More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2412 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2412  Redoxin domain protein  100 
 
 
167 aa  342  2e-93  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0399  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  51.2 
 
 
171 aa  187  7e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.689513  normal  0.928423 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0432  redoxin domain-containing protein  51.06 
 
 
169 aa  157  7e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0116447 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0475  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  38.79 
 
 
173 aa  140  9e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2145  Redoxin domain protein  45.6 
 
 
172 aa  139  1.9999999999999998e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.765284  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2431  putative thioredoxin  43.28 
 
 
164 aa  137  1e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0190  Redoxin domain protein  35.15 
 
 
186 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.968687  normal  0.596413 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0196  Redoxin domain protein  34.13 
 
 
185 aa  127  9.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0104775 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1569  putative thioredoxin  36.5 
 
 
167 aa  124  8.000000000000001e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000853418  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0333  putative transmembrane protein  37.09 
 
 
213 aa  122  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.847937  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1278  redoxin domain-containing protein  39.1 
 
 
167 aa  122  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0206  Redoxin domain protein  39.57 
 
 
167 aa  121  3e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0318  hypothetical protein  39.57 
 
 
166 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0164115  normal  0.0202423 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0233  thioredoxin-like protein  32.73 
 
 
179 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0217  redoxin domain-containing protein  36.43 
 
 
171 aa  117  6e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.219465 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0405  redoxin domain-containing protein  33.78 
 
 
203 aa  117  7e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0284  putative transmembrane protein  36.15 
 
 
178 aa  117  9e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0270  putative transmembrane protein  35 
 
 
174 aa  114  6.9999999999999995e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0287  Redoxin domain protein  34.53 
 
 
167 aa  114  7.999999999999999e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.610229  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0292  redoxin domain-containing protein  34.53 
 
 
167 aa  114  7.999999999999999e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000102715 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4901  Redoxin domain protein  33.57 
 
 
165 aa  112  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.273187  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0521  Redoxin domain protein  33.33 
 
 
176 aa  112  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.037804  normal  0.85402 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0247  Redoxin domain protein  38.06 
 
 
165 aa  112  3e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.549118  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4194  putative thiol-disulfide isomerase and thioredoxins  34.06 
 
 
176 aa  112  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.462178 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4046  redoxin domain-containing protein  38 
 
 
166 aa  112  3e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000205313 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0228  redoxin domain-containing protein  31.55 
 
 
174 aa  111  6e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.454071  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0350  redoxin domain-containing protein  34.53 
 
 
168 aa  109  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00112402 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0402  hypothetical protein  32.86 
 
 
178 aa  105  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0433  redoxin domain-containing protein  32.86 
 
 
179 aa  105  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0181  alkyl hydroperoxide reductase  36.03 
 
 
183 aa  104  5e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0243778  normal  0.461108 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6212  Thiol-disulfide isomerase/thioredoxin-like  31.91 
 
 
194 aa  104  6e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2925  redoxin domain-containing protein  32.14 
 
 
178 aa  104  7e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0200  hypothetical protein  32.86 
 
 
178 aa  103  8e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3225  hypothetical protein  32.86 
 
 
178 aa  103  8e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0643  resA domain-containing protein  32.86 
 
 
178 aa  103  8e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.826532  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0459  putative thiol-disulfide oxidoreductase  32.86 
 
 
178 aa  103  8e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2787  redoxin domain-containing protein  32.14 
 
 
178 aa  103  8e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.787444  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0479  putative thiol-disulfide oxidoreductase  32.86 
 
 
178 aa  103  8e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2819  hypothetical protein  32.86 
 
 
178 aa  103  8e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1393  hypothetical protein  32.86 
 
 
178 aa  103  8e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2881  redoxin domain-containing protein  31.43 
 
 
178 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2256  redoxin  31.43 
 
 
178 aa  102  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.087584  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2870  redoxin domain-containing protein  31.43 
 
 
178 aa  102  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0218082  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1257  resA domain-containing protein  33.75 
 
 
165 aa  95.9  3e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0760  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.93 
 
 
228 aa  92  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.173874 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0506  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  36.91 
 
 
175 aa  90.9  8e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0010915  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0048  Redoxin domain protein  32.88 
 
 
172 aa  90.5  9e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0534182  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0047  hypothetical protein  32.88 
 
