22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0022 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0022  type IV pilus assembly PilZ  100 
 
 
229 aa  459  1e-128  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0022  type IV pilus assembly PilZ  100 
 
 
229 aa  459  1e-128  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  2.12001e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1434  type IV pilus assembly PilZ  41.89 
 
 
220 aa  173  2e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0380  type IV pilus assembly PilZ  39.55 
 
 
228 aa  163  2e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1401  type IV pilus assembly PilZ  32.75 
 
 
232 aa  120  2e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4131  type IV pilus assembly PilZ  29.2 
 
 
214 aa  80.9  1e-14  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00543164  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1416  type IV pilus assembly PilZ  26.7 
 
 
225 aa  72.8  4e-12  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.689221 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1670  type IV pilus assembly PilZ  22.01 
 
 
209 aa  64.3  1e-09  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2389  type IV pilus assembly PilZ  27.03 
 
 
221 aa  63.5  3e-09  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2026  type IV pilus assembly PilZ  27.67 
 
 
218 aa  63.5  3e-09  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0707  type IV pilus assembly PilZ  28 
 
 
222 aa  56.6  3e-07  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1745  type IV pilus assembly PilZ  26.89 
 
 
215 aa  55.5  6e-07  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16650  type IV pilus assembly PilZ  26.64 
 
 
216 aa  53.1  4e-06  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0872  glycosyltransferase-like protein  24.66 
 
 
219 aa  52  8e-06  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2692  type IV pilus assembly PilZ  21.18 
 
 
253 aa  50.8  2e-05  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0451  type IV pilus assembly PilZ  26.09 
 
 
222 aa  50.1  3e-05  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2173  type IV pilus assembly PilZ  24.46 
 
 
230 aa  49.7  4e-05  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0287147  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0488  type IV pilus assembly PilZ  23.08 
 
 
224 aa  47.4  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1315  type IV pilus assembly PilZ  22.36 
 
 
236 aa  47  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00287797  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2150  type IV pilus assembly PilZ  25.93 
 
 
233 aa  46.6  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2358  YcgR family protein  26.19 
 
 
243 aa  46.6  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.482275  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0793  glycosyltransferase-like  28.87 
 
 
219 aa  42.4  0.007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0542127  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>