More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4734 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_4734  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
294 aa  596  1e-169  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3344  glycosyl transferase family protein  35.64 
 
 
274 aa  145  8.000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.27907 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0077  glycosyl transferase family protein  36.86 
 
 
287 aa  124  2e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0503  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
290 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0779995  normal  0.962073 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4004  glycosyl transferase family protein  37.02 
 
 
327 aa  108  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.978778 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4373  glycosyl transferase family 2  37.2 
 
 
327 aa  105  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.438048  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1273  glycosyl transferase family protein  32.13 
 
 
307 aa  104  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4485  glycosyl transferase family 2  38.28 
 
 
294 aa  102  6e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0538155  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4314  glycosyl transferase family protein  28.35 
 
 
401 aa  94  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5877  glycosyl transferase family protein  30.59 
 
 
303 aa  92.8  6e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.191547  normal  0.690247 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3358  glycosyl transferase family protein  28.44 
 
 
294 aa  89  8e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3990  glycosyl transferase family protein  31.44 
 
 
304 aa  89.4  8e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.965976 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4485  glycosyl transferase family 2  31.31 
 
 
312 aa  88.6  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.874808  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6543  glycosyl transferase family protein  32.13 
 
 
329 aa  88.2  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5349  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
314 aa  87.8  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1579  glycosyl transferase family protein  35.59 
 
 
318 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.35814 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0820  glycosyl transferase family protein  31.1 
 
 
308 aa  87.4  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.516631  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0759  glycosyl transferase family protein  31.25 
 
 
340 aa  87  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0160185 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4524  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
308 aa  86.3  5e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.500037  normal  0.110607 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0619  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.05 
 
 
311 aa  86.3  5e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773869  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2729  glycosyl transferase family protein  33.99 
 
 
298 aa  86.3  6e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0842  hypothetical protein  25.64 
 
 
297 aa  85.5  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0628  glycosyl transferase family protein  28.02 
 
 
306 aa  84.7  0.000000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.154474 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2683  glycosyl transferase family 2  28.81 
 
 
361 aa  84.3  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.624324  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0736  glycosyl transferase family protein  32.22 
 
 
326 aa  84.3  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.59773 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4318  glycosyl transferase family 2  29.93 
 
 
310 aa  84.3  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.592459  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0353  glycosyl transferase family 2  33.2 
 
 
317 aa  84  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3199  glycosyl transferase family protein  28.85 
 
 
312 aa  83.6  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.593989  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4940  glycosyl transferase family protein  33.49 
 
 
336 aa  83.6  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.860283 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4265  glycosyl transferase family protein  28.82 
 
 
312 aa  82.8  0.000000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4474  glycosyl transferase family 2  25.21 
 
 
290 aa  82.8  0.000000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2407  glycosyl transferase family protein  31.52 
 
 
312 aa  82.4  0.000000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.116461  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3624  glycosyl transferase family 2  31.77 
 
 
319 aa  82.4  0.000000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.519026 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2391  glycosyl transferase family protein  33.7 
 
 
282 aa  82  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.337746  normal  0.474802 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2884  glycosyl transferase family protein  26.92 
 
 
305 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.379417  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2016  glycosyl transferase family protein  30.13 
 
 
322 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.12313  normal  0.993196 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3501  glycosyl transferase family 2  31.42 
 
 
310 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.222757  normal  0.064344 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2305  glycosyl transferase family 2  31.94 
 
 
291 aa  80.5  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.064621 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3301  glycosyl transferase family protein  29.63 
 
 
319 aa  80.1  0.00000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.904037  normal  0.657687 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0054  glycosyl transferase family 2  30.7 
 
 
557 aa  79.7  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0817  hypothetical protein  25.43 
 
 
297 aa  79.7  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1576  glycosyl transferase family protein  30.04 
 
 
313 aa  79.7  0.00000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.169867 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2355  glycosyltransferase  29.49 
 
 
320 aa  79.7  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0757  glycosyl transferase family protein  33.64 
 
 
358 aa  79  0.00000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.11098 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4788  glycosyl transferase family protein  32.25 
 
 
315 aa  79  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1368  glycosyl transferase family protein  28.23 
 
 
324 aa  78.2  0.0000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.537191  normal  0.711331 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0123  glycosyl transferase family protein  23.44 
 
 
346 aa  77.8  0.0000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000000010329 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2934  glycosyl transferase family 2  31.98 
 
 
378 aa  77.8  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.607022  normal  0.174721 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3374  glycosyl transferase family 2  30.15 
 
 
1435 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4143  glycosyl transferase family 2  31.1 
 
