61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1825 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_1825  preprotein translocase, SecE subunit  100 
 
 		 76 aa  148  3e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4322  preprotein translocase, SecE subunit  53.33 
 
 		 84 aa  50.4  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.101724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3324  preprotein translocase, SecE subunit  53.33 
 
 		 84 aa  50.1  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00139323  normal  0.104735 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1449  preprotein translocase subunit SecE  43.48 
 
 		 83 aa  48.9  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2990  preprotein translocase subunit SecE  42 
 
 		 83 aa  48.9  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0282  preprotein translocase subunit SecE  48.84 
 
 		 63 aa  48.5  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000441013  hitchhiker  0.00342924 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2078  preprotein translocase, SecE subunit  34.78 
 
 		 82 aa  47.4  0.00006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0321  preprotein translocase, SecE subunit  43.64 
 
 		 127 aa  46.6  0.0001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000345657  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002167  preprotein translocase subunit SecE  41.07 
 
 		 126 aa  46.2  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000092259  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00231  preprotein translocase subunit SecE  41.07 
 
 		 126 aa  45.8  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2550  preprotein translocase subunit SecE  33.33 
 
 		 73 aa  46.2  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000058162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0886  preprotein translocase subunit SecE  44.9 
 
 		 72 aa  45.4  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00409915  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2718  preprotein translocase, SecE subunit  31.25 
 
 		 80 aa  45.4  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00287397  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0636  preprotein translocase subunit SecE  36.23 
 
 		 81 aa  45.4  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0204461  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0995  preprotein translocase subunit SecE  42.86 
 
 		 72 aa  45.1  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00000327583  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2869  preprotein translocase subunit SecE  34.38 
 
 		 66 aa  44.7  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.07093  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_867  preprotein translocase SecE subunit  42.86 
 
 		 72 aa  44.3  0.0005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000768713  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1042  preprotein translocase subunit SecE  31.58 
 
 		 73 aa  44.3  0.0006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000810239  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1333  preprotein translocase subunit SecE  36.67 
 
 		 60 aa  44.3  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0318216  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0559  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  47.62 
 
 		 63 aa  44.3  0.0006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0090  preprotein translocase subunit SecE  43.75 
 
 		 59 aa  44.3  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000140466  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0282  SecE subunit of protein translocation complex  32.14 
 
 		 132 aa  43.9  0.0007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000632695  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2872b  preprotein translocase subunit SecE  40.35 
 
 		 125 aa  43.9  0.0008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00131077  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0125  preprotein translocase subunit SecE  43.75 
 
 		 59 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000332702  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0095  preprotein translocase subunit SecE  43.75 
 
 		 59 aa  43.9  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000184804  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0089.1  preprotein translocase subunit SecE  43.75 
 
 		 59 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000332974  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0105  preprotein translocase subunit SecE  43.75 
 
 		 59 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.53288e-62 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1868  protein translocase subunit  40 
 
 		 127 aa  43.9  0.0008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0000227332  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0095  preprotein translocase subunit SecE  43.75 
 
 		 59 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000231467  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0095  preprotein translocase subunit SecE  43.75 
 
 		 59 aa  43.9  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000000233788  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0089  preprotein translocase subunit SecE  41.67 
 
 		 59 aa  43.5  0.0009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000139585  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0258  preprotein translocase, SecE subunit  41.86 
 
 		 66 aa  43.5  0.0009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0091  preprotein translocase subunit SecE  43.75 
 
 		 63 aa  43.5  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.58206e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0115  preprotein translocase subunit SecE  43.1 
 
 		 59 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000539908  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0120  preprotein translocase, SecE subunit  41.38 
 
 		 72 aa  43.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.568104  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5211  preprotein translocase subunit SecE  43.1 
 
 		 59 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000209683  unclonable  2.82699e-26 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0351  preprotein translocase subunit SecE  35.09 
 
 		 63 aa  42.7  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000000092456  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2728  preprotein translocase subunit SecE  33.33 
 
 		 74 aa  42.4  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000036945  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2414  preprotein translocase subunit SecE  33.33 
 
 		 74 aa  42.4  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000000338556  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0445  preprotein translocase subunit SecE  42.22 
 
 		 83 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2724  preprotein translocase subunit SecE  39.29 
 
 		 131 aa  42.7  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000108515  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0392  preprotein translocase subunit SecE  48.21 
 
 		 115 aa  42  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00699813 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4778  preprotein translocase, SecE subunit  35 
 
 		 126 aa  42  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0308263  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1893  preprotein translocase, SecE subunit  38.6 
 
 		 103 aa  41.2  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.024176  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1182  preprotein translocase subunit SecE  40.43 
 
 		 72 aa  41.6  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00132443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0368  preprotein translocase, SecE subunit  38.6 
 
 		 101 aa  41.6  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.611676  normal  0.774176 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0190  preprotein translocase subunit SecE  38.64 
 
 		 63 aa  41.6  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000000126022  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2202  preprotein translocase subunit SecE  48.72 
 
 		 135 aa  41.2  0.004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.00000000618681  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0592  preprotein translocase, SecE subunit  41.86 
 
 		 125 aa  41.6  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000922511  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1630  preprotein translocase subunit SecE  29.69 
 
 		 79 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0266  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  41.67 
 
 		 115 aa  41.2  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00308098  hitchhiker  0.00137847 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2113  preprotein translocase subunit SecE  48.72 
 
 		 135 aa  40.8  0.006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000000307144  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4015  preprotein translocase subunit SecE  33.33 
 
 		 83 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0367352  hitchhiker  0.00000028669 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1060  preprotein translocase, SecE subunit  37.5 
 
 		 124 aa  40.8  0.006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.168917  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00689  Preprotein translocase subunit SecE  36.07 
 
 		 112 aa  40.4  0.007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000478021  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0920  preprotein translocase subunit SecE  43.4 
 
 		 61 aa  40.4  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0227  preprotein translocase subunit SecE  40.48 
 
 		 63 aa  40.4  0.008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0635972  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0235  preprotein translocase subunit SecE  39.62 
 
 		 126 aa  40  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0172434  normal  0.0123007 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0271  preprotein translocase subunit SecE  35.71 
 
 		 127 aa  40  0.01  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000179127  normal  0.0228965 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1968  preprotein translocase subunit SecE  41.03 
 
 		 63 aa  40  0.01  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.51744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0191  preprotein translocase subunit SecE  35.71 
 
 		 127 aa  40  0.01  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000178123  normal  0.246715 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>