More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1004 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_1004  aminodeoxychorismate lyase  100 
 
 		 320 aa  639    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3387  aminodeoxychorismate lyase  75.08 
 
 		 329 aa  489  1e-137  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.107935  normal  0.0743499 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1988  aminodeoxychorismate lyase  74.07 
 
 		 345 aa  483  1e-135  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1716  aminodeoxychorismate lyase  74.38 
 
 		 333 aa  484  1e-135  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.998027  normal  0.24374 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3413  aminodeoxychorismate lyase  72.31 
 
 		 334 aa  463  1e-129  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2254  aminodeoxychorismate lyase  67.6 
 
 		 323 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2520  aminodeoxychorismate lyase  67.52 
 
 		 325 aa  436  1e-121  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0480566  hitchhiker  0.003327 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2859  aminodeoxychorismate lyase  69.28 
 
 		 340 aa  431  1e-120  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1861  hypothetical protein  64.63 
 
 		 337 aa  419  1e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0824281 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1947  aminodeoxychorismate lyase  67.4 
 
 		 335 aa  412  1e-114  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.817857 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1877  aminodeoxychorismate lyase  66.45 
 
 		 328 aa  403  1e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.10744 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1467  aminodeoxychorismate lyase  51.26 
 
 		 332 aa  342  4e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0630531  normal  0.0141986 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1426  aminodeoxychorismate lyase  51.13 
 
 		 332 aa  335  5.999999999999999e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.219736  normal  0.242343 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1829  aminodeoxychorismate lyase  52.48 
 
 		 332 aa  330  1e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.021454  normal  0.121238 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1783  hypothetical protein  51.94 
 
 		 377 aa  330  2e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0308564  normal  0.608544 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2198  aminodeoxychorismate lyase  52.81 
 
 		 331 aa  325  9e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.955684 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1433  aminodeoxychorismate lyase  53.47 
 
 		 331 aa  322  7e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1501  aminodeoxychorismate lyase  50 
 
 		 334 aa  312  3.9999999999999997e-84  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00653214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1077  aminodeoxychorismate lyase  51.2 
 
 		 315 aa  308  8e-83  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.578473  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1831  aminodeoxychorismate lyase  49.68 
 
 		 339 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5194  aminodeoxychorismate lyase  49.36 
 
 		 339 aa  301  7.000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.374187 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1803  aminodeoxychorismate lyase  49.36 
 
 		 339 aa  301  1e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0606768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2153  hypothetical protein  49.52 
 
 		 339 aa  301  1e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.692536  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2504  aminodeoxychorismate lyase  54.9 
 
 		 337 aa  301  1e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.917927  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1190  putative lipoprotein  49.84 
 
 		 339 aa  300  2e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2282  putative lipoprotein  49.84 
 
 		 339 aa  300  2e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3387  putative lipoprotein  49.84 
 
 		 339 aa  300  2e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1426  putative lipoprotein  49.84 
 
 		 339 aa  300  2e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.425496  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2444  hypothetical protein  49.84 
 
 		 339 aa  300  2e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.700087  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2321  putative lipoprotein  49.84 
 
 		 339 aa  300  2e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1917  hypothetical protein  49.84 
 
 		 339 aa  300  2e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1380  aminodeoxychorismate lyase  49.04 
 
 		 339 aa  299  5e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1042  aminodeoxychorismate lyase  47.59 
 
 		 336 aa  296  3e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0148163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1917  aminodeoxychorismate lyase  48.4 
 
 		 339 aa  295  8e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.136892 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6185  aminodeoxychorismate lyase  48.4 
 
 		 339 aa  295  1e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1894  aminodeoxychorismate lyase  48.4 
 
 		 339 aa  295  1e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.474153  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1938  aminodeoxychorismate lyase  45.48 
 
 		 345 aa  290  2e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.110627  normal  0.289211 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02713  hypothetical protein  54.7 
 
 		 357 aa  290  2e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.117678  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2264  hypothetical protein  46.3 
 
 		 345 aa  288  9e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.188751  normal  0.305668 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1544  aminodeoxychorismate lyase  48.2 
 
 		 333 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0483176  normal  0.0781021 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3828  hypothetical protein  47.76 
 
 		 379 aa  280  2e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0420652  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1651  hypothetical protein  47.76 
 
 		 371 aa  279  6e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.245799  normal  0.342253 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1661  aminodeoxychorismate lyase  46.36 
 
 		 341 aa  275  6e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.148869  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14960  hypothetical protein  48.68 
 
 		 358 aa  275  7e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1529  aminodeoxychorismate lyase  46.84 
 
 		 387 aa  275  9e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.538963 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25730  hypothetical protein  47.44 
 
 		 349 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0867332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1494  aminodeoxychorismate lyase  45.57 
 
 		 400 aa  270  2e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4153  aminodeoxychorismate lyase  47.02 
 
 		 393 aa  269  5e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.507493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1863  aminodeoxychorismate lyase  43.12 
 
 		 356 aa  268  8.999999999999999e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.322444  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1918  aminodeoxychorismate lyase  44.94 
 
 		 421 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.204138  unclonable  0.000000331509 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3796  aminodeoxychorismate lyase  44.62 
 
