192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_03303 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_03303  hypothetical protein  100 
 
 
607 aa  1257    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002683  predicted hydrolase  82.37 
 
 
607 aa  1053    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2178  hypothetical protein  44.81 
 
 
622 aa  560  1e-158  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000141433  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3482  sulfatase  35.15 
 
 
609 aa  379  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.531027  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0181  membrane associated sulfatase  33.81 
 
 
617 aa  373  1e-102  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.630405  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0242  membrane associated sulfatase  33.81 
 
 
617 aa  373  1e-102  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3036  sulfatase  37.46 
 
 
611 aa  370  1e-101  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3889  sulfatase  32.74 
 
 
613 aa  347  3e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0173  sulfatase  33.39 
 
 
638 aa  308  3e-82  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.317367  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2021  phosphoglycerol transferase MdoB-like protein, alkaline phosphatase superfamily  33.22 
 
 
647 aa  306  7e-82  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.886133  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0352  sulfatase  32.98 
 
 
600 aa  301  2e-80  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0469507  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2024  phosphoglycerol transferase MdoB-like protein, alkaline phosphatase superfamily  34.42 
 
 
638 aa  301  3e-80  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0014  sulfatase  30.74 
 
 
615 aa  297  4e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0170  sulfatase  34.24 
 
 
635 aa  297  4e-79  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1271  hypothetical protein  31.16 
 
 
637 aa  275  2.0000000000000002e-72  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1272  hypothetical protein  30.57 
 
 
637 aa  273  1e-71  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2835  sulfatase  29.72 
 
 
625 aa  257  6e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.181831  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1626  hypothetical protein  29.04 
 
 
600 aa  239  8e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000382415  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1057  putative sulfatase  28.6 
 
 
601 aa  239  1e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002922  putative sulfatase  28.45 
 
 
602 aa  237  6e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1723  putative sulfatase  29.62 
 
 
624 aa  233  6e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.010962  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03028  hypothetical protein  28.2 
 
 
602 aa  227  5.0000000000000005e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2723  sulfatase family protein  28.86 
 
 
598 aa  222  9.999999999999999e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.223832  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1484  sulfatase family protein  28.86 
 
 
598 aa  222  9.999999999999999e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.15625  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2798  sulfatase  28.86 
 
 
598 aa  222  9.999999999999999e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000743938  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2784  sulfatase  26.56 
 
 
586 aa  216  9e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.879948  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2101  sulfatase  30.75 
 
 
614 aa  209  1e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.102341  normal  0.0551221 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3257  sulfatase  27.23 
 
 
593 aa  206  1e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000874848  normal  0.913435 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2467  inner membrane protein YejM  25.98 
 
 
586 aa  203  7e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.437197  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2579  inner membrane protein YejM  25.82 
 
 
586 aa  202  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.197291  normal  0.0355426 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2377  inner membrane protein YejM  25.9 
 
 
586 aa  202  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0573196  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2422  inner membrane protein YejM  25.82 
 
 
586 aa  202  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.223864 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2465  hypothetical protein  25.82 
 
 
586 aa  202  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.124553  hitchhiker  0.000929959 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52300  hypothetical protein  28.76 
 
 
642 aa  201  3e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.640238 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4586  hypothetical protein  27.19 
 
 
641 aa  200  7.999999999999999e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.445083  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02118  predicted hydrolase, inner membrane  25.57 
 
 
586 aa  199  9e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0693117  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1469  sulfatase  25.57 
 
 
586 aa  199  9e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00665277  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2327  sulfatase family protein  25.57 
 
 
586 aa  199  9e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.194972  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2338  sulfatase family protein  25.57 
 
 
586 aa  199  9e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0980627  normal  0.0832613 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3327  sulfatase family protein  25.57 
 
 
586 aa  199  9e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.388602  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02077  hypothetical protein  25.57 
 
 
586 aa  199  9e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0973017  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1459  sulfatase  25.57 
 
 
586 aa  199  9e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.741497  normal  0.82887 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0769  sulfatase family protein  25.57 
 
 
586 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.442835  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2487  sulfatase family protein  25.57 
 
 
586 aa  199  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0306153  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0230  hypothetical protein  25.9 
 
 
580 aa  196  1e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2269  sulfatase  27.63 
 
 
595 aa  196  1e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00312087  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1815  sulfatase  27.08 
 
 
595 aa  188  3e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000588334  normal  0.040327 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2529  sulfatase  27.08 
 
 
595 aa  187  3e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.370551  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2651  sulfatase  27.08 
 
