More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I0313 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03190  protein chain elongation factor EF-Tu (duplicate of tufB)  83.72 
 
 		 394 aa  660    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00381408  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03856  protein chain elongation factor EF-Tu (duplicate of tufA)  83.5 
 
 		 394 aa  661    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000229508  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0374  translation elongation factor Tu  83.72 
 
 		 394 aa  660    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000155333  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4015  translation elongation factor Tu  83.5 
 
 		 394 aa  661    Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000705833  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3171  elongation factor Tu  77.47 
 
 		 396 aa  636    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000406645  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0211  elongation factor Tu  86.22 
 
 		 394 aa  671    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000453651  unclonable  0.00000937964 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4172  elongation factor Tu  85.53 
 
 		 394 aa  659    Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000076716  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4548  elongation factor Tu  85.03 
 
 		 394 aa  665    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312961  normal  0.015065 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0234  elongation factor Tu  77.47 
 
 		 396 aa  635    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000045907  normal  0.0164851 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3620  elongation factor Tu  83.72 
 
 		 394 aa  660    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000372822  hitchhiker  0.00440714 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0332  elongation factor Tu  86.01 
 
 		 394 aa  672    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000132948  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3715  elongation factor Tu  83.97 
 
 		 394 aa  661    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.214032  normal  0.317653 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4764  elongation factor Tu  83.76 
 
 		 394 aa  665    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4780  elongation factor Tu  83.76 
 
 		 394 aa  665    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.253052  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0217  elongation factor Tu  86.04 
 
 		 394 aa  692    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0229  elongation factor Tu  85.79 
 
 		 394 aa  691    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4278  elongation factor Tu  76.85 
 
 		 407 aa  635    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000289642  unclonable  0.00000000000640465 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2634  elongation factor Tu  77.47 
 
 		 396 aa  636    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000354854  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2649  elongation factor Tu  77.47 
 
 		 396 aa  636    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.0000546153  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0182  elongation factor Tu  85.53 
 
 		 394 aa  659    Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000514209  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3867  elongation factor Tu  86.01 
 
 		 394 aa  672    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  6.62451e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0194  elongation factor Tu  85.53 
 
 		 394 aa  659    Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000823717  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4045  elongation factor Tu  83.5 
 
 		 394 aa  661    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000276048  hitchhiker  0.00334828 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0170  elongation factor Tu  85.79 
 
 		 394 aa  672    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000210333  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3773  elongation factor Tu  86.04 
 
 		 394 aa  674    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000180335  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3761  elongation factor Tu  86.04 
 
 		 394 aa  674    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000788214  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4475  elongation factor Tu  83.97 
 
 		 394 aa  661    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000136907  hitchhiker  0.00081274 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00233  elongation factor Tu  92.88 
 
 		 394 aa  712    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3808  elongation factor Tu  83.72 
 
 		 394 aa  660    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000017346  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0182  elongation factor Tu  85.79 
 
 		 394 aa  672    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000366988  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3778  elongation factor Tu  77.47 
 
 		 396 aa  636    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000176887  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3794  elongation factor Tu  77.47 
 
 		 396 aa  636    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000750152  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4319  elongation factor Tu  86.04 
 
 		 394 aa  673    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000023337  unclonable  0.000000000108013 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4519  elongation factor Tu  83.5 
 
 		 394 aa  662    Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000034313  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3762  elongation factor Tu  77.47 
 
 		 396 aa  636    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.000000000163409  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3748  elongation factor Tu  77.47 
 
 		 396 aa  636    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000373215  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4692  elongation factor Tu  85.79 
 
 		 394 aa  674    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000201844  unclonable  0.0000000372179 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3437  elongation factor Tu  83.21 
 
 		 394 aa  652    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.00000112361  hitchhiker  0.000128836 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0278  elongation factor Tu  85.28 
 
 		 394 aa  667    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000412884  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3674  elongation factor Tu  85.28 
 
 		 394 aa  667    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000219951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0199  elongation factor Tu  86.22 
 
 		 394 aa  671    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000563397  hitchhiker  0.000127621 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0374  elongation factor Tu  83.72 
 
 		 394 aa  660    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00309992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4428  elongation factor Tu  83.5 
 
 		 394 aa  661    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000375004  hitchhiker  0.00000974336 
 
 
-
 
NC_009037  Sbal_4468  elongation factor Tu  85.53 
 
 		 394 aa  659    Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1922  elongation factor Tu  77.47 
 
 		 396 aa  636    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000951262  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3070  elongation factor Tu  77.47 
 
 		 396 aa  636    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000360276  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3084  elongation factor Tu  77.47 
 
 		 396 aa  636    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000577807  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3750  elongation factor Tu  83.97 
 
 		 394 aa  661    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.624959  normal  0.15097 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3824  elongation factor Tu  77.47 
 
 		 396 aa  636    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195129  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2723  elongation factor Tu  91.88 
 
 		 394 aa  715    Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000408037  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2774  elongation factor Tu  91.88 
 
 		 394 aa  715    Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000437207  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3918  elongation factor Tu  85.28 
 
