482 aa  2714    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.573648  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0866  cell division protein MukB  63.22 
 
 
1468 aa  1857    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003934  chromosome partition protein MukB  59.01 
 
 
1489 aa  1732    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2097  cell division protein MukB  32.97 
 
 
1517 aa  123  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.99247  normal  0.0125803 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1493  SMC domain protein  26.32 
 
 
1199 aa  66.2  0.000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.326232  hitchhiker  0.0000000327105 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0775  MukB N-terminal domain/M protein repeat protein  26.24 
 
 
1113 aa  59.3  0.0000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0308162 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0979  MukB N- domain/M protein repeat protein  26.5 
 
 
1107 aa  47.4  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.653871  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2220  hypothetical protein  36.23 
 
 
1120 aa  46.6  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0950228  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0490  chromosome segregation ATPases-like  26.58 
 
 
1207 aa  45.4  0.008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>