175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1223 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1223  Abortive infection protein  100 
 
 		 267 aa  528  1e-149  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3402  hypothetical protein  40.18 
 
 		 285 aa  137  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.408398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2823  Abortive infection protein  35.37 
 
 		 297 aa  86.7  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21970  Abortive infection protein  35.94 
 
 		 264 aa  75.5  0.0000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5134  Abortive infection protein  35.2 
 
 		 280 aa  73.9  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0659  abortive infection protein  32.17 
 
 		 328 aa  72.8  0.000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0275  CAAX amino terminal protease family protein  40 
 
 		 221 aa  68.6  0.0000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000182048  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3587  Abortive infection protein  40.96 
 
 		 527 aa  64.7  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2519  Abortive infection protein  40.96 
 
 		 527 aa  64.7  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0603  CAAX amino terminal protease family protein  23.76 
 
 		 228 aa  62.8  0.000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0547  CAAX amino terminal protease family protein  23.76 
 
 		 228 aa  62.8  0.000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0636  CAAX amino terminal protease family protein  23.76 
 
 		 228 aa  62.8  0.000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0692  CAAX amino terminal protease family protein  25 
 
 		 228 aa  62.8  0.000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15071  predicted protein  36.63 
 
 		 237 aa  62.8  0.000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00688834  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1562  Abortive infection protein  41.03 
 
 		 269 aa  62  0.000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000889795  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1546  abortive infection protein  39.39 
 
 		 528 aa  62  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0304049 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5109  CAAX amino terminal protease family protein  36.05 
 
 		 237 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0549  abortive infection protein  25.14 
 
 		 228 aa  61.2  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5138  CAAX amino terminal protease family protein  36.05 
 
 		 288 aa  59.7  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.450282  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4872  CAAX amino terminal protease family protein  34.88 
 
 		 237 aa  59.7  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.499813  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1317  Abortive infection protein  40 
 
 		 251 aa  59.7  0.00000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.254651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4829  abortive infection protein  34.48 
 
 		 237 aa  59.7  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5243  CAAX amino terminal protease family protein  34.88 
 
 		 227 aa  59.3  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.325917  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1605  Abortive infection protein  39.53 
 
 		 253 aa  59.3  0.00000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0547  CAAX amino terminal protease family protein  30.95 
 
 		 228 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3016  Abortive infection protein  42.68 
 
 		 527 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0998  CAAX amino terminal protease family protein  32.69 
 
 		 267 aa  58.5  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00140172  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3388  Abortive infection protein  37.66 
 
 		 227 aa  58.5  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000121988  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1815  abortive infection protein  42.67 
 
 		 515 aa  58.5  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.308714  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0484  hypothetical protein  39.53 
 
 		 480 aa  57.4  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0842949 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2176  abortive infection protein  31.48 
 
 		 292 aa  57.4  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.184478  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44438  predicted protein  33.83 
 
 		 458 aa  57  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.426284  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4460  CAAX amino terminal protease family protein  32.94 
 
 		 236 aa  57.4  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000581148  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4808  caax amino terminal protease family protein  32.94 
 
 		 236 aa  57.4  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000012688  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1507  Abortive infection protein  39.24 
 
 		 538 aa  57  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.950737 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4679  CAAX amino terminal protease family protein  32.94 
 
 		 236 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.13068e-37 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2182  abortive infection protein  42.68 
 
 		 511 aa  57  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0783395  normal  0.165286 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0580  Abortive infection protein  28.3 
 
 		 269 aa  56.6  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0255  Abortive infection protein  30.28 
 
 		 176 aa  56.6  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1232  CAAX amino terminal protease family protein  37.86 
 
 		 333 aa  56.2  0.0000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000020685 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4691  caax amino protease family  34.94 
 
 		 237 aa  55.8  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000795841  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4298  CAAX amino protease  34.94 
 
 		 237 aa  55.8  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4308  CAAX amino terminal protease family protein  33.64 
 
 		 241 aa  55.8  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0534572  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4680  caax amino protease family protein  33.96 
 
 		 268 aa  55.5  0.0000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.24966e-38 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2113  abortive infection family protein  34 
 
 		 255 aa  55.1  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00391634  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4693  CAAX amino terminal protease family protein  31.71 
 
 		 237 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000019786  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4461  CAAX amino terminal protease family protein  33.96 
 
 		 242 aa  55.5  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000426946  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4809  caax amino terminal protease family protein  33.96 
 
 		 242 aa  55.5  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00449457  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0234  CAAX amino terminal protease family protein  33.33 
 
 		 256 aa  54.3  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0603061  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4396  abortive infection protein  31.71 
 
