More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1365 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_1365  Holliday junction DNA helicase RuvB  100 
 
 		 386 aa  785    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.191372  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1892  Holliday junction DNA helicase RuvB  67.45 
 
 		 371 aa  533  1e-150  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.912644  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1008  Holliday junction DNA helicase RuvB  66.93 
 
 		 366 aa  528  1e-149  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000228051  hitchhiker  0.00140746 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0835  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.89 
 
 		 375 aa  519  1e-146  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0909626  normal  0.910265 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2503  Holliday junction DNA helicase RuvB  66.67 
 
 		 370 aa  517  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.54699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3579  Holliday junction DNA helicase RuvB  67.05 
 
 		 360 aa  491  1e-137  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2534  Holliday junction DNA helicase RuvB  67.05 
 
 		 360 aa  491  1e-137  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.113994 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1554  Holliday junction DNA helicase RuvB  72.35 
 
 		 366 aa  480  1e-134  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0582053 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01931  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.87 
 
 		 398 aa  395  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0118  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.27 
 
 		 348 aa  397  1e-109  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0130464 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1662  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.07 
 
 		 344 aa  395  1e-109  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.280554  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0162  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.06 
 
 		 347 aa  390  1e-107  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02690  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.56 
 
 		 334 aa  391  1e-107  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000554774  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3832  Holliday junction DNA helicase RuvB  56 
 
 		 351 aa  390  1e-107  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0927  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.19 
 
 		 333 aa  390  1e-107  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1111  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.1 
 
 		 336 aa  388  1e-107  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000117425  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4657  Holliday junction DNA helicase RuvB  56 
 
 		 354 aa  385  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12310  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.56 
 
 		 342 aa  385  1e-106  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0273996  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4093  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.38 
 
 		 354 aa  386  1e-106  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01831  Holliday junction DNA helicase B  55.87 
 
 		 336 aa  383  1e-105  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.144977  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1780  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.87 
 
 		 336 aa  383  1e-105  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000115623  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1326  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.87 
 
 		 336 aa  383  1e-105  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0442858  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4315  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.63 
 
 		 336 aa  382  1e-105  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0417721  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2108  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.6 
 
 		 336 aa  383  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.252002  normal  0.279118 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1230  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.6 
 
 		 336 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0225142  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1354  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.6 
 
 		 336 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00473129 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1796  Holliday junction DNA helicase subunit RuvB  55.42 
 
 		 341 aa  382  1e-105  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000827733 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2596  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.87 
 
 		 336 aa  383  1e-105  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0158351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3694  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.38 
 
 		 356 aa  384  1e-105  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.500554  normal  0.619697 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20671  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.01 
 
 		 356 aa  383  1e-105  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4650  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.63 
 
 		 333 aa  382  1e-105  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000830982  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0528  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.33 
 
 		 338 aa  383  1e-105  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3954  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.06 
 
 		 363 aa  382  1e-105  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0150024 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0820  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.02 
 
 		 358 aa  381  1e-105  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.163531  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4500  Holliday junction DNA helicase RuvA  56.63 
 
 		 541 aa  382  1e-105  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000049576 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0696  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.93 
 
 		 333 aa  382  1e-105  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000306713  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0499  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.08 
 
 		 356 aa  381  1e-105  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.456698  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2048  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.6 
 
 		 336 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.79761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1772  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.87 
 
 		 336 aa  383  1e-105  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0145511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2053  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.6 
 
 		 336 aa  383  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0123486  normal  0.169016 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1953  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.87 
 
 		 336 aa  383  1e-105  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.128474  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01819  hypothetical protein  55.87 
 
 		 336 aa  383  1e-105  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.146272  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2090  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.87 
 
 		 336 aa  383  1e-105  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000376613  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0612  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.72 
 
 		 351 aa  382  1e-105  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0956  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.87 
 
 		 336 aa  383  1e-105  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00553774  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1223  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.69 
 
