More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1179 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1179  Fur family ferric uptake regulator  100 
 
 		 142 aa  287  3e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.462177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2340  ferric uptake regulator family protein  72.31 
 
 		 135 aa  204  4e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0648274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3230  ferric uptake regulator, Fur family  66.42 
 
 		 150 aa  190  6e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0854036  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0856  zinc uptake regulator  64.06 
 
 		 129 aa  179  1e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.763265  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0734  ferric uptake regulator, Fur family  65.85 
 
 		 123 aa  175  2e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.264881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2171  ferric uptake regulator, Fur family  58.2 
 
 		 133 aa  151  2e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00854605  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3370  ferric uptake regulator, Fur family  59.7 
 
 		 167 aa  150  4e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.073099  normal  0.112136 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1599  ferric uptake regulator, Fur family  59.68 
 
 		 135 aa  150  5.9999999999999996e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.4089  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1536  ferric uptake regulator, Fur family  53.17 
 
 		 130 aa  147  5e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.451133  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1772  ferric uptake regulator, Fur family  56.56 
 
 		 141 aa  147  7e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.431388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7263  ferric uptake regulator family protein  55.65 
 
 		 175 aa  145  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0956308 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0061  zinc uptake regulator  53.23 
 
 		 142 aa  145  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2717  ferric uptake regulator family protein  56.25 
 
 		 134 aa  144  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.519221 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2745  ferric uptake regulator, Fur family  56.2 
 
 		 138 aa  142  1e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3820  ferric uptake regulator family protein  57.72 
 
 		 131 aa  142  1e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.396621  normal  0.536437 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12385  ferric uptake regulation protein furB  56.2 
 
 		 130 aa  140  5e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.473792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7037  ferric uptake regulator, Fur family  57.98 
 
 		 150 aa  140  5e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13650  zinc uptake regulator, Fur family  56.78 
 
 		 136 aa  140  6e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.357837 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1934  zinc uptake regulator  55.37 
 
 		 135 aa  140  8e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.395595  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1261  ferric uptake regulator, Fur family  60.16 
 
 		 141 aa  139  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13670  zinc uptake regulator, Fur family  58.87 
 
 		 142 aa  139  1.9999999999999998e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.557708 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3458  zinc uptake regulator  54.03 
 
 		 131 aa  137  7e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.455544  normal  0.210399 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3447  zinc uptake regulator  54.03 
 
 		 131 aa  137  7e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0819749  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07800  zinc uptake regulator, Fur family  55.37 
 
 		 148 aa  137  7e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3510  zinc uptake regulator  54.03 
 
 		 131 aa  137  7e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.11469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2730  ferric uptake regulator family protein  52.03 
 
 		 150 aa  135  1e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.14088 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2085  zinc uptake regulator  52.85 
 
 		 138 aa  135  2e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17110  zinc uptake regulator, Fur family  52 
 
 		 138 aa  134  4e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.184262  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2638  zinc uptake regulator  49.23 
 
 		 154 aa  134  5e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.777884  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4538  ferric uptake regulator family protein  53.54 
 
 		 134 aa  133  8e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0148082  normal  0.344615 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2543  ferric-uptake regulator  51.22 
 
 		 187 aa  133  8e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.37741  normal  0.402703 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0066  ferric uptake regulator, Fur family  50 
 
 		 137 aa  133  9e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11800  zinc uptake regulator, Fur family  50.82 
 
 		 129 aa  132  9.999999999999999e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00894406  normal  0.765019 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2373  ferric uptake regulator, Fur family  50.81 
 
 		 154 aa  130  6e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000416204 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3150  ferric-uptake regulator  58.49 
 
 		 137 aa  127  7.000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.517881  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0885  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  49.62 
 
 		 142 aa  124  6e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0293678  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1040  transcriptional regulator, Fur family  47.11 
 
 		 134 aa  117  3.9999999999999996e-26  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2442  ferric uptake regulator, Fur family  41.6 
 
 		 131 aa  108  3e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000168746 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3508  ferric uptake regulator  33.33 
 
 		 134 aa  85.9  2e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0405  ferric uptake regulator family protein  33.06 
 
 		 134 aa  82.8  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.165057 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4383  ferric uptake regulator, Fur family  33.33 
 
 		 132 aa  81.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.134348 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1493  ferric uptake regulator family protein  34.43 
 
 		 146 aa  80.1  0.000000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000138692  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2248  ferric uptake regulator, Fur family  36 
 
 		 133 aa  79.7  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0111232 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0546  ferric uptake regulator family protein  33.88 
 
 		 139 aa  79.7  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1952  negative regulator of ferric uptake  30.65 
 
 		 143 aa  79  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0817  ferric uptake regulator family protein  33.33 
 
 		 130 aa  78.6  0.00000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2509  ferric uptake regulator  35.64 
 
 		 143 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000631479  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2502  ferric uptake regulator  35.64 
 
 		 143 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000739379  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1842  ferric uptake regulator  35.64 
 
 		 143 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000255764  normal  0.0169118 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2622  ferric uptake regulator  35.64 
 
