31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1698 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1698  hypothetical protein  100 
 
 		 922 aa  1880    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1752  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  29.41 
 
 		 940 aa  303  9e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.894533 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1977  putative DNA repair protein  28.99 
 
 		 913 aa  296  9e-79  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.286475 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0987  hypothetical protein  29.21 
 
 		 911 aa  296  2e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000754464  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0972  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  29.69 
 
 		 916 aa  279  1e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00798755 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0467  hypothetical protein  28.99 
 
 		 912 aa  277  9e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1709  hypothetical protein  30.12 
 
 		 896 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000066453  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0722  hypothetical protein  28.25 
 
 		 930 aa  255  2.0000000000000002e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.851206  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3621  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  26.81 
 
 		 906 aa  245  1.9999999999999999e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.221768  normal  0.652305 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1314  ATP-dependent nuclease subunit B  27.6 
 
 		 872 aa  236  1.0000000000000001e-60  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00191673  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1374  hypothetical protein  26.41 
 
 		 862 aa  235  3e-60  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000886385  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2195  hypothetical protein  29.56 
 
 		 858 aa  220  1e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2223  hypothetical protein  28.82 
 
 		 858 aa  216  1.9999999999999998e-54  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2004  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  26.84 
 
 		 935 aa  195  4e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1998  helicase  24.32 
 
 		 993 aa  63.9  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.138335  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4179  ATP-dependent nuclease subunit B  24.24 
 
 		 951 aa  63.5  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0186449 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03200  hypothetical protein  24.71 
 
 		 911 aa  63.5  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.358674  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0385  hypothetical protein  19.72 
 
 		 786 aa  54.7  0.000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.412498  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1562  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  28.42 
 
 		 957 aa  54.3  0.000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0088  hypothetical protein  20.94 
 
 		 781 aa  52  0.00005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.217564  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0479  ATP-dependent nuclease subunit B-like  23.99 
 
 		 908 aa  51.2  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.236866  hitchhiker  0.000840779 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1587  hypothetical protein  24.72 
 
 		 997 aa  50.1  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2040  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  30.64 
 
 		 1146 aa  49.3  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1775  ATP-dependent nuclease subunit B  28.41 
 
 		 1149 aa  48.1  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1829  hypothetical protein  21.74 
 
 		 788 aa  46.6  0.002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.423033  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0978  hypothetical protein  24.51 
 
 		 1000 aa  46.6  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.263512  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00780  hypothetical protein  28.25 
 
 		 990 aa  46.6  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0381  hypothetical protein  23.4 
 
 		 794 aa  45.8  0.003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0210586  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2680  double-strand break repair protein AddB  25.44 
 
 		 991 aa  45.8  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0085  UvrD/REP helicase  29.87 
 
 		 1016 aa  45.8  0.004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.60174  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2324  exonuclease-like protein  23.31 
 
 		 864 aa  44.3  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.884454  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>