More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0143 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0143  Mutator MutT  100 
 
 
352 aa  717    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0099  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  76.32 
 
 
396 aa  533  1e-150  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0722569  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01721  adenine glycosylase  69.1 
 
 
400 aa  491  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20801  adenine glycosylase  55.52 
 
 
384 aa  426  1e-118  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1205  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  55.52 
 
 
384 aa  424  1e-117  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17541  A/G-specific DNA glycosylase  56.89 
 
 
399 aa  415  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4529  A/G-specific adenine glycosylase  54.8 
 
 
363 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593144 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3062  A/G-specific adenine glycosylase  54.18 
 
 
352 aa  379  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.839676  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4181  A/G-specific adenine glycosylase  55.21 
 
 
386 aa  377  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.215625  normal  0.631474 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3059  A/G-specific adenine glycosylase  53.73 
 
 
352 aa  376  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0673  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  55.73 
 
 
360 aa  374  1e-102  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.21066  normal  0.501858 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1923  A/G-specific adenine glycosylase  47.4 
 
 
383 aa  290  2e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.417542  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2733  A/G-specific adenine glycosylase  41.12 
 
 
388 aa  251  2e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.610696  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1519  A/G-specific adenine glycosylase  39.76 
 
 
360 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.570552  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0322  A/G-specific adenine glycosylase  40.74 
 
 
352 aa  233  5e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000137419  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0892  A/G-specific adenine glycosylase  37.21 
 
 
373 aa  225  8e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.243357  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1921  A/G-specific adenine glycosylase  38.51 
 
 
434 aa  217  2e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0755  A/G-specific adenine glycosylase  37.63 
 
 
350 aa  210  4e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2267  A/G-specific adenine glycosylase MutY  37.73 
 
 
354 aa  209  7e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1345  A/G-specific adenine glycosylase  36.53 
 
 
366 aa  208  1e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2695  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  40.75 
 
 
361 aa  207  2e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.375064 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1764  A/G-specific adenine glycosylase  34.94 
 
 
360 aa  206  3e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3368  A/G-specific adenine glycosylase  38.21 
 
 
365 aa  206  6e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0212  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  36.75 
 
 
368 aa  205  8e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.880726  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1545  A/G-specific adenine glycosylase  38.95 
 
 
374 aa  203  3e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.151581  normal  0.696978 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1133  A/G-specific adenine DNA glycosylase  36.82 
 
 
354 aa  203  4e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.893564  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0443  A/G-specific adenine glycosylase  35.82 
 
 
364 aa  202  5e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1003  A/G-specific adenine glycosylase  36.82 
 
 
354 aa  202  6e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0662317  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2525  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  36.6 
 
 
368 aa  202  6e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0820  adenine DNA glycosylase  40.78 
 
 
419 aa  202  8e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.746728  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00282  A/G-specific adenine glycosylase  35.82 
 
 
355 aa  201  9.999999999999999e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.274494  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2698  A/G-specific adenine glycosylase  35.84 
 
 
396 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.265639 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0337  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  38.75 
 
 
355 aa  200  3e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.625053  normal  0.0756352 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2490  A/G-specific adenine glycosylase  36.12 
 
 
368 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.646812  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0120  A/G-specific adenine glycosylase  41.33 
 
 
350 aa  199  5e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000558564  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4922  A/G-specific adenine glycosylase  40.36 
 
 
355 aa  199  5e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000208141 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02670  putative A/G-specific adenine glycosylase  34.63 
 
 
351 aa  199  6e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3407  adenine DNA glycosylase  40.78 
 
 
368 aa  199  7e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0148197  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0882  adenine DNA glycosylase  41.4 
 
 
368 aa  199  7e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3366  adenine DNA glycosylase  39.72 
 
 
352 aa  199  7.999999999999999e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0209119 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0430  A/G-specific adenine glycosylase  34.12 
 
 
365 aa  199  9e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000440987  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0434  A/G-specific adenine glycosylase  34.12 
 
 
365 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.07824e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0064  A/G-specific adenine glycosylase  34.48 
 
 
435 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0819  adenine DNA glycosylase  40.43 
 
 
371 aa  198  1.0000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0306  A/G-specific adenine glycosylase  39.01 
 
 
355 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0367853 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4799  A/G-specific adenine glycosylase  34.64 
 
 
365 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000370724  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1251  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  40.21 
 
 
372 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000556638  normal  0.540816 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0525  A/G-specific adenine glycosylase  34.74 
 
 
365 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000761286  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0577  A/G-specific adenine glycosylase  34.12 
 
 
365 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000193741  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0491  A/G-specific adenine glycosylase  34.12 
 