 		 143 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000743772  normal  0.0672977 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3002  ferric uptake regulator family protein  29.75 
 
 		 153 aa  77  0.00000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000499535  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2295  ferric uptake regulator family protein  32.86 
 
 		 159 aa  77  0.00000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2043  ferric uptake regulator family protein  28.69 
 
 		 144 aa  76.6  0.00000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1953  ferric uptake regulator family protein  32.23 
 
 		 131 aa  76.6  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00726041 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4413  ferric uptake regulator, Fur family  36.43 
 
 		 147 aa  76.6  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00116957  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2859  ferric-uptake regulator  37.4 
 
 		 140 aa  75.9  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0644498  normal  0.141734 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2902  ferric uptake regulator  34.71 
 
 		 148 aa  74.7  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  2.30182e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01339  ferric uptake regulator  33.59 
 
 		 149 aa  75.5  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2991  ferric uptake regulator  34.71 
 
 		 148 aa  74.7  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00139405  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0842  ferric uptake regulator, Fur family  34.83 
 
 		 152 aa  75.1  0.0000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2263  ferric uptake regulator  34.65 
 
 		 143 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1434  ferric uptake regulator  34.65 
 
 		 161 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000031646  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1379  ferric uptake regulation protein Fur  28.93 
 
 		 143 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.404925  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4174  ferric uptake regulator, Fur family  32.28 
 
 		 132 aa  74.7  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4134  ferric uptake regulator, Fur family  32.28 
 
 		 132 aa  74.7  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1364  ferric uptake regulator, Fur family  28.69 
 
 		 152 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1796  ferric uptake regulator  33.66 
 
 		 143 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0654147  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2147  ferric uptake regulation protein  29.23 
 
 		 155 aa  74.3  0.0000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000154091  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1587  ferric uptake regulator, Fur family  31.4 
 
 		 143 aa  74.3  0.0000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000012945  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2676  ferric uptake regulator family protein  28.12 
 
 		 148 aa  73.9  0.0000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05900  ferric uptake regulator, Fur family  28.12 
 
 		 145 aa  73.6  0.0000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000248432  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3367  ferric uptake regulator family protein  30.77 
 
 		 149 aa  73.9  0.0000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2939  ferric uptake regulator, Fur family  33.62 
 
 		 148 aa  73.6  0.0000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0253838  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00640  ferric uptake regulator  33.61 
 
 		 148 aa  72.8  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0211931  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2954  ferric uptake regulator, Fur family  33.61 
 
 		 148 aa  72.8  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000269107  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2973  ferric uptake regulator  33.61 
 
 		 148 aa  72.8  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00611688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1557  ferric uptake regulation protein  29.23 
 
 		 157 aa  73.2  0.000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.754844  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0705  ferric uptake regulator  33.61 
 
 		 148 aa  72.8  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000882448  normal  0.763196 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00631  hypothetical protein  33.61 
 
 		 148 aa  72.8  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0172811  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0449  ferric uptake regulation protein  29.23 
 
 		 157 aa  72.8  0.000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.270092  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0322  ferric uptake regulator  34.71 
 
 		 148 aa  73.6  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000135806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0567  ferric uptake regulator  33.61 
 
 		 148 aa  72.8  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000138653  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0778  ferric uptake regulator  33.61 
 
 		 148 aa  72.8  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000701006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1661  ferric uptake regulator  33.66 
 
 		 143 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000966153  normal  0.373988 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1562  ferric uptake regulator, Fur family  31.71 
 
 		 147 aa  73.2  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0224  putative iron-regulated membrane protein  29.23 
 
 		 155 aa  73.2  0.000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0730  ferric uptake regulator  33.61 
 
 		 148 aa  72.8  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000177584  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0650  ferric uptake regulator family protein  30.4 
 
 		 144 aa  72.8  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000137697  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0423  ferric uptake regulation protein  29.23 
 
 		 157 aa  73.2  0.000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00356258  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0711  ferric uptake regulator  33.61 
 
 		 148 aa  72.8  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000960215  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1236  ferric uptake regulator  36.89 
 
 		 148 aa  73.2  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000206726  normal  0.895859 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0800  ferric uptake regulator  33.61 
 
 		 150 aa  72.8  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00301514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0021  ferric uptake regulator, Fur family  32.2 
 
 		 142 aa  72  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.531166 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0813  ferric uptake regulator  33.61 
 
 		 150 aa  72.8  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000465454  normal  0.444337 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0849  ferric uptake regulator  33.61 
 
 		 150 aa  72.8  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000679753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0603  ferric uptake regulator, Fur family  29.23 
 
 		 154 aa  72.4  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1842  ferric uptake regulator  33.66 
 
 		 143 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000122874  normal  0.0218944 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0740  ferric uptake regulator  33.61 
 
 		 150 aa  72.8  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000969196  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0752  ferric uptake regulator  33.61 
 
 		 150 aa  72.8  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000171486  normal  0.37739 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2468  ferric uptake regulator, Fur family  28.46 
 
 		 146 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0653957  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>