160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1812 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_1812  hypothetical protein  100 
 
 
365 aa  744    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0843  hypothetical protein  87.11 
 
 
368 aa  581  1.0000000000000001e-165  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12211  hypothetical protein  72.65 
 
 
359 aa  520  1e-146  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07571  hypothetical protein  61.34 
 
 
349 aa  437  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.746447  hitchhiker  0.00609734 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07101  hypothetical protein  57.68 
 
 
337 aa  413  1e-114  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.129916  normal  0.330282 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0086  hypothetical protein  57.39 
 
 
337 aa  410  1e-113  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.639157  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07121  hypothetical protein  54.34 
 
 
375 aa  407  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07021  hypothetical protein  53.15 
 
 
400 aa  404  1e-111  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06731  hypothetical protein  52.63 
 
 
401 aa  402  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0646  hypothetical protein  53.48 
 
 
379 aa  399  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2641  hypothetical protein  57.32 
 
 
443 aa  392  1e-108  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.597647  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0171  sirohydrochlorin cobaltochelatase  49.63 
 
 
416 aa  342  5.999999999999999e-93  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.189717  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1378  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  47.06 
 
 
418 aa  261  2e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.149908  normal  0.20426 
 
 
-
 
NC_003296  RS03744  putative transmembrane protein  45.77 
 
 
534 aa  241  1e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.937216  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4473  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  42.46 
 
 
309 aa  222  7e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0278734 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0565  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  39.02 
 
 
471 aa  203  5e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0644  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  38.93 
 
 
472 aa  202  9.999999999999999e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2517  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.99 
 
 
553 aa  196  5.000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.459561  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0646  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  39.72 
 
 
297 aa  196  8.000000000000001e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00275078  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2699  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.64 
 
 
550 aa  193  3e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.2804  hitchhiker  0.000140912 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2360  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  40.41 
 
 
520 aa  191  1e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2615  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  37.93 
 
 
275 aa  181  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4163  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  38.11 
 
 
357 aa  177  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.108946  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1271  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  36.3 
 
 
465 aa  173  3.9999999999999995e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1550  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  37.97 
 
 
277 aa  171  2e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000233242  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6031  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  39.72 
 
 
288 aa  171  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.321792  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3890  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  35.38 
 
 
330 aa  164  3e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0314282 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3840  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  35.38 
 
 
333 aa  164  3e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0988  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  37.28 
 
 
410 aa  162  7e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4741  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  34.62 
 
 
347 aa  162  1e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1320  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  37.85 
 
 
326 aa  158  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0423235  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1866  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  36.79 
 
 
410 aa  156  6e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.156211  normal  0.343639 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4496  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  32.84 
 
 
329 aa  153  4e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3470  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  36.5 
 
 
408 aa  149  8e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1692  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  29.65 
 
 
303 aa  138  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.303188 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1197  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  34.21 
 
 
365 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3135  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  35.48 
 
 
279 aa  134  3e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.740034 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2162  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  31.14 
 
 
321 aa  133  6e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.15406 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1350  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  32.3 
 
 
274 aa  129  6e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1023  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  30.3 
 
 
309 aa  128  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.381916  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0439  sirohydrochlorin cobaltochelatase  30.65 
 
 
298 aa  122  8e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.30181  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0474  sirohydrochlorin cobaltochelatase  30.65 
 
 
298 aa  122  8e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2299  CbiX protein  30.71 
 
 
283 aa  119  7e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.66626  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0406  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  27.6 
 
 
248 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3738  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  29.43 
 
 
304 aa  116  5e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3862  cbiX domain protein  28.57 
 
 
250 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.417558  hitchhiker  0.00000756549 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1149  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  30.83 
 
 
250 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.427856  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1289  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  31.84 
 
 
248 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1482  cbiX domain protein  28.97 
 
 
251 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0833138  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1350  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  29.08 
 
 
250 aa  110  3e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.145066  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7366  putative transmembrane protein  30.22 
 
