22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1963 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1963  hypothetical protein  100 
 
 		 265 aa  533  1e-151  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3725  ATPase  25.62 
 
 		 455 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2489  SMC domain-containing protein  28.57 
 
 		 452 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000889729  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4119  SMC domain protein  27.27 
 
 		 482 aa  68.9  0.00000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3230  hypothetical protein  33.8 
 
 		 113 aa  55.5  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0080421  normal  0.477245 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1444  hemin importer ATP-binding subunit  26.92 
 
 		 263 aa  46.2  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.326637  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2257  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  35.53 
 
 		 506 aa  46.2  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.968196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1294  ABC transporter related  31.4 
 
 		 215 aa  45.8  0.0007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.471861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0125  ABC transporter related protein  30.23 
 
 		 246 aa  45.4  0.0008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.525287  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0352  ABC transporter, ATP-binding protein  31.25 
 
 		 245 aa  45.4  0.0009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3358  cytochrome c biogenesis protein CcmA  22.5 
 
 		 202 aa  44.3  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.502748  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0003  DNA replication and repair protein RecF  42.55 
 
 		 363 aa  43.9  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1462  SMC domain protein  22.63 
 
 		 423 aa  44.3  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3137  ATPas  28.16 
 
 		 449 aa  43.9  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.828607 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3199  hypothetical protein  42.31 
 
 		 693 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2920  hypothetical protein  42.31 
 
 		 693 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1411  heme exporter protein CcmA  35.94 
 
 		 208 aa  43.5  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.772651  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3030  SMC domain-containing protein  21.94 
 
 		 406 aa  42.7  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.726851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0223  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  27.69 
 
 		 241 aa  42.4  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0851652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0593  ABC-type phosphate transport system, ATPase component  28.87 
 
 		 256 aa  42.4  0.008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2638  ABC transporter related protein  25.38 
 
 		 248 aa  42.4  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.545525  normal  0.0766535 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0003  DNA replication and repair protein RecF  44.68 
 
 		 370 aa  42  0.009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.152297 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>