188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1646 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007404  Tbd_1646  heterodisulfide reductase subunit C  100 
 
 
210 aa  442  1e-123  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0261138  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0633  putative heterodisulfide reductase, C subunit  32.14 
 
 
200 aa  112  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1882  heterodisulfide reductase subunit C  33.66 
 
 
195 aa  110  2.0000000000000002e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3574  Heterodisulfide reductase subunit C-like protein  31.84 
 
 
202 aa  109  3e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3675  putative heterodisulfide reductase, C subunit  32.94 
 
 
195 aa  103  3e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.141926 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0820  putative heterodisulfide reductase, C subunit  28.18 
 
 
192 aa  89  5e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.123 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2344  putative heterodisulfide reductase, C subunit  34.01 
 
 
188 aa  85.5  5e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.628999  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0151  heterodisulfide reductase subunit C-like protein  27.5 
 
 
192 aa  84.7  8e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3581  heterodisulfide reductase subunit C-like protein  27.5 
 
 
192 aa  85.1  8e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0417  putative heterodisulfide reductase, C subunit  28 
 
 
194 aa  84  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.344766 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3424  heterodisulfide reductase subunit  31.1 
 
 
216 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1261  CoB--CoM heterodisulfide reductase  29.21 
 
 
502 aa  82.8  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0031  heterodisulfide reductase subunit  27.98 
 
 
194 aa  81.6  0.000000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0032  heterodisulfide reductase subunit  27.98 
 
 
194 aa  81.3  0.000000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0563  putative heterodisulfide reductase, C subunit  30.3 
 
 
211 aa  81.3  0.000000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0092  heterodisulfide reductase subunit  30.63 
 
 
182 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0394  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  31.91 
 
 
189 aa  80.9  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00274296  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0861  heterodisulfide reductase subunit  27.47 
 
 
194 aa  79.7  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1201  CoB--CoM heterodisulfide reductase  26.42 
 
 
508 aa  79  0.00000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0710444  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0198  heterodisulfide reductase subunit C  25.54 
 
 
213 aa  78.2  0.00000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2317  heterodisulfide reductase subunit C  25 
 
 
213 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1108  heterodisulfide reductase, subunit C/succinate dehydrogenase, subunit C  26.63 
 
 
502 aa  77.4  0.0000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.785263  normal  0.633567 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1325  heterodisulfide reductase, C subunit  30.72 
 
 
188 aa  76.6  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1351  heterodisulfide reductase, C subunit  28.19 
 
 
193 aa  77  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.452628 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1196  heterodisulfide reductase, C subunit  31.25 
 
 
184 aa  76.6  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0358  putative heterodisulfide reductase, C subunit  29.63 
 
 
187 aa  76.6  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1335  heterodisulfide reductase, C subunit  26.87 
 
 
177 aa  76.6  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0826  heterodisulfide reductase, C subunit  28.95 
 
 
186 aa  75.5  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.185232  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1543  heterodisulfide reductase subunit C-like protein  28.64 
 
 
230 aa  75.1  0.0000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0154389 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0848  heterodisulfide reductase, C subunit  29.2 
 
 
202 aa  75.1  0.0000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.12259  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1574  putative heterodisulfide reductase, C subunit  29.66 
 
 
174 aa  75.1  0.0000000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0322  heterodisulfide reductase, C subunit  28.27 
 
 
186 aa  74.7  0.0000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.554815 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1028  heterodisulfide reductase, subunit C/succinate dehydrogenase, subunit C  24.73 
 
 
502 aa  74.3  0.000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00356665  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1207  heterodisulfide reductase, C subunit  29.27 
 
 
204 aa  74.3  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1806  heterodisulfide reductase, C subunit  31.33 
 
 
189 aa  73.9  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.577988 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0809  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  26.88 
 
 
190 aa  72.8  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000061408 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0625  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  38 
 
 
193 aa  73.2  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0765561  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3524  heterodisulfide reductase, C subunit  29.85 
 
 
185 aa  72.4  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0636  iron-sulfur cluster-binding protein  27.52 
 
 
238 aa  71.2  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.126769 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1700  putative heterodisulfide reductase, C subunit  36.73 
 
 
193 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000309238 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2103  heterodisulfide reductase subunit C (HdrC-2)  25.12 
 
 
230 aa  69.3  0.00000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.666222  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0239  hypothetical protein  34 
 
 
194 aa  68.9  0.00000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.577493 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2212  heterodisulfide reductase subunit C  26.85 
 
 
238 aa  68.2  0.00000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0191178  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1078  heterodisulfide reductase subunit C  25 
 
 
253 aa  67.8  0.0000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.114051  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1836  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  38.1 
 
 
191 aa  66.6  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.139025  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1307  CoB--CoM heterodisulfide reductase  24.5 
 
 
497 aa  66.6  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0433  CoB--CoM heterodisulfide reductase  28.19 
 
 
192 aa  65.9  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1517  CoB--CoM heterodisulfide reductase, subunit C  28.86 
 
 
192 aa  65.9  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.507445  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0539  CoB--CoM heterodisulfide reductase subunit C  29.87 
 
 
184 aa  65.9  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.214937  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1604  CoB--CoM heterodisulfide reductase, subunit C  29.87 
 
 
184 aa  65.9  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.455044  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0308  CoB--CoM heterodisulfide reductase  33.33 
 
