25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4968 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_4968  YxaI  100 
 
 		 77 aa  158  3e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1788  RDD domain containing protein  45.95 
 
 		 187 aa  63.9  0.0000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0098202  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1706  RDD  44.59 
 
 		 170 aa  62.4  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.305495  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1213  RDD  43.59 
 
 		 176 aa  62.4  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0799296  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0277  RDD domain containing protein  43.42 
 
 		 217 aa  60.5  0.000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.666159  normal  0.0986894 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0075  RDD domain-containing protein  41.89 
 
 		 185 aa  59.3  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0306278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1364  RDD domain-containing protein  43.24 
 
 		 186 aa  58.9  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000121263  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0170  RDD domain-containing protein  46.58 
 
 		 145 aa  57.8  0.00000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.00000000534855  decreased coverage  0.00967799 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1148  RDD domain containing protein  42.67 
 
 		 185 aa  56.6  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00101829  hitchhiker  0.000000000000525817 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3590  RDD domain containing protein  46.97 
 
 		 310 aa  54.7  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1223  RDD domain containing protein  43.24 
 
 		 202 aa  53.5  0.0000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0171  RDD domain-containing protein  43.24 
 
 		 140 aa  52.8  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000652856  decreased coverage  0.0096302 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04050  RDD family protein  39.51 
 
 		 424 aa  50.8  0.000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2609  serine/threonine protein kinase  39.44 
 
 		 415 aa  50.1  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.101255 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3591  hypothetical protein  39.44 
 
 		 133 aa  48.5  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.157612  normal  0.0949488 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2289  RDD domain-containing protein  42.25 
 
 		 202 aa  46.6  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2608  RDD domain-containing protein  29.25 
 
 		 456 aa  46.6  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.107491 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3583  MJ0042 family finger-like protein  42.03 
 
 		 295 aa  43.5  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.040814  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3457  RDD domain containing protein  35.14 
 
 		 205 aa  42.4  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.052067 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0726  RDD domain containing protein  35.38 
 
 		 156 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1340  serine/threonine protein kinase  37.88 
 
 		 536 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.975368 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2713  RDD domain containing protein  34.85 
 
 		 159 aa  41.2  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2416  hypothetical protein  35.38 
 
 		 270 aa  41.6  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0678  RDD domain-containing protein  36.62 
 
 		 157 aa  40.8  0.006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.416032  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0399  RDD domain-containing protein  37.84 
 
 		 278 aa  40  0.01  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0177068 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>