57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1799 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1799  long-chain fatty acid transport protein  100 
 
 		 455 aa  927    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.471886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0379  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  38.8 
 
 		 463 aa  258  2e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2202  SalD  35.64 
 
 		 430 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.476706  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1346  aromatic hydrocarbon degradation protein  33.19 
 
 		 391 aa  226  9e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000227507  hitchhiker  0.0000118499 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0576  putative long-chain fatty acid transport protein  34.84 
 
 		 400 aa  222  9.999999999999999e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00218092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0645  membrane protein involved in aromatic hydrocarbon degradation  32.34 
 
 		 438 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54968  normal  0.132324 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2203  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  30.39 
 
 		 422 aa  140  7e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.92236  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3199  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  29.33 
 
 		 394 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0555142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4111  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  28.26 
 
 		 418 aa  123  5e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.129657  normal  0.252995 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2180  long-chain fatty acid ABC transporter  27.23 
 
 		 381 aa  109  1e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000739013  hitchhiker  0.00000487757 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0053  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  26.25 
 
 		 471 aa  108  3e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2542  outer membrane protein, OMPP1/FadL/TodX family  27.33 
 
 		 447 aa  102  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0142574  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2170  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  27.33 
 
 		 447 aa  102  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.000000480388  decreased coverage  0.000000000685095 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2498  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  26.8 
 
 		 437 aa  101  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.953303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0032  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  25.72 
 
 		 466 aa  98.6  2e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3106  hypothetical protein  25.39 
 
 		 392 aa  98.2  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2330  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  24.35 
 
 		 475 aa  97.8  3e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.402524  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3997  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  25.06 
 
 		 410 aa  94.4  4e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0634877  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0843  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  24.89 
 
 		 472 aa  94  5e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3896  hypothetical protein  24.13 
 
 		 442 aa  93.6  7e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0428  OMPP1/FadL/TodX family toluene transport protein  26.73 
 
 		 422 aa  93.6  7e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000260266  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4038  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  23.93 
 
 		 410 aa  93.2  8e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.813812  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2776  putative transporter protein  26.17 
 
 		 384 aa  92.8  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.356239  normal  0.507851 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0024  toluene transport protein, putative  24.89 
 
 		 461 aa  90.9  5e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.137484  normal  0.133309 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0747  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  26.15 
 
 		 435 aa  88.6  2e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.000000000000126668  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1486  toluene transport protein, putative  24.74 
 
 		 473 aa  84.7  0.000000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000112602  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0456  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  23.72 
 
 		 462 aa  82.4  0.00000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000969908  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1467  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  24.47 
 
 		 468 aa  73.9  0.000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.524718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2053  aromatic hydrocarbon degradation protein  26.74 
 
 		 400 aa  73.6  0.000000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00000452049  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0821  long-chain fatty acid transport like protein  25.17 
 
 		 457 aa  72.8  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2883  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  24.62 
 
 		 453 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0398641 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3814  aromatic hydrocarbon degradation protein  25 
 
 		 464 aa  67  0.0000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.0090168  normal  0.0676668 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1800  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  21.9 
 
 		 424 aa  64.7  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.839799  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2901  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  23.84 
 
 		 460 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.875359  normal  0.623789 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0339  OMPP1/FadL/TodX family outer membrane protein  23.13 
 
 		 409 aa  64.3  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.746595  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4639  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  24.57 
 
 		 458 aa  63.9  0.000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.166851  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3563  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  24.57 
 
 		 458 aa  63.9  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.811834  normal  0.361655 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1535  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  22.97 
 
 		 453 aa  63.2  0.000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.745918 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0065  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  21.36 
 
 		 428 aa  60.8  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.709413 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2708  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  23.14 
 
 		 413 aa  58.5  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0589559 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1551  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  24.34 
 
 		 400 aa  57  0.0000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0286516  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1585  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  20 
 
 		 404 aa  56.6  0.0000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3558  Outer membrane protein (CymD)  25.43 
 
 		 460 aa  56.2  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0239673  normal  0.823203 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0104  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  21.56 
 
 		 439 aa  55.8  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.881453 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1338  long-chain fatty acid outer membrane transporter  24.75 
 
 		 417 aa  54.3  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1993  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  21.9 
 
 		 412 aa  53.9  0.000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.131408  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5672  aromatic hydrocarbon degradation protein  24.15 
 
 		 456 aa  51.2  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.224746  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2250  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  23.59 
 
 		 407 aa  48.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2600  long-chain fatty acid outer membrane transporter  25.06 
 
 		 422 aa  47.8  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.243825  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0449  aromatic hydrocarbon degradation protein  26.57 
 
 		 458 aa  45.4  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2824  long-chain fatty acid outer membrane transporter  25 
 
 		 427 aa  45.8  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.489519  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1000  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  20.9 
 
 		 402 aa  45.1  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.768268  hitchhiker  0.00646641 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1441  long-chain fatty acid outer membrane transporter  23.56 
 
 		 415 aa  45.1  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03124  hypothetical protein  26.79 
 
 		 420 aa  44.3  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1288  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  28.35 
 
 		 565 aa  43.9  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3370  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  27.34 
 
 		 458 aa  44.3  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0289  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  22.8 
 
 		 401 aa  44.3  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.233106 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>