54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0479 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0479  hypothetical protein  100 
 
 		 200 aa  408  1e-113  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.539349 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2971  hypothetical protein  67.67 
 
 		 204 aa  196  3e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1942  hypothetical protein  61.43 
 
 		 200 aa  193  1e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0398084  decreased coverage  0.00719314 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0914  hypothetical protein  51.67 
 
 		 190 aa  181  8.000000000000001e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0986  hypothetical protein  58.99 
 
 		 203 aa  178  4e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2312  hypothetical protein  58.99 
 
 		 191 aa  177  7e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.418457  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2188  hypothetical protein  57.55 
 
 		 197 aa  174  6e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3642  hypothetical protein  39.23 
 
 		 199 aa  138  7e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000544722 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0615  hypothetical protein  40.48 
 
 		 174 aa  132  3e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.190546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2687  hypothetical protein  38.17 
 
 		 187 aa  132  5e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.296797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1266  hypothetical protein  35.63 
 
 		 185 aa  131  7.999999999999999e-30  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0044  hypothetical protein  42.03 
 
 		 185 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3942  hypothetical protein  42.07 
 
 		 185 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0510  hypothetical protein  41.33 
 
 		 192 aa  129  3e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.833855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0072  hypothetical protein  44.03 
 
 		 137 aa  129  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.237291  normal  0.464662 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0353  hypothetical protein  41.96 
 
 		 175 aa  128  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0427  protein of unknown function DUF1058  37.99 
 
 		 174 aa  128  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0218  hypothetical protein  44.93 
 
 		 174 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.236167  normal  0.0484329 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2486  protein of unknown function DUF1058  43.33 
 
 		 177 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.11896 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0036  hypothetical protein  37.28 
 
 		 176 aa  125  5e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.239823 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0379  protein of unknown function DUF1058  42.95 
 
 		 187 aa  124  6e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.403111  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3379  hypothetical protein  38.42 
 
 		 183 aa  124  7e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.393119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0422  hypothetical protein  41.83 
 
 		 197 aa  123  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.26681 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0492  protein of unknown function DUF1058  41.83 
 
 		 197 aa  123  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.216806 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0455  protein of unknown function DUF1058  41.83 
 
 		 197 aa  123  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.277988  normal  0.196103 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4125  hypothetical protein  41.84 
 
 		 183 aa  122  5e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.111694  normal  0.305565 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5957  protein of unknown function DUF1058  37.35 
 
 		 184 aa  121  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0475342  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4408  protein of unknown function DUF1058  36.53 
 
 		 179 aa  121  8e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0735  hypothetical protein  36.99 
 
 		 190 aa  120  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3789  hypothetical protein  36.16 
 
 		 186 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2088  hypothetical protein  36.32 
 
 		 245 aa  119  3.9999999999999996e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2231  hypothetical protein  40.67 
 
 		 194 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.115294 
 
 
-
 
NC_004310  BR2176  hypothetical protein  36.76 
 
 		 181 aa  117  9.999999999999999e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4088  protein of unknown function DUF1058  37.25 
 
 		 179 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1100  hypothetical protein  38.55 
 
 		 239 aa  115  3.9999999999999997e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00740954  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0315  hypothetical protein  38.56 
 
 		 179 aa  114  7.999999999999999e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3061  hypothetical protein  41.98 
 
 		 188 aa  109  3e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5059  hypothetical protein  36.69 
 
 		 182 aa  101  6e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.549476 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2170  hypothetical protein  38.17 
 
 		 177 aa  99.4  3e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.82966  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4584  hypothetical protein  34.33 
 
 		 160 aa  93.6  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2000  protein of unknown function DUF1058  46.24 
 
 		 367 aa  87.4  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0779  hypothetical protein  34.82 
 
 		 113 aa  82.4  0.000000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1176  hypothetical protein  28 
 
 		 163 aa  82  0.000000000000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2307  hypothetical protein  31.2 
 
 		 173 aa  78.6  0.00000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0346  hypothetical protein  30.58 
 
 		 149 aa  67  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00234847  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2403  hypothetical protein  33.33 
 
 		 156 aa  52.8  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.482031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3295  hypothetical protein  30.65 
 
 		 158 aa  52.4  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164661 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3400  protein of unknown function DUF1058  28.69 
 
 		 153 aa  50.8  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.874568  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1934  SH3 type 3 domain protein  29.27 
 
 		 158 aa  49.7  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.890926  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1788  SH3 type 3 domain-containing protein  29.27 
 
 		 158 aa  49.7  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.292681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1540  protein of unknown function DUF1058  34.34 
 
 		 165 aa  49.3  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0258  hypothetical protein  23.44 
 
 		 157 aa  44.7  0.0009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2184  hypothetical protein  24.64 
 
 		 141 aa  42  0.006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.483241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1125  hypothetical protein  26.8 
 
 		 162 aa  41.2  0.01  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>