 
345 aa  77  0.0000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000205364 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0787  glycosyl transferase family 2  29.68 
 
 
353 aa  77  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.163096  normal  0.605145 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0256  glycosyl transferase family 2  29.55 
 
 
279 aa  77  0.0000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0754  glycosyl transferase family 2  35.58 
 
 
691 aa  76.3  0.0000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.235056 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1912  glycosyl transferase family protein  29.66 
 
 
329 aa  75.9  0.0000000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4741  glycosyl transferase family protein  25.86 
 
 
308 aa  75.5  0.0000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3226  glycosyl transferase family protein  29.25 
 
 
317 aa  75.5  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1298  glycosyl transferase family protein  27.34 
 
 
289 aa  75.5  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3821  glycosyl transferase family 2  29.15 
 
 
1739 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5097  glycosyl transferase family protein  28.9 
 
 
340 aa  74.7  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.912612  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1388  glycosyl transferase family protein  28.51 
 
 
324 aa  74.7  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4145  glycosyl transferase family protein  28.4 
 
 
334 aa  73.9  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.417391 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1249  glycosyl transferase  31.88 
 
 
275 aa  73.6  0.000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2365  glycosyl transferase family 2  29.96 
 
 
836 aa  73.9  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00674972 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2441  glycosyl transferase family protein  28.7 
 
 
290 aa  73.9  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1348  glycosyl transferase family protein  27.39 
 
 
311 aa  73.6  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0831  glycosyl transferase family protein  36.46 
 
 
691 aa  73.2  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.74925  normal  0.236177 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1219  glycosyl transferase family protein  32.31 
 
 
275 aa  73.6  0.000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.428258  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0884  glycosyl transferase family protein  30.04 
 
 
281 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2344  glycosyl transferase family 2  30.5 
 
 
301 aa  73.2  0.000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.415521  hitchhiker  0.0000247035 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0578  glycosyl transferase family protein  28.89 
 
 
525 aa  73.2  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  28 
 
 
1340 aa  72.8  0.000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0405  glycosyl transferase family protein  31.39 
 
 
268 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1316  glycosyl transferase  26 
 
 
358 aa  72.8  0.000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.255761  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0791  glycosyl transferase family 2  35.94 
 
 
691 aa  72.4  0.000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.62869  normal  0.0614605 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2168  glycosyl transferase family protein  28.12 
 
 
360 aa  72.4  0.000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07585  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.24 
 
 
379 aa  72.4  0.000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.547919  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0023  glycosyl transferase family 2  26.03 
 
 
703 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4181  glycosyl transferase family 2  28.8 
 
 
297 aa  72  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.208224  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0463  glycosyl transferase family protein  23.02 
 
 
293 aa  71.6  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.580187 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  28.77 
 
 
2401 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4605  glycosyl transferase family protein  25.56 
 
 
318 aa  71.2  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.151832  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1435  glycosyl transferase family protein  28.24 
 
 
324 aa  70.9  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0566  glycosyltransferase-like  30.23 
 
 
327 aa  70.9  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.418965  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3033  glycosyl transferase family protein  25.85 
 
 
308 aa  71.2  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.244321  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02692  glycosyl transferase  29.46 
 
 
279 aa  70.5  0.00000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1063  glycosyl transferase family 2  28.4 
 
 
305 aa  69.7  0.00000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.862808  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02870  hypothetical protein  26.17 
 
 
286 aa  69.7  0.00000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4989  glycosyl transferase family protein  25.1 
 
 
387 aa  69.7  0.00000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0169  glycosyl transferase  28.57 
 
 
291 aa  69.3  0.00000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.571999 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2722  glycosyl transferase family protein  28.24 
 
 
278 aa  69.3  0.00000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2593  glycosyl transferase family protein  24.68 
 
 
333 aa  69.3  0.00000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0657  glycosyl transferase family 2  29.39 
 
 
307 aa  68.9  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13294  dTDP-RHA:A-D-GlcNAc-diphosphoryl polyprenol-A-3-L-rhamnosyl transferase wbbL1  28.63 
 
 
301 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.621621 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1044  b-glycosyltransferase  24.69 
 
 
652 aa  68.2  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00623044  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0854  glycosyl transferase family protein  30.04 
 
 
281 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0840  hypothetical protein  23.67 
 
 
296 aa  67.8  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1356  glycosyl transferase family protein  28.63 
 
 
296 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00877043  normal  0.475844 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3032  glycosyl transferase family protein  26.59 
 
 
714 aa  67.8  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1320  glycosyl transferase family protein  28.63 
 
 
296 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0801  glycosyl transferase family 2  23.41 
 
 
313 aa  67.8  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>