 		 394 aa  667    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  7.13111e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1856  elongation factor Tu  76.77 
 
 		 397 aa  634    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000358768  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0929  elongation factor Tu  76.66 
 
 		 407 aa  640    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000367222  hitchhiker  0.00313256 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0931  elongation factor Tu  76.66 
 
 		 407 aa  640    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000100695  hitchhiker  0.00709672 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3806  elongation factor Tu  77.47 
 
 		 396 aa  636    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.222005  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0265  elongation factor Tu  78.23 
 
 		 396 aa  642    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000271632  hitchhiker  0.00214055 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0277  elongation factor Tu  78.48 
 
 		 396 aa  644    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000015281  unclonable  0.000000133625 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4213  elongation factor Tu  83.5 
 
 		 394 aa  661    Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  7.910989999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3535  elongation factor Tu  83.72 
 
 		 394 aa  660    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000296499  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0186  elongation factor Tu  85.53 
 
 		 394 aa  658    Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000152251  hitchhiker  0.000684703 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0198  elongation factor Tu  85.53 
 
 		 394 aa  659    Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000378702  unclonable  0.0000127922 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0168  elongation factor Tu  85.79 
 
 		 394 aa  673    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000100576  n/a   
 
 
 
NC_009379  Pnuc_0039  elongation factor Tu  78.03 
 
 		 396 aa  638    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  unclonable  0.00000000135478  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0156  elongation factor Tu  86.55 
 
 		 394 aa  677    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000313949  decreased coverage  0.000051786 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3186  elongation factor Tu  77.47 
 
 		 396 aa  636    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000468547  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0051  elongation factor Tu  78.03 
 
 		 396 aa  638    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000252436  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3461  elongation factor Tu  77.47 
 
 		 396 aa  636    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.000474832  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4478  elongation factor Tu  83.97 
 
 		 394 aa  661    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00401398  decreased coverage  0.00000000000000987453 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0247  elongation factor Tu  77.47 
 
 		 396 aa  635    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000151927  normal  0.238121 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0319  elongation factor Tu  76.77 
 
 		 397 aa  634    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000467982  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0495  elongation factor Tu  80.66 
 
 		 394 aa  661    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00054  elongation factor Tu  92.88 
 
 		 394 aa  712    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1870  elongation factor Tu  76.77 
 
 		 397 aa  634    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000816391  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2803  elongation factor Tu  86.01 
 
 		 394 aa  672    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000018967  normal  0.0748006 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0335  elongation factor Tu  76.77 
 
 		 397 aa  634    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000334885  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0603  elongation factor Tu  87.31 
 
 		 394 aa  679    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00291328  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3996  elongation factor Tu  87.31 
 
 		 394 aa  679    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000528557  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0195  elongation factor Tu  83.72 
 
 		 394 aa  659    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.0000000854566  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1644  elongation factor Tu  83.72 
 
 		 394 aa  659    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.416574  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0185  elongation factor Tu  86.55 
 
 		 394 aa  707    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000201579  hitchhiker  0.00891044 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0197  elongation factor Tu  86.04 
 
 		 394 aa  690    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000553237  unclonable  0.0000000000241033 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0180  elongation factor Tu  86.55 
 
 		 394 aa  707    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000449049  hitchhiker  0.00322221 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0192  elongation factor Tu  86.29 
 
 		 394 aa  692    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00059163  decreased coverage  0.000414976 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3756  elongation factor Tu  84.77 
 
 		 394 aa  667    Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000175435  decreased coverage  0.00120864 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0190  elongation factor Tu  84.77 
 
 		 394 aa  667    Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000235247  normal  0.27842 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0134  elongation factor Tu  85.28 
 
 		 394 aa  667    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000637762  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0146  elongation factor Tu  85.28 
 
 		 394 aa  667    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000000378684  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1906  elongation factor Tu  77.47 
 
 		 396 aa  636    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00000000303162  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0270  elongation factor Tu  85.28 
 
 		 394 aa  666    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000276369  normal  0.0281528 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4704  elongation factor Tu  86.04 
 
 		 394 aa  674    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000392421  hitchhiker  0.000039393 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0035  elongation factor Tu  77.27 
 
 		 396 aa  637    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000775684  hitchhiker  0.000000000148389 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0274  elongation factor Tu  77.72 
 
 		 396 aa  635    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00680281  normal  0.135864 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0261  elongation factor Tu  77.72 
 
 		 396 aa  635    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000273962  normal  0.384792 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4468  elongation factor Tu  83.5 
 
 		 394 aa  661    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000000722056  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3713  elongation factor Tu  83.72 
 
 		 394 aa  660    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000994167  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0185  elongation factor Tu  86.29 
 
 		 394 aa  705    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000202802  normal  0.069078 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0197  elongation factor Tu  86.29 
 
 		 394 aa  705    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000214684  hitchhiker  0.0000000334083 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0144  elongation factor Tu  86.29 
 
 		 394 aa  675    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000195175  normal  0.039031 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3476  elongation factor Tu  77.47 
 
 		 396 aa  636    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.0000712008  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>