 
184 aa  65.5  0.0000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2241  CoB/CoM heterodisulfide reductase, subunit C  35.37 
 
 
194 aa  65.1  0.0000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0469153  normal  0.0166067 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0377  CoB--CoM heterodisulfide reductase  30.88 
 
 
184 aa  65.1  0.0000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0402  CoB--CoM heterodisulfide reductase  28.86 
 
 
192 aa  64.7  0.0000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0280446  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2098  heterodisulfide reductase, C subunit  29.23 
 
 
193 aa  64.7  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2551  iron-sulfur cluster-binding protein  26.49 
 
 
239 aa  64.7  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.802978  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0640  CoB--CoM heterodisulfide reductase subunit C  38.82 
 
 
161 aa  63.9  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1516  CoB--CoM heterodisulfide reductase subunit C  34.34 
 
 
164 aa  63.9  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000306335  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1348  heterodisulfide reductase, C subunit  29.77 
 
 
192 aa  63.2  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.511519 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1783  hypothetical protein  35.29 
 
 
386 aa  62.8  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17750  hypothetical protein  25 
 
 
204 aa  62.4  0.000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1161  heterodisulfide reductase subunit C-like protein  31.9 
 
 
203 aa  62.8  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.860285  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0590  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  31.31 
 
 
193 aa  62  0.000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.321199  normal  0.0726 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2341  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  33.33 
 
 
439 aa  61.6  0.000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0307  CoB--CoM heterodisulfide reductase  28.79 
 
 
196 aa  61.6  0.000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.802269  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1252  heterodisulfide reductase subunit C-like protein  31.2 
 
 
160 aa  60.8  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0474  CoB--CoM heterodisulfide reductase  29.73 
 
 
193 aa  60.5  0.00000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.561183  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0975  heterodisulfide reductase subunit C-like protein  29.81 
 
 
133 aa  59.7  0.00000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.826747  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4092  heterodisulfide reductase subunit C-like  31.11 
 
 
148 aa  59.3  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.737599  normal  0.409471 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1801  hypothetical protein  30.23 
 
 
372 aa  58.5  0.00000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.606792 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1436  Heterodisulfide reductase subunit C-like protein  33.33 
 
 
533 aa  57.8  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.695739  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0142  hypothetical protein  32.18 
 
 
418 aa  55.5  0.0000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0464  succinate dehydrogenase, iron-sulfur protein subunit  22.78 
 
 
321 aa  55.1  0.0000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2663  Heterodisulfide reductase subunit C-like protein  34.25 
 
 
129 aa  54.7  0.0000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1697  hypothetical protein  26.13 
 
 
246 aa  54.7  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000729724 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0489  succinate dehydrogenase, iron-sulfur protein subunit  22.78 
 
 
321 aa  54.3  0.000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1176  hypothetical protein  31.03 
 
 
375 aa  54.7  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.390877 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2099  heterodisulfide reductase, subunit C (HdrC-1)  27.72 
 
 
280 aa  53.5  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1452  hypothetical protein  29.41 
 
 
412 aa  53.1  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.275657 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0771  oxidoreductase, selenocysteine-containing  30.59 
 
 
432 aa  52.8  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.457197  normal  0.324635 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1734  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  32.95 
 
 
385 aa  52.4  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0968  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  29.89 
 
 
437 aa  52.4  0.000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.405818  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06190  succinate dehydrogenase and fumarate reductase iron-sulfur protein  22.22 
 
 
328 aa  52.4  0.000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000260303 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1963  quinone-interacting membrane-bound oxidoreductase complex subunit C  30.39 
 
 
407 aa  52.4  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00829701 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1547  heterodisulfide reductase subunit C-like protein  26.73 
 
 
280 aa  52  0.000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0378845 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0376  succinate dehydrogenase and fumarate reductase iron-sulfur protein  22.92 
 
 
348 aa  51.6  0.000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0414  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  29.58 
 
 
451 aa  51.6  0.000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.137763 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0439  heterodisulfide reductase subunit C-like  28.05 
 
 
156 aa  51.6  0.000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1582  heterodisulfide reductase, putative  34.88 
 
 
392 aa  51.2  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00374998  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26930  succinate dehydrogenase and fumarate reductase iron-sulfur protein  25.56 
 
 
315 aa  51.2  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1953  heterodisulfide reductase subunit HdrC  34.33 
 
 
236 aa  50.1  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3961  DNA binding domain-containing protein  26.42 
 
 
314 aa  50.4  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1282  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  27.72 
 
 
416 aa  50.1  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.438227 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1872  succinate dehydrogenase, iron-sulfur protein subunit  20.11 
 
 
321 aa  50.1  0.00002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.856441  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1282  O-acetylhomoserine (thiol)-lyase  23.04 
 
 
321 aa  49.7  0.00004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1285  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.59 
 
 
385 aa  48.9  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.699767  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1082  hypothetical protein  26.32 
 
 
240 aa  48.9  0.00006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.165945  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0093  hypothetical protein  27.72 
 
 
423 aa  48.1  0.00009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0762  succinate dehydrogenase and fumarate reductase iron-sulfur protein  31.52 
 
 
241 aa  48.1  0.00009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2185  hypothetical protein  27.68 
 
 
228 aa  47.8  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.32077  hitchhiker  0.00000000457726 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>