 
595 aa  187  5e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.131342  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2175  hypothetical protein  27.36 
 
 
596 aa  187  6e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2536  sulfatase  27.08 
 
 
595 aa  187  6e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.120182  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2447  sulfatase  25.37 
 
 
590 aa  186  9e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00465294  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2361  sulfatase  26.11 
 
 
590 aa  184  5.0000000000000004e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2290  sulfatase  25.8 
 
 
592 aa  182  1e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000757379  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2295  sulfatase  26.77 
 
 
596 aa  181  2e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0407912  normal  0.745937 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2428  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  26.77 
 
 
596 aa  182  2e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0457746  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1632  sulfatase  24.37 
 
 
582 aa  179  1e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.258504  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2219  sulfatase  26.6 
 
 
596 aa  179  2e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.198637  normal  0.459897 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2337  sulfatase  27.21 
 
 
604 aa  177  4e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000969509  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1808  sulfatase  26.48 
 
 
594 aa  177  6e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00146351  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1470  sulfatase  27.26 
 
 
595 aa  174  5.999999999999999e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00214736  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1903  sulfatase  25.05 
 
 
582 aa  169  9e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.959252  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1763  sulfatase  25.17 
 
 
594 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2493  sulfatase  25.44 
 
 
596 aa  162  2e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0120701  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1555  hypothetical protein  24.01 
 
 
594 aa  161  4e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000146731  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2787  sulfatase  23.34 
 
 
595 aa  159  2e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00415644  normal  0.904543 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0192  sulfatase  27.04 
 
 
630 aa  156  1e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.30718 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0174  sulfatase  23.53 
 
 
621 aa  130  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0183  sulfatase  26.84 
 
 
621 aa  128  3e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0194  sulfatase  26.55 
 
 
621 aa  125  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3685  sulfatase  23.51 
 
 
1009 aa  70.1  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0329595  hitchhiker  0.00309505 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1453  sulfatase  21.26 
 
 
450 aa  63.2  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2507  sulfatase  23.12 
 
 
873 aa  60.8  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0936334  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3923  hypothetical protein  22.31 
 
 
547 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.107021  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39020  hypothetical protein  23.65 
 
 
567 aa  58.2  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0446171  normal  0.409491 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0311  putative cell division protein  21.55 
 
 
547 aa  57.8  0.0000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00469316  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3323  hypothetical protein  23 
 
 
572 aa  58.2  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.364714  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6149  choline-sulfatase  25.53 
 
 
503 aa  56.6  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.989807 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2610  hypothetical protein  24.4 
 
 
586 aa  56.2  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.180908  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1069  sulfatase  29.13 
 
 
641 aa  55.5  0.000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2284  sulfatase  23.3 
 
 
784 aa  55.5  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2204  putative cell division protein  22.57 
 
 
545 aa  55.5  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00407882  hitchhiker  0.00021657 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21210  hypothetical protein  21.45 
 
 
551 aa  55.1  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3835  putative cell division protein  21.8 
 
 
548 aa  53.9  0.000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.830183  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2202  sulfatase  32.63 
 
 
596 aa  53.5  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1810  hypothetical protein  20.9 
 
 
551 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3650  sulfatase  26.22 
 
 
482 aa  52.4  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00127194  decreased coverage  0.00847064 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2368  putative N-acetylglucosamine-6-sulfatase  25.43 
 
 
537 aa  53.1  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3436  sulfatase  21.86 
 
 
462 aa  52.8  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1018  sulfatase  23.65 
 
 
544 aa  53.1  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.663871  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3903  sulfatase  20.96 
 
 
486 aa  52  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1798  putative cell division protein  20.4 
 
 
543 aa  52.4  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000435221  normal  0.0343315 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0377  sulfatase  20.68 
 
 
671 aa  52  0.00003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000264889  hitchhiker  0.0000000000000148489 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0126  sulfatase  23.31 
 
 
467 aa  52  0.00003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1250  sulfatase  22.47 
 
 
489 aa  51.6  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.820666  normal  0.257041 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4122  sulfatase  23.61 
 
 
545 aa  51.6  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1478  sulfatase  25.42 
 
 
558 aa  51.2  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0820  sulfatase  22.09 
 
 
627 aa  51.2  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03562  predicted sulfatase/phosphatase  22.49 
 
 
497 aa  50.8  0.00006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.678565  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03505  hypothetical protein  22.49 
 
 
497 aa  50.8  0.00006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.973058  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>