More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2399 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  100 
 
 		 138 aa  286  5.0000000000000004e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1122  rhodanese-like protein  49.26 
 
 		 141 aa  126  1.0000000000000001e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1543  Rhodanese domain protein  45.99 
 
 		 138 aa  123  8.000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.973949  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  42.34 
 
 		 145 aa  121  3e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0611  rhodanese-like protein  43.17 
 
 		 141 aa  120  6e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0229  Rhodanese domain protein  42.14 
 
 		 140 aa  119  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479162  hitchhiker  0.0025446 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2187  rhodanese-like protein  46.72 
 
 		 135 aa  116  9e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2827  Rhodanese domain protein  44.85 
 
 		 135 aa  116  9.999999999999999e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0354  hypothetical protein  40.71 
 
 		 151 aa  114  3e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.842496  normal  0.122714 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0210  Rhodanese domain protein  41.43 
 
 		 140 aa  113  6.9999999999999995e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.158606 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3285  rhodanese domain-containing protein  42.34 
 
 		 141 aa  113  7.999999999999999e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  43.38 
 
 		 142 aa  113  7.999999999999999e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1310  rhodanese-like protein  43.38 
 
 		 135 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.649013  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0267  rhodanese domain-containing protein  40 
 
 		 161 aa  111  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.968437  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4102  Rhodanese domain protein  41.18 
 
 		 138 aa  110  9e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25625  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0887  rhodanese-like protein  43.17 
 
 		 136 aa  109  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.726229  normal  0.333017 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2364  rhodanese-like domain protein  41.18 
 
 		 141 aa  108  3e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0714  putative transmembrane protein  43.48 
 
 		 138 aa  108  3e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.274241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1997  Rhodanese domain protein  41.18 
 
 		 141 aa  108  3e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.885175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0535  Rhodanese domain protein  38.46 
 
 		 141 aa  108  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3857  rhodanese domain-containing protein  40 
 
 		 135 aa  107  6e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.848576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0928  rhodanese domain-containing protein  41.41 
 
 		 128 aa  107  7.000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.585499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1955  rhodanese-like protein  38.41 
 
 		 149 aa  106  9.000000000000001e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000116942  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1412  rhodanese-like domain-containing protein  39.01 
 
 		 135 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2839  rhodanese-like domain-containing protein  39.01 
 
 		 135 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3207  rhodanese-like domain-containing protein  39.01 
 
 		 135 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0663  rhodanese-like domain-containing protein  39.01 
 
 		 135 aa  106  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0180  rhodanese-like domain-containing protein  39.01 
 
 		 135 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4180  putative rhodanese-related sulfurtransferase  37.76 
 
 		 141 aa  106  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0479  rhodanese domain-containing protein  39.01 
 
 		 135 aa  105  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0498  rhodanese domain-containing protein  39.01 
 
 		 135 aa  105  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0417  rhodanese-like domain-containing protein  38.3 
 
 		 135 aa  105  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.764861  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0039  rhodanese domain-containing protein  37.5 
 
 		 135 aa  104  4e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.861184  normal  0.831321 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  52.81 
 
 		 145 aa  103  5e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0305  rhodanese-like protein  40.58 
 
 		 137 aa  103  9e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3504  rhodanese domain-containing protein  44.12 
 
 		 135 aa  103  9e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.64144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0447  rhodanese domain-containing protein  36.69 
 
 		 140 aa  102  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.185748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  49.02 
 
 		 132 aa  101  3e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0717  rhodanese domain-containing protein  36.76 
 
 		 144 aa  100  8e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1814  rhodanese domain-containing protein  40 
 
 		 135 aa  100  9e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.315882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  51.69 
 
 		 269 aa  99.8  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6185  rhodanese-like protein  34.53 
 
 		 140 aa  99.8  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2911  rhodanese domain-containing protein  34.53 
 
 		 140 aa  99.4  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2349  Rhodanese domain protein  37.96 
 
 		 141 aa  98.2  4e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000398103  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2773  rhodanese domain-containing protein  33.81 
 
 		 140 aa  97.8  5e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2242  rhodanese-like protein  33.81 
 
 		 140 aa  97.4  5e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.98062  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2633  Rhodanese domain protein  55.95 
 
 		 123 aa  97.4  5e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2856  rhodanese domain-containing protein  33.81 
 
 		 140 aa  97.4  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2867  rhodanese domain-containing protein  33.81 
 
 		 140 aa  97.4  6e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3805  rhodanese domain-containing protein  39.13 
 
 		 170 aa  96.3  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.715987 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4469  rhodanese domain-containing protein  42.03 
 
