18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0067 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_0067  Endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 244 aa  493  9.999999999999999e-139  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3200  Endoribonuclease L-PSP  56.32 
 
 		 215 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0172022  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0084  Endoribonuclease L-PSP  54.86 
 
 		 237 aa  171  1e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0611865 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0861  endoribonuclease L-PSP  40.71 
 
 		 164 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.37845 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0810  endoribonuclease L-PSP  33.63 
 
 		 166 aa  65.9  0.0000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02286  TdcF  36.28 
 
 		 155 aa  60.8  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1381  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 165 aa  57.8  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.63415  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3006  deaminase AmnE, putative  30.47 
 
 		 144 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0930395  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2887  endoribonuclease L-PSP  30.6 
 
 		 144 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00911045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2630  endoribonuclease L-PSP  34.55 
 
 		 171 aa  52.4  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0702  Endoribonuclease L-PSP  30.91 
 
 		 168 aa  52.8  0.000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0416  endoribonuclease L-PSP  41.1 
 
 		 143 aa  47.8  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0920711 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1722  endoribonuclease L-PSP  27.83 
 
 		 170 aa  47.8  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6185  endoribonuclease L-PSP  39.8 
 
 		 149 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.89906  normal  0.555721 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4796  hypothetical protein  38.46 
 
 		 116 aa  42.7  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.511592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0655  YjgF-like protein  37.5 
 
 		 130 aa  42.7  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3210  endoribonuclease L-PSP  29.33 
 
 		 127 aa  42.7  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000188329  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0935  YjgF-like protein  37.5 
 
 		 130 aa  42  0.009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>