More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2505 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_2505  SUF system FeS assembly protein, NifU family  100 
 
 
151 aa  313  6e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2440  SUF system FeS assembly protein  85.31 
 
 
153 aa  259  1e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.155172  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2485  NifU family SUF system FeS assembly protein  85.31 
 
 
153 aa  259  1e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.200135  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2476  NifU family SUF system FeS assembly protein  85.31 
 
 
153 aa  259  1e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.435362  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3673  NifU family SUF system FeS assembly protein  80 
 
 
155 aa  258  2e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.905267  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2737  NifU family SUF system FeS assembly protein  81.82 
 
 
153 aa  256  1e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.556546 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2387  SUF system FeS assembly protein, NifU family  74.83 
 
 
154 aa  244  2e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.212849  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11493  nitrogen fixation-like protein  76.22 
 
 
162 aa  239  1e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.20118e-08  normal  0.138949 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2280  SUF system FeS assembly protein, NifU family  68.28 
 
 
167 aa  220  6e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  2.88131e-06  hitchhiker  0.00804986 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16170  SUF system FeS assembly protein, NifU family  68.92 
 
 
150 aa  219  8e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1665  SUF system FeS assembly protein  67.12 
 
 
172 aa  215  1e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.754519  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5149  SUF system FeS assembly protein, NifU family  67.13 
 
 
147 aa  212  1e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.726273  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2090  NifU family SUF system FeS assembly protein  64.05 
 
 
151 aa  212  1e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2958  SUF system FeS assembly protein, NifU family  61.54 
 
 
158 aa  210  6e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1982  SUF system FeS assembly protein  60 
 
 
160 aa  209  7e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.323974  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2229  SUF system FeS assembly protein, NifU family  61.74 
 
 
151 aa  206  9e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  7.71916e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5982  nitrogen fixation protein  63.64 
 
 
145 aa  201  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.8626  normal  0.134039 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1139  NifU family SUF system FeS assembly protein  61.22 
 
 
157 aa  198  3e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.039211 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2447  SUF system FeS assembly protein, NifU family  63.77 
 
 
156 aa  195  2e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0284902 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2268  SUF system FeS assembly protein, NifU family  56.77 
 
 
163 aa  193  8e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.794805 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1967  SUF system FeS assembly protein  62.41 
 
 
145 aa  192  1e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.245372 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2069  SUF system FeS assembly protein, NifU family  64.08 
 
 
155 aa  192  1e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.420514  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2555  NifU family SUF system FeS assembly protein  57.45 
 
 
150 aa  181  3e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.693713  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3305  NifU family SUF system FeS assembly protein  57.43 
 
 
158 aa  180  6e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000286575 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13390  SUF system FeS assembly protein, NifU family  60 
 
 
163 aa  179  8e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00685407  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3078  NifU family SUF system FeS assembly protein  57.43 
 
 
158 aa  175  2e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.167444  normal  0.201859 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3483  SUF system FeS assembly protein, NifU family  58.57 
 
 
146 aa  171  4e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.250714  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16670  SUF system FeS assembly protein, NifU family  49.3 
 
 
152 aa  163  6e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0471636  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1362  SUF system FeS assembly protein, NifU family  54.73 
 
 
155 aa  159  1e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.576777  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1145  SUF system FeS assembly protein, NifU family  52.6 
 
 
178 aa  157  5e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21900  SUF system FeS assembly protein, NifU family  52.7 
 
 
178 aa  151  3e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1294  SUF system FeS assembly protein, NifU family  46.31 
 
 
149 aa  140  7e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.98269e-10 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2335  SUF system FeS assembly protein, NifU family  41.49 
 
 
191 aa  138  2e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.610109  normal  0.712132 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1676  SUF system FeS assembly protein, NifU family  49.03 
 
 
171 aa  137  4e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.610224  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0602  hypothetical protein  42.94 
 
 
184 aa  137  5e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.547374  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1236  NifU family SUF system FeS assembly protein  38.99 
 
 
161 aa  125  2e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0144  NifU family protein  41.01 
 
 
147 aa  120  8e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.966065  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0862  NifU family SUF system FeS assembly protein  40.71 
 
 
154 aa  120  8e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.16993  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0846  NifU family SUF system FeS assembly protein  40.71 
 
 
154 aa  120  8e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.539052  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0221  NifU family protein  41.01 
 
 
144 aa  119  1e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0894  NifU family SUF system FeS assembly protein  37.33 
 
 
153 aa  119  1e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0702679  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0387  SUF system FeS assembly protein, NifU family  47.58 
 
 
233 aa  119  1e-26  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.820137 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0603  NifU family SUF system FeS assembly protein  42.03 
 
 
151 aa  114  3e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.281207  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2920  SUF system FeS assembly protein, NifU family  42.25 
 
 
145 aa  114  4e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2328  NifU family SUF system FeS assembly protein  40.58 
 
 
137 aa  113  1e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2313  SUF system FeS assembly protein  42.45 
 
 
147 aa  110  7e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.960672 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0989  SUF system FeS assembly protein, NifU family  39.44 
 
 
151 aa  110  9e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.784389  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0290  NifU family SUF system FeS assembly protein  39.13 
 
