More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0749 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0749  ferredoxin--NADP reductase (FNR)  100 
 
 
398 aa  831    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.14944  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1917  ferredoxin--NADP reductase (FNR)  81.41 
 
 
396 aa  651    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.484005  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11131  ferredoxin-NADP oxidoreductase (FNR)  76.03 
 
 
361 aa  513  1e-144  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.93922 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1086  ferredoxin-NADP oxidoreductase (FNR)  65.03 
 
 
370 aa  510  1e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.569863  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09411  ferredoxin-NADP oxidoreductase (FNR)  76.13 
 
 
366 aa  506  9.999999999999999e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0946789 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11821  ferredoxin-NADP oxidoreductase (FNR)  74.14 
 
 
321 aa  505  9.999999999999999e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.140856  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11811  ferredoxin-NADP oxidoreductase (FNR)  73.23 
 
 
326 aa  504  1e-141  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11651  ferredoxin-NADP oxidoreductase (FNR)  77.44 
 
 
384 aa  503  1e-141  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15081  ferredoxin-NADP oxidoreductase (FNR)  74 
 
 
387 aa  488  1e-137  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.459762  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0675  ferredoxin-NADP oxidoreductase (FNR)  72.55 
 
 
381 aa  489  1e-137  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3563  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  55.59 
 
 
406 aa  422  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2543  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  55.59 
 
 
406 aa  422  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5201  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  52.9 
 
 
403 aa  424  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.86768e-21 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0978  ferredoxin-NADP oxidoreductase  56.16 
 
 
403 aa  416  9.999999999999999e-116  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000202848  normal  0.0244193 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0782  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  54.82 
 
 
440 aa  410  1e-113  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00024869  unclonable  0.0000000785266 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4840  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain-containing protein  54.08 
 
 
439 aa  404  1e-111  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00169429  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3658  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  52.75 
 
 
405 aa  394  1e-108  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.108889  normal  0.165286 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5047  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  51.51 
 
 
400 aa  391  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_23717  predicted protein  45.1 
 
 
340 aa  288  2e-76  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.239668  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28333  predicted protein  45.7 
 
 
360 aa  275  7e-73  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0642636  normal  0.462802 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12813  predicted protein  47.04 
 
 
298 aa  273  3e-72  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_42018  predicted protein  47.04 
 
 
320 aa  273  4.0000000000000004e-72  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.953925  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_15777  predicted protein  45.9 
 
 
299 aa  255  8e-67  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.112856  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1323  benzoyl-CoA oxygenase, component A  38.01 
 
 
417 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1220  benzoyl-CoA oxygenase subunit A  35.05 
 
 
415 aa  199  7e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.655891  normal  0.0139439 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6638  benzoyl-CoA oxygenase, component A  39.38 
 
 
393 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.297273  normal  0.0982181 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0890  benzoyl-CoA oxygenase, component A  39.06 
 
 
414 aa  191  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.48377 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2694  benzoyl-CoA oxygenase/reductase, BoxA protein  39.53 
 
 
413 aa  187  3e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1538  benzoyl-CoA oxygenase/reductase, BoxA protein  37.97 
 
 
416 aa  186  8e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0095  benzoyl-CoA oxygenase/reductase, BoxA protein  36.18 
 
 
428 aa  184  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.841388  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1424  benzoyl-CoA oxygenase, component A  35.59 
 
 
413 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0734  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  34.02 
 
 
424 aa  179  7e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.197929  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0072  benzoyl-CoA oxygenase/reductase, BoxA protein  34.37 
 
 
439 aa  177  3e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.860838  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3661  benzoyl-CoA oxygenase/reductase, BoxA protein  34.19 
 
 
431 aa  174  1.9999999999999998e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1630  benzoyl-CoA oxygenase, component A  35.82 
 
 
426 aa  173  5e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.170592  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2942  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  36.09 
 
 
427 aa  171  2e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.453854  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0222  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  34.62 
 
 
423 aa  166  5e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0992  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  32.35 
 
 
245 aa  105  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0107588 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0776  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  33.16 
 
 
594 aa  97.1  5e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0855  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  32.14 
 
 
604 aa  96.7  7e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.111088  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3738  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component  31.75 
 
 
607 aa  95.9  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0892  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  32.14 
 
 
604 aa  95.9  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3080  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  33 
 
 
604 aa  95.1  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.274835  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00005  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein subunit alpha  32.62 
 
 
631 aa  94.7  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002350  sulfite reductase [NADPH] flavoprotein alpha-component  32.33 
 
 
623 aa  93.6  5e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0944  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  32.63 
 
 
599 aa  93.6  5e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3416  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  31.78 
 
 
599 aa  94  5e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0919  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  32.63 
 
 
599 aa  93.6  5e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0402  sulfite reductase [NADPH] flavoprotein alpha-component  31.9 
 