 		 406 aa  267  2e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.77523  normal  0.494507 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1584  aminodeoxychorismate lyase  48.51 
 
 		 364 aa  267  2e-70  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0339039  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2198  hypothetical protein  46.79 
 
 		 349 aa  267  2e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.850653  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1641  hypothetical protein  48.51 
 
 		 350 aa  266  2.9999999999999995e-70  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.667934  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1417  aminodeoxychorismate lyase  46.05 
 
 		 338 aa  264  1e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.626218  normal  0.75601 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1632  aminodeoxychorismate lyase  48.78 
 
 		 351 aa  260  2e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0005  aminodeoxychorismate lyase  45.34 
 
 		 327 aa  258  7e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000992333  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1578  hypothetical protein  40.33 
 
 		 343 aa  258  1e-67  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00227984  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1605  aminodeoxychorismate lyase  51.61 
 
 		 339 aa  256  3e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0288124  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0607  hypothetical protein  40.07 
 
 		 370 aa  255  7e-67  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000669467  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1633  hypothetical protein  43.25 
 
 		 355 aa  254  1.0000000000000001e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0876  aminodeoxychorismate lyase  56 
 
 		 353 aa  254  2.0000000000000002e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1891  aminodeoxychorismate lyase  46.74 
 
 		 345 aa  252  6e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.253385  normal  0.0515475 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2044  hypothetical protein  46.78 
 
 		 324 aa  252  6e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.47923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2453  aminodeoxychorismate lyase  46.76 
 
 		 345 aa  251  1e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0182667  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2573  aminodeoxychorismate lyase  46.76 
 
 		 345 aa  251  1e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0650379  normal  0.0398652 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2460  aminodeoxychorismate lyase  46.76 
 
 		 345 aa  251  1e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00717262  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1830  aminodeoxychorismate lyase  46.71 
 
 		 342 aa  249  5e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1578  aminodeoxychorismate lyase  40.62 
 
 		 335 aa  249  5e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.853067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0967  aminodeoxychorismate lyase  42.61 
 
 		 357 aa  249  6e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.829028  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2649  aminodeoxychorismate lyase  43.08 
 
 		 335 aa  248  1e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.108193 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1997  hypothetical protein  47.92 
 
 		 331 aa  246  3e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2215  aminodeoxychorismate lyase  44.33 
 
 		 345 aa  246  3e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2614  hypothetical protein  45.76 
 
 		 336 aa  246  4e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1660  aminodeoxychorismate lyase  45.79 
 
 		 336 aa  246  4e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.132451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1735  aminodeoxychorismate lyase  45.79 
 
 		 336 aa  246  4e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.163239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0882  aminodeoxychorismate lyase  41.67 
 
 		 357 aa  245  6e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.871937 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1919  aminodeoxychorismate lyase  43.63 
 
 		 363 aa  242  5e-63  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.402452  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1765  aminodeoxychorismate lyase  45.45 
 
 		 336 aa  242  6e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0979727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1922  aminodeoxychorismate lyase  42.59 
 
 		 335 aa  239  5e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1603  hypothetical protein  46.48 
 
 		 338 aa  239  5.999999999999999e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0141578  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2244  aminodeoxychorismate lyase  40.25 
 
 		 336 aa  234  2.0000000000000002e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00467758  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2118  aminodeoxychorismate lyase  42.42 
 
 		 312 aa  231  1e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0134865  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0717  aminodeoxychorismate lyase  41.06 
 
 		 335 aa  229  4e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.16974  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2241  aminodeoxychorismate lyase  39.62 
 
 		 337 aa  229  4e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1910  aminodeoxychorismate lyase  45.28 
 
 		 341 aa  229  6e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000953369  decreased coverage  0.000000738863 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02331  hypothetical protein  42.95 
 
 		 316 aa  227  2e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003000  hypothetical protein  40.46 
 
 		 338 aa  226  5.0000000000000005e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0577137  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1488  hypothetical protein  37.84 
 
 		 346 aa  222  4.9999999999999996e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0806646  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1254  aminodeoxychorismate lyase  42.68 
 
 		 345 aa  221  9.999999999999999e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.874489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2268  aminodeoxychorismate lyase  38.1 
 
 		 343 aa  221  9.999999999999999e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.642  normal  0.198206 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2301  hypothetical protein  41.18 
 
 		 337 aa  219  3e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.142743  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1690  aminodeoxychorismate lyase  43.02 
 
 		 341 aa  219  5e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0437285  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2803  aminodeoxychorismate lyase  44.32 
 
 		 339 aa  219  6e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0153211  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1093  aminodeoxychorismate lyase  36.36 
 
 		 332 aa  219  6e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.72202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1582  hypothetical protein  42.86 
 
 		 341 aa  218  7e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000314961  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3494  hypothetical protein  43.02 
 
 		 363 aa  218  7.999999999999999e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000556203  normal  0.010619 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1981  aminodeoxychorismate lyase  40.67 
 
 		 335 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0643733  hitchhiker  0.0054614 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02904  hypothetical protein  43.2 
 
 		 338 aa  215  8e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2052  aminodeoxychorismate lyase  41.16 
 
 		 492 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>