 		 345 aa  381  1e-104  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.15164  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4505  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.63 
 
 		 333 aa  380  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00121958  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3625  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.65 
 
 		 348 aa  379  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.528643  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4153  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.63 
 
 		 336 aa  380  1e-104  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000576232  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4164  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.63 
 
 		 336 aa  380  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000669292  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4539  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.63 
 
 		 333 aa  381  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000348871  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1192  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.7 
 
 		 356 aa  381  1e-104  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1700  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.75 
 
 		 336 aa  379  1e-104  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.979156 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1334  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.62 
 
 		 336 aa  380  1e-104  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00146189  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4237  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.12 
 
 		 354 aa  379  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.913769  normal  0.279005 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2429  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.68 
 
 		 336 aa  381  1e-104  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00769793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1848  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.52 
 
 		 350 aa  381  1e-104  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.9139  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3137  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.33 
 
 		 333 aa  379  1e-104  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000701371  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2075  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.33 
 
 		 337 aa  379  1e-104  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1227  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.24 
 
 		 361 aa  380  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0327  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.91 
 
 		 355 aa  379  1e-104  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.382015 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01559  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.54 
 
 		 345 aa  380  1e-104  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192423  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4267  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.23 
 
 		 333 aa  380  1e-104  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000359024  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0415  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.17 
 
 		 339 aa  378  1e-104  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3316  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.69 
 
 		 337 aa  379  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4554  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.63 
 
 		 333 aa  380  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00514849  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2303  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.43 
 
 		 334 aa  375  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00841978  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2419  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.43 
 
 		 334 aa  375  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000499721  normal  0.0284883 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17401  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.19 
 
 		 348 aa  375  1e-103  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0500  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.15 
 
 		 357 aa  378  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.951437  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2117  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.82 
 
 		 337 aa  377  1e-103  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0512  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.46 
 
 		 356 aa  378  1e-103  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0376  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.54 
 
 		 357 aa  376  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0391  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.54 
 
 		 357 aa  376  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234892  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2254  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.15 
 
 		 336 aa  376  1e-103  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.442395  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0894  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.86 
 
 		 340 aa  376  1e-103  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00558721  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2557  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.99 
 
 		 363 aa  377  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.829542  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2145  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.82 
 
 		 334 aa  377  1e-103  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.189271  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2030  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.49 
 
 		 334 aa  375  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000959876  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2143  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.49 
 
 		 334 aa  375  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000101223  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0930  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.38 
 
 		 337 aa  376  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08899e-19 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2044  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.73 
 
 		 334 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00121057  hitchhiker  0.0000000744022 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2776  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.52 
 
 		 334 aa  376  1e-103  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00115584  normal  0.033156 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2321  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.05 
 
 		 338 aa  375  1e-103  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0801363  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3346  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.87 
 
 		 354 aa  375  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.729811  hitchhiker  0.00070323 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1077  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.25 
 
 		 338 aa  372  1e-102  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.413326  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2429  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.43 
 
 		 334 aa  372  1e-102  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0483  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.54 
 
 		 352 aa  373  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2034  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.27 
 
 		 338 aa  372  1e-102  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0438556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1889  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.06 
 
 		 337 aa  372  1e-102  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2719  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.63 
 
 		 347 aa  372  1e-102  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0182  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.92 
 
 		 330 aa  372  1e-102  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.107724  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0615  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.42 
 
 		 355 aa  372  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.318212 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1883  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.43 
 
 		 337 aa  374  1e-102  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.679092  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1272  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.77 
 
 		 350 aa  374  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.197391  normal  0.338771 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1939  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.43 
 
 		 334 aa  374  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00566974  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1704  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.15 
 
 		 343 aa  374  1e-102  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0360063  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2042  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.43 
 
 		 334 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000113724  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2571  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.87 
 
 		 338 aa  374  1e-102  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.011868  hitchhiker  0.00180359 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1957  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.43 
 
 		 334 aa  374  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0904224  normal  0.777155 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>