 
613 aa  93.6  6e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.118356  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03589  sulfite reductase, alpha subunit (flavoprotein)  30.38 
 
 
608 aa  92.8  9e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.715854  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0953  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  32.11 
 
 
599 aa  92.4  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3434  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  30.04 
 
 
600 aa  92.8  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00417124 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3102  sulfite reductase subunit alpha  29.76 
 
 
599 aa  91.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0271703  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4039  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  30.9 
 
 
610 aa  91.7  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1302  molybdopterin oxidoreductase  31.62 
 
 
1338 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.791008 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3064  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  31.58 
 
 
599 aa  90.9  3e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.286269  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3260  sulfite reductase subunit alpha  28.98 
 
 
599 aa  90.9  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.25406 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3159  sulfite reductase subunit alpha  28.66 
 
 
599 aa  90.5  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.87087  normal  0.534662 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3807  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  32.11 
 
 
591 aa  90.1  5e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0251884 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0665  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  32.11 
 
 
594 aa  90.5  5e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000314937 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2720  flavodoxin/nitric oxide synthase  30.21 
 
 
588 aa  89.7  7e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.893392  unclonable  0.0000000000726752 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3121  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha component  30.21 
 
 
588 aa  89.7  7e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.500128  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3078  sulfite reductase subunit alpha  28.98 
 
 
599 aa  89.7  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.282259  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1259  molybdopterin oxidoreductase  30.77 
 
 
1257 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.804791  normal  0.0187222 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1906  FAD-binding domain protein  31.47 
 
 
628 aa  89  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3790  FAD-binding domain-containing protein  30.38 
 
 
388 aa  88.6  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.146822  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3527  sulfite reductase subunit alpha  31.94 
 
 
609 aa  87.8  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.400097  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1395  molybdopterin oxidoreductase  32.86 
 
 
1384 aa  87.8  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.427794  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3748  sulfite reductase  33.05 
 
 
540 aa  87.8  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0282506 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0932  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  30.43 
 
 
599 aa  87.4  4e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.520918  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4122  molybdopterin oxidoreductase  29.61 
 
 
1405 aa  87  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0706903  normal  0.0956254 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3193  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  29.38 
 
 
596 aa  87  5e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3143  sulfite reductase subunit alpha  28.34 
 
 
599 aa  87  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.49504  normal  0.285573 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0631  FAD-binding domain protein  32.16 
 
 
376 aa  87  6e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.346009 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0827  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  28.84 
 
 
607 aa  87  6e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4016  molybdopterin oxidoreductase  33.18 
 
 
1341 aa  86.3  8e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.115945  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4759  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component  33.33 
 
 
612 aa  86.3  9e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2795  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component  31.03 
 
 
614 aa  85.9  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0773977  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1784  sulfite reductase  31.2 
 
 
526 aa  86.3  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5020  molybdopterin oxidoreductase  28.57 
 
 
1396 aa  85.9  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4149  molybdopterin oxidoreductase  31.71 
 
 
1405 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.639229  normal  0.059871 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1703  molybdopterin oxidoreductase  32.7 
 
 
1357 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.2815 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0810  sulfite reductase subunit alpha  31.94 
 
 
599 aa  84.3  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2427  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  31.86 
 
 
608 aa  84.3  0.000000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.032742 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5007  sulfite reductase  32.76 
 
 
535 aa  84  0.000000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.125173  normal  0.198772 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0858  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  29.36 
 
 
605 aa  84  0.000000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3227  sulfite reductase subunit alpha  27.56 
 
 
601 aa  83.6  0.000000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000595634  normal  0.150506 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3365  sulfite reductase subunit alpha  30.89 
 
 
609 aa  83.6  0.000000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.834699  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1784  flavodoxin/nitric oxide synthase  31.09 
 
 
589 aa  83.6  0.000000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.108282 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02609  sulfite reductase, alpha subunit, flavoprotein  27.56 
 
 
599 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2904  sulfite reductase subunit alpha  27.56 
 
 
599 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3311  sulfite reductase subunit alpha  27.43 
 
 
612 aa  82.4  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1305  sulphite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  31.33 
 
 
610 aa  82.4  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1753  sulfite reductase  29.79 
 
 
539 aa  82  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.274813  normal  0.0164644 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3056  FAD-binding domain protein  29.25 
 
 
554 aa  82.4  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4018  sulfite reductase subunit alpha  27.24 
 
 
599 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.104123  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1738  FAD-binding domain-containing protein  32.62 
 
 
659 aa  82.8  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02572  hypothetical protein  27.56 
 
 
599 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2892  sulfite reductase subunit alpha  27.56 
 
 
599 aa  82.8  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0431  flavodoxin domain-containing protein  33.33 
 
 
883 aa  81.6  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>