 
365 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000144393  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0578  A/G-specific adenine glycosylase  34.73 
 
 
365 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000608246  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0503  A/G-specific adenine glycosylase  34.12 
 
 
365 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0522  A/G-specific adenine glycosylase  34.12 
 
 
365 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0115272  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0439  A/G-specific adenine glycosylase  34.34 
 
 
365 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000718891  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0522  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  40.43 
 
 
353 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000130755  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0311  A/G-specific adenine glycosylase  38.28 
 
 
355 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.354771  normal  0.798997 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0286  A/G-specific adenine glycosylase  38.65 
 
 
355 aa  197  3e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000160369 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1108  A/G-specific adenine glycosylase  35.93 
 
 
354 aa  197  3e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000562379  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1219  A/G-specific adenine glycosylase  38.23 
 
 
370 aa  197  3e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000411331  normal  0.458065 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0076  A/G-specific adenine glycosylase  40.5 
 
 
354 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.80443  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1319  A/G-specific adenine glycosylase  38.38 
 
 
382 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.565336  normal  0.399065 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0151  adenine DNA glycosylase  39.72 
 
 
372 aa  196  4.0000000000000005e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.523345  hitchhiker  0.00000764149 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3307  adenine DNA glycosylase  40.43 
 
 
360 aa  196  5.000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1984  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  41.02 
 
 
453 aa  196  6e-49  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.328101  normal  0.393206 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04530  A/G-specific adenine glycosylase  38.3 
 
 
362 aa  196  6e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3104  adenine DNA glycosylase  40.43 
 
 
350 aa  196  7e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00400976 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3206  adenine DNA glycosylase  40.43 
 
 
361 aa  196  7e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.141745  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3394  adenine DNA glycosylase  40.07 
 
 
360 aa  195  8.000000000000001e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1181  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  39.5 
 
 
372 aa  195  8.000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000011452  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02791  adenine DNA glycosylase  40.07 
 
 
350 aa  195  9e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0610871  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0734  A/G-specific adenine glycosylase  40.07 
 
 
350 aa  195  9e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0753  adenine DNA glycosylase  40.07 
 
 
350 aa  195  9e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.852915  normal  0.0133097 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02754  hypothetical protein  40.07 
 
 
350 aa  195  9e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0736099  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3176  A/G-specific adenine glycosylase  36.53 
 
 
354 aa  195  9e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4901  A/G-specific adenine glycosylase MutY  38.73 
 
 
355 aa  195  1e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5884  A/G-specific adenine glycosylase  44.49 
 
 
355 aa  195  1e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4265  adenine DNA glycosylase  40.07 
 
 
350 aa  195  1e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.528078  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3122  adenine DNA glycosylase  40.07 
 
 
360 aa  195  1e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1851  A/G-specific adenine glycosylase  41.38 
 
 
381 aa  195  1e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.641505  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3350  adenine DNA glycosylase  41.13 
 
 
350 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.443349 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3453  adenine DNA glycosylase  41.13 
 
 
350 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.849569 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3284  adenine DNA glycosylase  41.13 
 
 
350 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.587115  normal  0.0228526 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3274  adenine DNA glycosylase  40.43 
 
 
350 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1123  A/G-specific adenine glycosylase  34.44 
 
 
368 aa  194  2e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000383287  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5342  A/G-specific adenine glycosylase  38.38 
 
 
355 aa  193  3e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0468  A/G-specific adenine glycosylase  35.08 
 
 
366 aa  193  3e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000736881  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3358  adenine DNA glycosylase  41.13 
 
 
350 aa  194  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.173815 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0320  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  37.58 
 
 
355 aa  193  4e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0253407  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0480  A/G-specific adenine glycosylase  36.39 
 
 
368 aa  193  5e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0003  A/G-specific adenine glycosylase  37.99 
 
 
353 aa  192  5e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000019513  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3375  A/G-specific adenine glycosylase  37.72 
 
 
404 aa  193  5e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.421743  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1180  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  39.15 
 
 
372 aa  193  5e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000236828  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0718  A/G-specific adenine glycosylase  37.12 
 
 
464 aa  192  6e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.912653  normal  0.826443 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2195  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  39.42 
 
 
350 aa  192  7e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.591242 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3026  adenine DNA glycosylase  40.07 
 
 
363 aa  192  9e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0320  A/G-specific adenine glycosylase  34.12 
 
 
369 aa  192  9e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4148  A/G-specific adenine glycosylase  40.07 
 
 
362 aa  191  1e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.220216  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0960  hypothetical protein  33.23 
 
 
355 aa  191  1e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4259  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  37.87 
 
 
355 aa  191  1e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000489397 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1667  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  43.35 
 
 
370 aa  192  1e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>