 
165 aa  90.5  9e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.147207  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4444  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.93 
 
 
196 aa  90.5  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.133035 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3911  hypothetical protein  31.71 
 
 
189 aa  89.7  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5686  redoxin domain-containing protein  35 
 
 
186 aa  87  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.131775 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3927  thioredoxin-like  31.91 
 
 
174 aa  87  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.298512  normal  0.186192 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1598  thiol-disulfide oxidoreductase  26.59 
 
 
173 aa  84  8e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.966744  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1356  thiol-disulfide oxidoreductase  26.59 
 
 
173 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1890  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.68 
 
 
171 aa  83.2  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.326681  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2053  Redoxin domain protein  31.72 
 
 
589 aa  82.4  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0186949  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1396  thiol-disulfide oxidoreductase  26.01 
 
 
173 aa  82  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0547  peroxiredoxin-like protein  34.85 
 
 
168 aa  81.6  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2205  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.67 
 
 
232 aa  81.3  0.000000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000183966 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3817  thiol-disulfide oxidoreductase  27.17 
 
 
173 aa  80.9  0.000000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000518727 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1383  thiol-disulfide oxidoreductase  27.17 
 
 
173 aa  80.9  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1494  thiol-disulfide oxidoreductase  27.17 
 
 
173 aa  80.9  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3069  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.01 
 
 
609 aa  80.9  0.000000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0869014  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2724  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.3 
 
 
188 aa  80.5  0.000000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.32328  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2277  Redoxin domain protein  30.34 
 
 
591 aa  80.1  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.182569  normal  0.459267 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5325  redoxin domain-containing protein  31.72 
 
 
592 aa  80.5  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.472956 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6172  Redoxin domain protein  26.92 
 
 
187 aa  80.1  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17970  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  32.88 
 
 
203 aa  79.3  0.00000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2118  thioredoxin  34.43 
 
 
164 aa  79.7  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1634  thiol-disulfide oxidoreductase  28.65 
 
 
173 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1566  thiol-disulfide oxidoreductase  26.59 
 
 
173 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.62392e-19 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1155  redoxin  35.09 
 
 
137 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1528  thiol-disulfide oxidoreductase  27.17 
 
 
173 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1049  thioredoxin  26.54 
 
 
167 aa  79  0.00000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0816  putative transmembrane protein  29.66 
 
 
622 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.420472 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2006  redoxin domain-containing protein  31.2 
 
 
176 aa  78.6  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0112011  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4602  Redoxin domain protein  31.01 
 
 
188 aa  78.2  0.00000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0530  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.85 
 
 
168 aa  78.2  0.00000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.120927  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0861  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.62 
 
 
189 aa  78.2  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.155376  hitchhiker  0.00638708 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1954  thioredoxin  35.38 
 
 
184 aa  77.8  0.00000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2276  Redoxin domain protein  31.06 
 
 
171 aa  77.4  0.00000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2000  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.38 
 
 
173 aa  77.4  0.00000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.236605  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1857  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.23 
 
 
280 aa  77.4  0.00000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0539  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  28.28 
 
 
435 aa  77.4  0.00000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1355  thiol-disulfide oxidoreductase  26.29 
 
 
173 aa  77  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3412  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.56 
 
 
169 aa  77  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3280  thioredoxin-related protein  27.85 
 
 
171 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03915  putative thiol:disulfide interchange protein  34.36 
 
 
185 aa  76.6  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5424  redoxin domain-containing protein  31.03 
 
 
604 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0325  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.95 
 
 
189 aa  76.3  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0365546 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0212  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.14 
 
 
175 aa  75.9  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1860  cytochrome c biogenesis protein, thiol-disulfide interchange protein  33.59 
 
 
173 aa  76.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2085  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.38 
 
 
173 aa  75.9  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4497  Redoxin domain protein  28.97 
 
 
691 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1843  thioredoxin-like  30.12 
 
 
164 aa  76.6  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2219  redoxin domain-containing protein  29.32 
 
 
171 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.231269  hitchhiker  0.0012501 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1170  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30.34 
 
 
596 aa  75.5  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.623408 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3474  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.69 
 
 
169 aa  75.5  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.163841 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3942  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.45 
 
 
455 aa  75.9  0.0000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0451  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like  30.71 
 
 
180 aa  75.1  0.0000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>