 		 144 aa  96.7  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345024 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3515  rhodanese domain-containing protein  37.5 
 
 		 140 aa  95.1  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00152607 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4876  rhodanese domain-containing protein  41.3 
 
 		 144 aa  95.5  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2570  rhodanese domain-containing protein  37.41 
 
 		 151 aa  95.1  3e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0116994 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0744  rhodanese domain-containing protein  44.66 
 
 		 133 aa  95.1  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.547874 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3210  rhodanese domain-containing protein  38.93 
 
 		 142 aa  94.7  4e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.307395 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0495  hypothetical protein  38.41 
 
 		 132 aa  93.6  8e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3836  rhodanese domain-containing protein  59.76 
 
 		 98 aa  92.4  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0206  Rhodanese domain protein  57.14 
 
 		 98 aa  91.7  3e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2642  SirA family protein  48.42 
 
 		 201 aa  91.3  4e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140879  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  47.73 
 
 		 123 aa  91.3  4e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4140  rhodanese domain-containing protein  39.13 
 
 		 144 aa  90.1  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.585965  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00543  rhodanese domain protein  35.04 
 
 		 141 aa  90.1  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0070  rhodanese domain-containing protein  39.13 
 
 		 144 aa  90.1  1e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0076  rhodanese domain-containing protein  39.13 
 
 		 144 aa  90.1  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0047  rhodanese-like protein  37.23 
 
 		 139 aa  88.6  3e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0124  Rhodanese-related sulfurtransferase-like protein  47.78 
 
 		 110 aa  88.2  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  50 
 
 		 113 aa  87.8  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0046  rhodanese domain-containing protein  36.44 
 
 		 144 aa  87  8e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000263421 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0052  rhodanese domain-containing protein  36.44 
 
 		 158 aa  87  9e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000103873 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1502  rhodanese domain-containing protein  49.46 
 
 		 113 aa  86.3  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.184229  normal  0.558017 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0213  Rhodanese domain protein  51.16 
 
 		 109 aa  85.9  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0044  rhodanese domain-containing protein  36.44 
 
 		 144 aa  85.9  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00248227 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3165  rhodanese domain-containing protein  34.78 
 
 		 138 aa  85.9  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2261  rhodanese domain-containing protein  44.55 
 
 		 279 aa  85.5  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01150  Rhodanese-related sulfurtransferase  51.16 
 
 		 107 aa  85.9  2e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2644  Rhodanese domain protein  50 
 
 		 102 aa  85.5  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00713239  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1704  putative sulfurtransferase  32.35 
 
 		 141 aa  85.1  3e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0463  rhodanese-related sulfurtransferase  32.35 
 
 		 144 aa  85.1  3e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4216  rhodanese domain-containing protein  35.25 
 
 		 144 aa  85.1  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0166  Rhodanese domain protein  48.98 
 
 		 115 aa  84.7  4e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.919693 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0050  rhodanese domain-containing protein  35.59 
 
 		 144 aa  84.3  5e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  53.09 
 
 		 130 aa  84  6e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2864  rhodanese-like domain-containing protein  49.37 
 
 		 109 aa  83.6  8e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2549  rhodanese-like domain-containing protein  49.37 
 
 		 109 aa  83.6  8e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01624  putative phage shock protein E  40.86 
 
 		 136 aa  83.6  9e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2894  rhodanese domain-containing protein  43.4 
 
 		 113 aa  82.8  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.127379  normal  0.672082 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0226  Rhodanese domain protein  41.75 
 
 		 113 aa  83.2  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0061  Rhodanese domain protein  53.16 
 
 		 277 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2803  hypothetical protein  31.39 
 
 		 145 aa  82.8  0.000000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4512  rhodanese domain-containing protein  47.19 
 
 		 111 aa  83.2  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0041  rhodanese domain-containing protein  35.59 
 
 		 144 aa  82  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2228  hypothetical protein  32.61 
 
 		 144 aa  82  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0607832  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1149  Rhodanese domain protein  37.74 
 
 		 121 aa  82.4  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000462843  hitchhiker  0.00000263083 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  45.98 
 
 		 189 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4020  rhodanese domain-containing protein  34.78 
 
 		 144 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3697  rhodanese-like protein  34.06 
 
 		 144 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1167  beta-lactamase domain protein  38.81 
 
 		 470 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.705193  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0692  rhodanese domain-containing protein  47.19 
 
 		 149 aa  81.3  0.000000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5472  beta-lactamase domain-containing protein  51.28 
 
 		 356 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.541734  normal  0.389446 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>