More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2514 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2514  ornithine carbamoyltransferase  100 
 
 
305 aa  624  1e-178  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.292289 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0479  ornithine carbamoyltransferase  68.54 
 
 
306 aa  426  1e-118  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.133467  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1234  ornithine carbamoyltransferase  69.33 
 
 
304 aa  421  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.011055  normal  0.156338 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3007  ornithine carbamoyltransferase  66.78 
 
 
309 aa  416  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3112  ornithine carbamoyltransferase  66.45 
 
 
309 aa  415  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2197  ornithine carbamoyltransferase  66.34 
 
 
306 aa  410  1e-113  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.477962 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1323  ornithine carbamoyltransferase  63.91 
 
 
306 aa  409  1e-113  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.46051 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2652  ornithine carbamoyltransferase  63.25 
 
 
309 aa  396  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0251139 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19151  ornithine carbamoyltransferase  55.92 
 
 
318 aa  358  9e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.2173 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0829  ornithine carbamoyltransferase  56.58 
 
 
318 aa  357  9.999999999999999e-98  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0926  ornithine carbamoyltransferase  57.89 
 
 
318 aa  355  3.9999999999999996e-97  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.565714 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16811  ornithine carbamoyltransferase  56.67 
 
 
318 aa  353  2e-96  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0276  ornithine carbamoyltransferase  58.82 
 
 
315 aa  349  4e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1482  ornithine carbamoyltransferase  58.5 
 
 
318 aa  339  2.9999999999999998e-92  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.278648  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14621  ornithine carbamoyltransferase  53.14 
 
 
308 aa  339  4e-92  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.227033  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1357  ornithine carbamoyltransferase  53.31 
 
 
308 aa  337  9.999999999999999e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2286  ornithine carbamoyltransferase  54.72 
 
 
314 aa  337  9.999999999999999e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.102156 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0570  ornithine carbamoyltransferase  53.92 
 
 
320 aa  335  7.999999999999999e-91  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14241  ornithine carbamoyltransferase  53.14 
 
 
308 aa  333  2e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.256907  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1227  ornithine carbamoyltransferase  53.14 
 
 
355 aa  329  4e-89  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.786262  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0742  ornithine carbamoyltransferase  53.57 
 
 
312 aa  326  3e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14481  ornithine carbamoyltransferase  51.32 
 
 
308 aa  323  2e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1829  ornithine carbamoyltransferase  54.64 
 
 
312 aa  322  5e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13061  ornithine carbamoyltransferase  52.04 
 
 
318 aa  320  9.999999999999999e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.250396 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0343  ornithine carbamoyltransferase  53.59 
 
 
309 aa  319  3.9999999999999996e-86  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1869  ornithine carbamoyltransferase  52.98 
 
 
307 aa  317  1e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2415  ornithine carbamoyltransferase  50.66 
 
 
302 aa  316  3e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0158  ornithine carbamoyltransferase  50.83 
 
 
306 aa  314  9.999999999999999e-85  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4036  ornithine carbamoyltransferase  51.8 
 
 
316 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3875  ornithine carbamoyltransferase  51.48 
 
 
316 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.180928  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4351  ornithine carbamoyltransferase  51.8 
 
 
316 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.27136  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2685  ornithine carbamoyltransferase  53.62 
 
 
309 aa  313  2.9999999999999996e-84  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.570167  normal  0.0624155 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3961  ornithine carbamoyltransferase  52.32 
 
 
316 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000564713  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4152  ornithine carbamoyltransferase  51.48 
 
 
316 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3883  ornithine carbamoyltransferase  51.48 
 
 
316 aa  312  3.9999999999999997e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0998  ornithine carbamoyltransferase  51.48 
 
 
316 aa  312  3.9999999999999997e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4199  ornithine carbamoyltransferase  51.15 
 
 
316 aa  312  4.999999999999999e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4238  ornithine carbamoyltransferase  51.99 
 
 
316 aa  312  4.999999999999999e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0794  ornithine carbamoyltransferase  54.9 
 
 
313 aa  311  5.999999999999999e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4262  ornithine carbamoyltransferase  51.15 
 
 
316 aa  310  2e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2915  ornithine carbamoyltransferase  52.4 
 
 
305 aa  309  4e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.595203  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0540  ornithine carbamoyltransferase  49.33 
 
 
304 aa  309  4e-83  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000671603  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3171  ornithine carbamoyltransferase  52.29 
 
 
340 aa  308  5e-83  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0818364 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1599  ornithine carbamoyltransferase  55.02 
 
 
312 aa  308  8e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1542  ornithine carbamoyltransferase  49.34 
 
 
308 aa  306  2.0000000000000002e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4127  ornithine carbamoyltransferase  52.49 
 
 
312 aa  306  3e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00239827  hitchhiker  0.0000294127 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3637  ornithine carbamoyltransferase  50.33 
 
 
303 aa  306  4.0000000000000004e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2492  ornithine carbamoyltransferase  49.67 
 
 
305 aa  305  6e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0532  ornithine carbamoyltransferase  49.18 
 
 
302 aa  305  7e-82  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0521808  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3742  ornithine carbamoyltransferase  50 
 
