51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2470 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2470  hypothetical protein  100 
 
 		 226 aa  454  1e-127  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0141  Putitive phosphate transport regulator  70.35 
 
 		 226 aa  324  7e-88  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.572504  normal  0.330321 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68800  hypothetical protein  54.46 
 
 		 225 aa  238  4e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5953  hypothetical protein  54.46 
 
 		 225 aa  238  5e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0717  hypothetical protein  53.12 
 
 		 226 aa  237  1e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000253337  unclonable  0.0000000117044 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0618  hypothetical protein  51.79 
 
 		 226 aa  236  3e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.357102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0351  hypothetical protein  53.54 
 
 		 225 aa  235  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3843  hypothetical protein  51.34 
 
 		 226 aa  232  3e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000724256  hitchhiker  0.0000000283379 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3487  hypothetical protein  51.34 
 
 		 226 aa  231  9e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000126131  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0692  hypothetical protein  50.45 
 
 		 226 aa  226  2e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130211  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0917  hypothetical protein  50 
 
 		 226 aa  226  3e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00343614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0883  hypothetical protein  50 
 
 		 226 aa  226  3e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000129781  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3455  hypothetical protein  50 
 
 		 226 aa  226  3e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000227297  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0907  protein of unknown function DUF47  50 
 
 		 226 aa  226  3e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000556938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0565  hypothetical protein  50.45 
 
 		 226 aa  225  6e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2673  hypothetical protein  50.89 
 
 		 226 aa  224  1e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.241271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0822  hypothetical protein  50 
 
 		 226 aa  223  2e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000109083  normal  0.209568 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0853  hypothetical protein  50 
 
 		 226 aa  223  2e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000459273  normal  0.62908 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3119  hypothetical protein  50 
 
 		 226 aa  223  2e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000717729  normal  0.542025 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3770  hypothetical protein  49.55 
 
 		 226 aa  221  4.9999999999999996e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3096  hypothetical protein  49.11 
 
 		 226 aa  220  9.999999999999999e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000106475  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1190  phosphate transport regulator  49.1 
 
 		 226 aa  221  9.999999999999999e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.967179  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2019  hypothetical protein  47.32 
 
 		 228 aa  219  1.9999999999999999e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000582127  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3320  hypothetical protein  50.22 
 
 		 225 aa  218  5e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.915489  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2827  hypothetical protein  50.22 
 
 		 224 aa  216  2.9999999999999998e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.245918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2681  hypothetical protein  45.98 
 
 		 226 aa  214  9.999999999999999e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0612362  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0181  hypothetical protein  46.43 
 
 		 226 aa  213  1.9999999999999998e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00863  hypothetical protein  45.54 
 
 		 228 aa  212  2.9999999999999995e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3638  hypothetical protein  46.64 
 
 		 226 aa  212  3.9999999999999995e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.1465  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2188  hypothetical protein  46.12 
 
 		 226 aa  207  1e-52  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.839701  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0618  hypothetical protein  44.09 
 
 		 223 aa  206  2e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0634  hypothetical protein  44.09 
 
 		 223 aa  206  2e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0138  putative pit accessory protein  46.12 
 
 		 238 aa  205  5e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1052  hypothetical protein  47.09 
 
 		 224 aa  194  8.000000000000001e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00170442  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0711  hypothetical protein  44.25 
 
 		 226 aa  187  2e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004528  phosphate transport regulator  47.12 
 
 		 195 aa  184  1.0000000000000001e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.327148  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0228  hypothetical protein  37 
 
 		 227 aa  147  1.0000000000000001e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.775061  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0063  hypothetical protein  26.39 
 
 		 224 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2044  hypothetical protein  28.18 
 
 		 228 aa  106  3e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000405279  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1146  Putitive phosphate transport regulator  22.9 
 
 		 227 aa  92.8  4e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.266401  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3224  hypothetical protein  24.77 
 
 		 222 aa  75.1  0.0000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0664  hypothetical protein  23.39 
 
 		 222 aa  65.1  0.0000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000019589  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0688  hypothetical protein  23.98 
 
 		 222 aa  62.4  0.000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000115743  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0788  hypothetical protein  22.52 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0493  hypothetical protein  24.53 
 
 		 224 aa  58.2  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000213235  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1625  hypothetical protein  20.45 
 
 		 217 aa  53.9  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.109704  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1332  hypothetical protein  23.63 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0285  hypothetical protein  20.09 
 
 		 217 aa  49.3  0.00005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1923  hypothetical protein  23.89 
 
 		 223 aa  48.9  0.00006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00116502  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0013  hypothetical protein  23.12 
 
 		 213 aa  48.5  0.00007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0013  hypothetical protein  23.12 
 
 		 213 aa  48.5  0.00007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>