24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0069 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0069  hypothetical protein  100 
 
 		 434 aa  899    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6394  hypothetical protein  32.72 
 
 		 687 aa  172  1e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0679  cytochrome c family protein  23.03 
 
 		 490 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0867  cytochrome c family protein  24.07 
 
 		 485 aa  67  0.0000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.473652  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2376  hypothetical protein  22.61 
 
 		 457 aa  65.9  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0331555  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2674  hypothetical protein  29.32 
 
 		 412 aa  65.1  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0789864  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2801  cytochrome c family protein  24.69 
 
 		 488 aa  61.2  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.885444  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3444  hypothetical protein  26.43 
 
 		 459 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.166801  normal  0.529515 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1584  hypothetical protein  19.75 
 
 		 595 aa  58.2  0.0000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2087  hypothetical protein  22.6 
 
 		 442 aa  58.2  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000422239  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1710  cytochrome c family protein  23.78 
 
 		 490 aa  57.8  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00235547  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1643  cytochrome c family protein  25.26 
 
 		 467 aa  55.5  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0534  cytochrome c family protein  25 
 
 		 324 aa  54.7  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0422268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2450  hypothetical protein  23.27 
 
 		 408 aa  54.7  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1439  hypothetical protein  28.99 
 
 		 663 aa  52.4  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3059  hypothetical protein  27.47 
 
 		 386 aa  52.4  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1063  hypothetical protein  23.11 
 
 		 640 aa  51.2  0.00003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000914446  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4120  hypothetical protein  24.05 
 
 		 324 aa  49.3  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.609345 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2937  cytochrome c family protein  24.58 
 
 		 324 aa  48.9  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1762  hypothetical protein  22.16 
 
 		 305 aa  48.9  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2276  hypothetical protein  26.03 
 
 		 735 aa  48.5  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4639  hypothetical protein  24.4 
 
 		 536 aa  45.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1754  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.58 
 
 		 906 aa  44.3  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.255136  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1692  hypothetical protein  21.8 
 
 		 392 aa  43.5  0.008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>