More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2401 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2401  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 340 aa  698    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0837  glycosyl transferase family protein  52.35 
 
 		 330 aa  321  9.999999999999999e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5292  glycosyl transferase family 2  37.06 
 
 		 327 aa  229  4e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2967  glycosyl transferase family 2  35.69 
 
 		 324 aa  199  5e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2875  glycosyl transferase family 2  35.37 
 
 		 324 aa  198  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4256  glycosyl transferase family protein  33.68 
 
 		 336 aa  167  2e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.586342  normal  0.139884 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4473  glycosyl transferase family protein  36.34 
 
 		 340 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.966057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3771  glycosyl transferase family 2  33.79 
 
 		 327 aa  162  9e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.322166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3719  glycosyl transferase family 2  33.11 
 
 		 327 aa  160  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1368  glycosyl transferase family protein  29.27 
 
 		 324 aa  130  5.0000000000000004e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.537191  normal  0.711331 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0801  glycosyl transferase family 2  32.18 
 
 		 313 aa  124  3e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1348  glycosyl transferase family protein  31.27 
 
 		 311 aa  123  5e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0463  glycosyl transferase family protein  30.45 
 
 		 293 aa  123  5e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.580187 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3135  glycosyl transferase, putative  28.78 
 
 		 318 aa  112  9e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.331017  normal  0.385632 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4265  glycosyl transferase family protein  29.53 
 
 		 312 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5047  glycosyl transferase family 2  26.91 
 
 		 315 aa  110  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2579  glycosyl transferase family protein  28.42 
 
 		 318 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2720  glycosyl transferase family protein  28 
 
 		 318 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.372811  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1435  glycosyl transferase family protein  30.07 
 
 		 324 aa  108  1e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3119  glycosyl transferase family protein  31.56 
 
 		 282 aa  108  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0375  glycosyl transferase family protein  30.83 
 
 		 311 aa  108  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4234  glycosyl transferase family protein  28.93 
 
 		 310 aa  108  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0220827  hitchhiker  0.000823038 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0791  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 		 342 aa  107  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.965247 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1795  glycosyl transferase family protein  29.92 
 
 		 306 aa  107  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2910  glycosyl transferase family protein  28.06 
 
 		 318 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1825  glycosyl transferase family protein  27.69 
 
 		 324 aa  105  8e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4607  glycosyl transferase family protein  30.33 
 
 		 306 aa  105  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.71448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1007  glycosyl transferase family protein  26.23 
 
 		 336 aa  103  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.47724 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4437  glycosyl transferase family protein  29.58 
 
 		 331 aa  103  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1298  glycosyl transferase family protein  28.36 
 
 		 289 aa  102  1e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3358  glycosyl transferase family protein  26.84 
 
 		 294 aa  100  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1593  glycosyl transferase family protein  30.08 
 
 		 317 aa  100  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3706  glycosyl transferase family 2  29.3 
 
 		 325 aa  100  4e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000558134  hitchhiker  0.00000472149 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1638  glycosyl transferase family 2  32.08 
 
 		 299 aa  100  4e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1013  glycosyl transferase family 2  25.52 
 
 		 334 aa  100  5e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00302426  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2593  glycosyl transferase family protein  27.56 
 
 		 333 aa  97.8  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2949  glycosyl transferase family protein  27.24 
 
 		 299 aa  97.4  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0842  hypothetical protein  25.49 
 
 		 297 aa  97.1  4e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0377  glycosyl transferase family protein  32.78 
 
 		 314 aa  95.5  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.359383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1840  glycosyl transferase family 2  24.47 
 
 		 324 aa  94.7  2e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.939946  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2168  glycosyl transferase family protein  25.9 
 
 		 360 aa  94.7  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1063  glycosyl transferase family 2  28 
 
 		 305 aa  94.4  3e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.862808  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3501  glycosyl transferase family 2  34.77 
 
 		 310 aa  94  4e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.222757  normal  0.064344 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3990  glycosyl transferase family protein  27.17 
 
 		 304 aa  94  4e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.965976 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0459  glycosyl transferase family protein  30.9 
 
 		 303 aa  93.2  5e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0061  glycosyl transferase family 2  27.46 
 
 		 298 aa  93.2  6e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0094  glycosyl transferase family 2  27.16 
 
 		 312 aa  92.4  9e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2759  glycosyl transferase family 2  26.95 
 
 		 337 aa  92  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0817  hypothetical protein  24.71 
 
 		 297 aa  91.7  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5349  glycosyl transferase family protein  29.07 
 
 		 314 aa  91.3  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4230  glycosyl transferase family protein  30.8 
 