 
303 aa  304  1.0000000000000001e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2287  ornithine carbamoyltransferase  50.65 
 
 
313 aa  304  1.0000000000000001e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.512601  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0999  ornithine carbamoyltransferase  50 
 
 
309 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0647018  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0315  ornithine carbamoyltransferase  49.83 
 
 
305 aa  302  6.000000000000001e-81  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.624865  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6073  ornithine carbamoyltransferase  51.97 
 
 
338 aa  301  1e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.711747  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2825  ornithine carbamoyltransferase  50.16 
 
 
316 aa  300  2e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0227  ornithine carbamoyltransferase  50.33 
 
 
305 aa  300  2e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1115  ornithine carbamoyltransferase  52.79 
 
 
310 aa  300  3e-80  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.545013 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18610  ornithine carbamoyltransferase  48.68 
 
 
305 aa  300  3e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0309685 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3057  ornithine carbamoyltransferase  51.32 
 
 
315 aa  298  5e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00484569  normal  0.832325 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3172  ornithine carbamoyltransferase  49.67 
 
 
305 aa  299  5e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0370415  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1609  ornithine carbamoyltransferase  48.34 
 
 
305 aa  298  7e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0781  ornithine carbamoyltransferase  46.23 
 
 
306 aa  297  1e-79  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0769217  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1790  ornithine carbamoyltransferase  50.65 
 
 
309 aa  297  1e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1885  ornithine carbamoyltransferase  51.16 
 
 
323 aa  297  2e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0234789  normal  0.0335747 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2358  ornithine carbamoyltransferase  48.01 
 
 
303 aa  296  3e-79  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.186855 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1057  ornithine carbamoyltransferase  48.34 
 
 
301 aa  296  4e-79  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0062  ornithine carbamoyltransferase  51.16 
 
 
312 aa  295  4e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.366315 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1113  ornithine carbamoyltransferase  49.83 
 
 
302 aa  295  5e-79  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5467  ornithine carbamoyltransferase  52.98 
 
 
308 aa  295  7e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.974312  normal  0.0257666 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2465  ornithine carbamoyltransferase  50.33 
 
 
300 aa  295  8e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1741  ornithine carbamoyltransferase  51.79 
 
 
317 aa  294  1e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187432 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2155  ornithine carbamoyltransferase  50.99 
 
 
311 aa  293  2e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000126395  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4527  ornithine carbamoyltransferase  48.2 
 
 
307 aa  293  3e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.145065 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2968  ornithine carbamoyltransferase  50.99 
 
 
307 aa  292  5e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.59447  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1259  ornithine carbamoyltransferase  51.64 
 
 
312 aa  292  5e-78  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0413416 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3012  ornithine carbamoyltransferase  50.99 
 
 
307 aa  292  5e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.296238  normal  0.87649 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0246  ornithine carbamoyltransferase  48.47 
 
 
298 aa  292  6e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3901  ornithine carbamoyltransferase  47.21 
 
 
306 aa  291  9e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2080  ornithine carbamoyltransferase  49.5 
 
 
298 aa  291  1e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3149  ornithine carbamoyltransferase  48.68 
 
 
303 aa  291  1e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2339  ornithine carbamoyltransferase  50.16 
 
 
309 aa  290  2e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.235287  hitchhiker  0.00582642 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2983  ornithine carbamoyltransferase  50.66 
 
 
307 aa  290  2e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.886443  normal  0.0522528 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2027  ornithine carbamoyltransferase  53.42 
 
 
322 aa  290  2e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.46978 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2889  ornithine carbamoyltransferase  51.14 
 
 
317 aa  290  2e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1101  ornithine carbamoyltransferase  47.68 
 
 
303 aa  290  2e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2317  ornithine carbamoyltransferase  47.54 
 
 
304 aa  290  2e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0451253  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1756  ornithine carbamoyltransferase  48.01 
 
 
323 aa  289  4e-77  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3310  ornithine carbamoyltransferase  49.67 
 
 
307 aa  289  4e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00885285  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1394  ornithine carbamoyltransferase  50.66 
 
 
311 aa  289  5.0000000000000004e-77  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.819554  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2130  ornithine carbamoyltransferase  48.69 
 
 
305 aa  289  5.0000000000000004e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1176  ornithine carbamoyltransferase  50.33 
 
 
311 aa  288  6e-77  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3512  ornithine carbamoyltransferase  47.68 
 
 
302 aa  288  9e-77  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.661553 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1203  ornithine carbamoyltransferase  50.33 
 
 
317 aa  288  9e-77  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0366728  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3073  ornithine carbamoyltransferase  49.03 
 
 
313 aa  288  9e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0726  ornithine carbamoyltransferase  49.34 
 
 
300 aa  288  1e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.853376  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2399  ornithine carbamoyltransferase  51.14 
 
 
312 aa  286  2e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2405  ornithine carbamoyltransferase  48.39 
 
 
313 aa  287  2e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.324681  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4164  ornithine carbamoyltransferase  46.56 
 
 
306 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0569  ornithine carbamoyltransferase  48.03 
 
 
311 aa  286  2.9999999999999996e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0405  ornithine carbamoyltransferase  48.03 
 
 
311 aa  286  2.9999999999999996e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.38298  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>