 
275 aa  107  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0247614  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2563  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  32.95 
 
 
304 aa  103  3e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.523631  normal  0.848204 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1588  cbiX domain protein  27.38 
 
 
251 aa  103  4e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00133885  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1518  cbiX domain protein  26.59 
 
 
251 aa  102  9e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.91734e-20 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1336  CbiX domain-containing protein  26.59 
 
 
251 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1309  cbiX protein  26.59 
 
 
251 aa  102  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1446  CbiX domain-containing protein  26.59 
 
 
251 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.340778  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1550  CbiX domain-containing protein  26.98 
 
 
251 aa  101  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.215105  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2778  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  29.08 
 
 
298 aa  101  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.617519  normal  0.0351721 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1310  cbiX protein  26.19 
 
 
251 aa  99.4  8e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.84622  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0799  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  31.8 
 
 
395 aa  95.1  2e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2149  cbiX domain protein  25.94 
 
 
236 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1002  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  30.83 
 
 
122 aa  75.9  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1994  CbiX domain-containing protein  24.9 
 
 
236 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2143  CbiX domain-containing protein  24.9 
 
 
236 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.458667  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1967  hypothetical protein  24.9 
 
 
236 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.203988  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1987  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  25.47 
 
 
236 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2290  cbiX domain protein  23.89 
 
 
236 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2421  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  27.17 
 
 
258 aa  71.6  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2174  cbiX domain protein  24.49 
 
 
236 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1946  hypothetical protein  23.89 
 
 
236 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3165  cbiX domain protein  24.06 
 
 
236 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0205  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  21.72 
 
 
247 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3489  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  31.2 
 
 
234 aa  69.7  0.00000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0344  sirohydrochlorin cobaltochelatase  31.78 
 
 
130 aa  68.9  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.922542 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2400  sirohydrochlorin cobaltochelatase  31.01 
 
 
130 aa  68.6  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.317297 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1281  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  30.51 
 
 
120 aa  67.4  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.967515  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6698  sirohydrochlorin cobaltochelatase  30 
 
 
253 aa  67.4  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.99079  normal  0.371849 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3476  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  30.8 
 
 
234 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.934772  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3539  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  30.8 
 
 
234 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.226804  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2245  sirohydrochlorin cobaltochelatase  32.03 
 
 
143 aa  65.9  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.177211  hitchhiker  0.00554027 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12421  hypothetical protein  28.95 
 
 
281 aa  63.9  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1890  putative secreted protein  27.2 
 
 
255 aa  61.6  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.813593  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7383  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  29.02 
 
 
253 aa  61.6  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.882429 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0081  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  21.6 
 
 
250 aa  62  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.53662 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2817  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  33.8 
 
 
263 aa  61.2  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.637642  normal  0.698036 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0307  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  27.59 
 
 
121 aa  60.5  0.00000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1945  hypothetical protein  36.36 
 
 
127 aa  60.1  0.00000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.982544  normal  0.0685142 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2348  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  26.61 
 
 
247 aa  58.9  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.511172  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1785  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  30.49 
 
 
255 aa  58.5  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0615189  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1035  sirohydrochlorin cobaltochelatase  28.36 
 
 
131 aa  58.5  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.137953  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0340  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  31.71 
 
 
121 aa  57.4  0.0000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3000  cbiX protein  28.33 
 
 
127 aa  56.2  0.0000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0476  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  28.03 
 
 
140 aa  54.7  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1299  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  27.5 
 
 
127 aa  53.9  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000187367  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1096  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  32.2 
 
 
127 aa  53.5  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1615  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  29.91 
 
 
248 aa  52.8  0.000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.767556  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0104  sirohydrochlorin cobaltochelatase  35.45 
 
 
129 aa  52.4  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6101  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  32.86 
 
 
153 aa  52.4  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.32194  normal  0.0194652 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0883  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  32.56 
 
 
220 aa  52.8  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111412  hitchhiker  0.00000000224272 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>