30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1601 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_1601  DNA binding domain protein, excisionase family  100 
 
 		 128 aa  249  7e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3924  DNA binding domain-containing protein  40 
 
 		 152 aa  57.8  0.00000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4424  excisionase/Xis, DNA-binding  37.97 
 
 		 152 aa  57  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.412812  normal  0.513103 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0848  DNA binding domain protein, excisionase family  35.94 
 
 		 127 aa  55.5  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7903  DNA binding domain protein, excisionase family  36.71 
 
 		 151 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4763  excisionase/Xis, DNA-binding  35.06 
 
 		 158 aa  52  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.180211 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0338  DNA binding domain-containing protein  36.36 
 
 		 153 aa  52  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3752  DNA binding domain protein, excisionase family  35.45 
 
 		 153 aa  51.2  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.152724  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20770  DNA-binding protein, excisionase family  30.77 
 
 		 170 aa  48.9  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3239  putative excisionase protein  33.33 
 
 		 153 aa  48.5  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0263514 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3464  DNA binding domain protein, excisionase family  30.39 
 
 		 157 aa  48.1  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0405  excisionase/Xis, DNA-binding  47.92 
 
 		 63 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.831547 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2344  excisionase/Xis, DNA-binding  38.16 
 
 		 156 aa  45.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000412399  unclonable  0.000000144936 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3385  DNA binding domain-containing protein  30.39 
 
 		 150 aa  46.2  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1265  DNA binding domain-containing protein  38.16 
 
 		 156 aa  45.8  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12334  excisionase  32.31 
 
 		 114 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4162  DNA binding domain-containing protein  40.26 
 
 		 155 aa  44.3  0.0006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0766794  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2639  hypothetical protein  27.45 
 
 		 153 aa  43.1  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.690971  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0072  DNA binding domain protein, excisionase family  46 
 
 		 141 aa  43.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04840  DNA-binding protein, excisionase family  29.41 
 
 		 157 aa  43.5  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.287147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13782  excisionase  31.93 
 
 		 130 aa  42.7  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.696326 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3978  DNA binding domain-containing protein  41.38 
 
 		 158 aa  41.6  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.27938 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3279  DNA binding domain-containing protein  31.94 
 
 		 149 aa  41.6  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.746198  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1031  excisionase/Xis, DNA-binding  43.75 
 
 		 64 aa  41.6  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.126715 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1635  DNA binding domain protein, excisionase family  31.25 
 
 		 184 aa  41.6  0.004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2993  DNA binding domain protein, excisionase family  37.68 
 
 		 180 aa  41.2  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5538  DNA binding domain-containing protein  43.75 
 
 		 64 aa  41.2  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4630  DNA binding domain-containing protein  34.85 
 
 		 109 aa  40.8  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6306  DNA binding domain-containing protein  41.67 
 
 		 64 aa  40.4  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0047  DNA binding domain, excisionase family  41.67 
 
 		 136 aa  40.4  0.008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.509276  normal  0.343664 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>