 		 237 aa  54.3  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000195861  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5028  CAAX amino terminal protease family protein  31.18 
 
 		 249 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000029132  normal  0.883864 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1276  AbrB family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 337 aa  53.9  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00251818  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1248  CAAX amino terminal protease family protein  30.1 
 
 		 337 aa  53.9  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000143698  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1730  Abortive infection protein  36.67 
 
 		 237 aa  53.9  0.000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5895  Abortive infection protein  36.59 
 
 		 319 aa  53.9  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1378  AbrB family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 337 aa  53.9  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0239799  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0164  abortive infection protein  30.95 
 
 		 234 aa  53.5  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0244  abortive infection protein  32.26 
 
 		 249 aa  53.5  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000696395  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4694  CAAX amino terminal protease family protein  38.46 
 
 		 224 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000569642  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1250  CAAX amino terminal protease family protein  30.1 
 
 		 337 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0262898  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0591  Abortive infection protein  29.17 
 
 		 287 aa  53.5  0.000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0296  CAAX amino terminal protease family protein  31.18 
 
 		 249 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00879326  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1450  transcriptional regulator, AbrB family  30.1 
 
 		 337 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0536732 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1896  abortive infection protein  40.23 
 
 		 260 aa  53.1  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.692997  normal  0.154839 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1412  transcriptional regulator, AbrB family  29.13 
 
 		 313 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1283  abortive infection protein  29.66 
 
 		 337 aa  53.5  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00310248  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0265  CAAX amino terminal protease family protein  30.49 
 
 		 235 aa  52.8  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000459802  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1107  putative metal-dependent membrane protease  35.8 
 
 		 340 aa  52.8  0.000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.402277  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1477  AbrB family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 337 aa  52.8  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3931  transcriptional regulator, AbrB family  29.13 
 
 		 313 aa  52.8  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1219  CAAX amino terminal protease family protein  32.56 
 
 		 284 aa  52.4  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.991913  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0237  CAAX amino protease  30.49 
 
 		 253 aa  52.4  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.4387099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1082  abortive infection protein  30.86 
 
 		 346 aa  52.4  0.000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0315  CAAX amino terminal protease family protein  30.49 
 
 		 249 aa  52.4  0.000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000181046  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0287  CAAX amino terminal protease family protein  30.49 
 
 		 249 aa  52.4  0.000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00895177  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0251  CAAX amino terminal protease family protein  30.49 
 
 		 249 aa  52.4  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000928453  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0238  CAAX amino protease  30.49 
 
 		 249 aa  52.4  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000450498  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0291  CAAX amino terminal protease family protein  30.49 
 
 		 249 aa  52.4  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0518  hypothetical protein  32.74 
 
 		 241 aa  52  0.000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.13521 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1041  CAAX amino terminal protease family protein  32.56 
 
 		 284 aa  52  0.000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1519  transcriptional regulator, AbrB family  29.13 
 
 		 337 aa  52.4  0.000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1120  CAAX amino terminal protease family protein  32.56 
 
 		 284 aa  52  0.000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2103  abortive infection protein  32.26 
 
 		 246 aa  52  0.000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1019  CAAX amino terminal protease family protein  32.56 
 
 		 284 aa  52  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1276  CAAX amino terminal protease family protein  32.56 
 
 		 282 aa  52  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0879  CAAX amino terminal protease family protein  32.95 
 
 		 273 aa  51.6  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00516556  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0563  caax amino protease family  29.89 
 
 		 238 aa  52  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000143586  hitchhiker  0.000000000286497 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1199  CAAX amino terminal protease family protein  32.56 
 
 		 282 aa  52  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.746806 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4309  CAAX amino protease  34.67 
 
 		 224 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1913  abortive infection protein  31.65 
 
 		 234 aa  50.8  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000308321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0988  CAAX amino terminal protease family protein  32.95 
 
 		 273 aa  51.2  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000602238  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3430  Abortive infection protein  35.23 
 
 		 261 aa  51.2  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000181299  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0845  abortive infection protein  30.3 
 
 		 272 aa  51.2  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1018  CAAX amino terminal protease family protein  31.78 
 
 		 284 aa  50.4  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.300686  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1848  metal-dependent membrane protease  33.33 
 
 		 448 aa  50.4  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.11501  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05731  membrane-associated protease  33.33 
 
 		 448 aa  50.4  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.261974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2417  abortive infection protein  33.33 
 
 		 362 aa  50.4  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000014849  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2041  protease, putative  38.98 
 
 		 287 aa  50.1  0.00004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00120483  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_6079  predicted protein  25.78 
 
 		 234 aa  50.1  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.392494  normal  0.133963 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05181  membrane-associated protease  35.71 
 
 		 453 aa  50.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>