 		 300 aa  91.7  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0628  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 		 306 aa  91.7  2e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.154474 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1388  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 		 324 aa  90.1  4e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2407  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 		 312 aa  89.7  7e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.116461  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2884  glycosyl transferase family protein  28.82 
 
 		 298 aa  89  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723047 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1854  glycosyl transferase family 2  29.6 
 
 		 307 aa  88.6  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1949  glycosyl transferase family protein  27.11 
 
 		 308 aa  88.2  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.535237 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2884  glycosyl transferase family protein  26.61 
 
 		 305 aa  87.8  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.379417  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1328  glycosyl transferase family protein  30.84 
 
 		 332 aa  87.4  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02870  hypothetical protein  27.71 
 
 		 286 aa  87.4  3e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0840  hypothetical protein  25.56 
 
 		 296 aa  87  4e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1694  glycosyl transferase family protein  23.84 
 
 		 340 aa  87  4e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.128471  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4741  glycosyl transferase family protein  27.55 
 
 		 308 aa  86.7  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4485  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 		 312 aa  86.3  7e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.874808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0759  glycosyl transferase family protein  28.51 
 
 		 340 aa  85.9  8e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0160185 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3624  glycosyl transferase family 2  35.8 
 
 		 319 aa  85.9  8e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.519026 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3033  glycosyl transferase family protein  29.63 
 
 		 308 aa  84.3  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.244321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2745  glycosyl transferase family protein  28.51 
 
 		 1267 aa  84.3  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.636531  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2683  glycosyl transferase family 2  26.83 
 
 		 361 aa  84.3  0.000000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.624324  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4474  glycosyl transferase family 2  22.45 
 
 		 290 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0564  glycosyl transferase family protein  26.07 
 
 		 330 aa  83.2  0.000000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3344  glycosyl transferase family protein  28.79 
 
 		 274 aa  83.2  0.000000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27907 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1320  glycosyl transferase family protein  27.5 
 
 		 296 aa  82.8  0.000000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1337  glycosyl transferase family protein  27.5 
 
 		 296 aa  82.8  0.000000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.945092 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1356  glycosyl transferase family protein  27.5 
 
 		 296 aa  82.8  0.000000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00877043  normal  0.475844 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4143  glycosyl transferase family 2  26.51 
 
 		 345 aa  82  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000205364 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6543  glycosyl transferase family protein  30.04 
 
 		 329 aa  82  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1099  hypothetical protein  24.52 
 
 		 336 aa  82  0.00000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.299802 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2705  glycosyl transferase family 2  29.12 
 
 		 334 aa  82  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00520476 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13294  dTDP-RHA:A-D-GlcNAc-diphosphoryl polyprenol-A-3-L-rhamnosyl transferase wbbL1  27.16 
 
 		 301 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.621621 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4138  glycosyl transferase family protein  27.94 
 
 		 624 aa  81.3  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102626 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0619  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.85 
 
 		 311 aa  81.3  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773869  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1273  glycosyl transferase family protein  27.86 
 
 		 307 aa  81.6  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2757  glycosyl transferase family protein  25.25 
 
 		 314 aa  81.3  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3368  glycosyl transferase family protein  27.01 
 
 		 679 aa  81.3  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00886374 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5481  glycosyl transferase family protein  30.51 
 
 		 310 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0220  glycosyl transferase family 2  24.91 
 
 		 705 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0264  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.75 
 
 		 355 aa  80.9  0.00000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0657  glycosyl transferase family 2  31.94 
 
 		 307 aa  80.5  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3226  glycosyl transferase family protein  27.71 
 
 		 317 aa  80.9  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1753  glycosyl transferase family 2  29.2 
 
 		 705 aa  80.9  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0589133  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3301  glycosyl transferase family protein  33.57 
 
 		 319 aa  80.5  0.00000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.904037  normal  0.657687 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1579  glycosyl transferase family protein  29.05 
 
 		 318 aa  80.5  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.35814 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2365  glycosyl transferase family 2  31.4 
 
 		 836 aa  80.5  0.00000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00674972 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3130  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.83 
 
 		 276 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3093  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.83 
 
 		 276 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0798  glycosyl transferase family 2  31.53 
 
 		 305 aa  79.7  0.00000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3153  putative glycosyl transferase WbiF  28.83 
 
 		 318 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3908  glycosyl transferase, WecB/TagA/CpsF family  25.53 
 
 		 907 aa  79.7  0.00000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1728  glycosyl transferase family protein  27.45 
 
 		 291 aa  79.7  0.00000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.711206  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>