 
137 aa  110  9e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3071  SUF system FeS assembly protein, NifU family  43.07 
 
 
149 aa  110  9e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1787  SUF system FeS assembly protein  35.51 
 
 
160 aa  109  1e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0971844  normal  0.163448 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0165  SUF system FeS assembly protein  40.15 
 
 
140 aa  108  3e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1002  SUF system FeS assembly protein, NifU family  38.57 
 
 
141 aa  107  8e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0651104  normal  0.492699 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4473  SUF system FeS assembly protein, NifU family  35.51 
 
 
165 aa  107  8e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0568  SUF system FeS assembly protein, NifU family  36.81 
 
 
153 aa  106  1e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.654939  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3280  SUF system FeS assembly protein, NifU family  37.93 
 
 
149 aa  104  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.182981  normal  0.0362221 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0499  NifU domain-containing protein  39.44 
 
 
154 aa  105  3e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1970  NifU-like protein for Fe-S cluster formation  35.86 
 
 
152 aa  101  4e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1636  SUF system FeS assembly protein, NifU family  34.31 
 
 
139 aa  101  4e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0847  SUF system FeS assembly protein  37.59 
 
 
149 aa  100  7e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.190633  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2035  Fe-S cluster formation protein, NifU-like  33.81 
 
 
144 aa  100  8e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2886  NifU-like domain-containing protein  41.61 
 
 
163 aa  99.8  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2827  NifU family SUF system FeS assembly protein  41.61 
 
 
163 aa  99.8  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0609  NifU-like domain-containing protein  41.61 
 
 
163 aa  99.8  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2707  NifU family SUF system FeS assembly protein  41.61 
 
 
163 aa  99.8  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1716  NifU-like domain-containing protein  41.61 
 
 
163 aa  99.8  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0759049  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0893  SUF system FeS assembly protein, NifU family  37.59 
 
 
149 aa  99.8  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2403  NifU-like domain-containing protein  41.61 
 
 
163 aa  99.8  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2339  SUF system FeS assembly protein, NifU family  37.86 
 
 
159 aa  99  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000980785  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2850  NifU family SUF system FeS assembly protein  37.86 
 
 
159 aa  98.6  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0656  hypothetical protein  38.3 
 
 
149 aa  99  2e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0897  SUF system FeS assembly protein, NifU family  37.59 
 
 
149 aa  99.4  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.341493  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0640  hypothetical protein  38.3 
 
 
149 aa  98.2  3e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2764  NifU family SUF system FeS assembly protein  41.61 
 
 
163 aa  98.2  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.541275  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2186  SUF system FeS assembly protein, NifU family  34.56 
 
 
144 aa  97.4  6e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2138  SUF system FeS assembly protein, NifU family  34.56 
 
 
144 aa  97.4  6e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1793  NifU-like domain-containing protein  35.33 
 
 
163 aa  95.9  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.310093  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0269  SUF system FeS assembly protein, NifU family  35 
 
 
148 aa  95.9  2e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1110  Fe-S cluster formation protein, NifU-like  36.5 
 
 
146 aa  93.2  1e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4802  NifU family SUF system FeS assembly protein  37.96 
 
 
143 aa  91.7  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0907  NifU family SUF system FeS assembly protein  36.17 
 
 
149 aa  91.3  4e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.895466 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1504  SUF system FeS assembly protein, NifU family protein  29.14 
 
 
153 aa  91.3  4e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.175472 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4273  SUF system FeS assembly protein  31.69 
 
 
149 aa  90.9  5e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0047  NifU family SUF system FeS assembly protein  36.15 
 
 
135 aa  90.5  6e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2274  SUF system FeS assembly protein, NifU family  29.45 
 
 
144 aa  90.9  6e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0118  iron-sulfur cluster assembly scaffold SufA  36.96 
 
 
143 aa  90.9  6e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5122  iron-sulfur cluster assembly scaffold SufA  36.96 
 
 
143 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0356779  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5085  iron-sulfur cluster assembly scaffold SufA  36.96 
 
 
143 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5117  NifU domain-containing protein  36.96 
 
 
143 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4848  NifU domain-containing protein  36.96 
 
 
143 aa  89.7  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4689  NifU family protein  36.96 
 
 
143 aa  89.7  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4704  NifU family protein  36.96 
 
 
143 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5120  iron-sulfur cluster assembly scaffold SufA  36.96 
 
 
143 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3576  NifU family SUF system FeS assembly protein  37.96 
 
 
143 aa  89.4  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5214  NifU domain-containing protein  36.96 
 
 
143 aa  89.7  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0219  SUF system FeS assembly protein, NifU family  38.24 
 
 
139 aa  88.6  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0307  NifU family SUF system FeS assembly protein  34.06 
 
 
132 aa  88.6  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0630803 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0652  NifU family SUF system FeS assembly protein  35.71 
 
 
145 aa  89  2e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1411  NifU family SUF system FeS assembly protein  33.81 
 
 
138 aa  88.2  4e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1457  NifU family SUF system FeS assembly protein  33.81 
 
 
138 aa  88.2  4e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26820  SUF system FeS assembly protein, NifU family  29.41 
 
 
145 aa  87.4  5e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>