84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1627 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_1627  flagellar biosynthesis protein FliO  100 
 
 		 124 aa  242  9.999999999999999e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3057  flagellar biosynthesis protein, FliO  74.29 
 
 		 125 aa  159  1e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.190988  normal  0.139869 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1375  flagellar biosynthesis protein, FliO  65.38 
 
 		 125 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.679292  normal  0.145211 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1191  flagellar biosynthesis protein, FliO  57.25 
 
 		 136 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1335  flagellar biosynthesis protein, FliO  53.23 
 
 		 133 aa  130  7.999999999999999e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2288  flagellar protein FliO  60.42 
 
 		 124 aa  115  3e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.667143  normal  0.915972 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1370  flagellar biosynthesis protein FliO  60.87 
 
 		 124 aa  114  6e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1446  flagellar biosynthesis protein FliO  57.89 
 
 		 142 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00843701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3059  flagellar biosynthesis protein FliO  57.89 
 
 		 142 aa  104  5e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.400554  normal  0.373943 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2927  flagellar biosynthesis protein FliO  61.04 
 
 		 140 aa  103  7e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2917  flagellar biosynthesis protein FliO  61.04 
 
 		 141 aa  103  7e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.21495  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2567  flagellar biosynthesis protein, FliO  59.74 
 
 		 139 aa  98.2  3e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1351  flagellar biosynthesis protein, FliO  52.94 
 
 		 135 aa  97.1  7e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00422095  normal  0.37669 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1358  flagellar biosynthesis protein, FliO  52.94 
 
 		 135 aa  96.3  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1291  flagellar biosynthesis protein, FliO  52.94 
 
 		 135 aa  95.9  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3219  flagellar protein FliO  57.14 
 
 		 135 aa  93.6  8e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3038  flagellar biosynthesis protein, FliO  37.89 
 
 		 166 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2141  flagellar biosynthesis protein FliO  43.04 
 
 		 125 aa  68.2  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00267968 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2194  flagellar biosynthesis protein FliO  43.04 
 
 		 125 aa  68.2  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.805426 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2136  flagellar biosynthesis protein FliO  43.04 
 
 		 125 aa  68.2  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.206958 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1141  flagellar biosynthesis protein FliO  43.04 
 
 		 125 aa  68.2  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0496709  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1264  flagellar biosynthesis protein FliO  43.04 
 
 		 125 aa  68.2  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1511  flagellar protein FliO  45.24 
 
 		 209 aa  67  0.00000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.259812  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2584  flagellar biosynthesis protein FliO  37.93 
 
 		 140 aa  63.2  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1882  flagellar biosynthetic protein FliO  35.85 
 
 		 140 aa  62  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002824  flagellar biosynthesis protein FliO  33.33 
 
 		 137 aa  59.7  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2538  flagellar biosynthesis protein FliO  39.24 
 
 		 124 aa  60.1  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.600463  normal  0.973594 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03152  hypothetical protein  32.29 
 
 		 137 aa  58.2  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1964  flagellar biosynthesis protein, FliO  39.18 
 
 		 163 aa  58.5  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3445  flagellar biosynthesis protein, FliO  36.46 
 
 		 146 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.934306 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3882  flagellar protein FliO  40 
 
 		 151 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.427745  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02878  polar flagellar assembly protein FliO  33.82 
 
 		 120 aa  57.4  0.00000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1971  flagellar protein FliO  35.42 
 
 		 146 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0391464  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2299  polar flagellar assembly protein FliO  32.98 
 
 		 129 aa  56.2  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2940  flagellar biosynthesis protein FliO  29.63 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24140  Flagellar biosynthesis protein  37.25 
 
 		 140 aa  54.3  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.452089  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45780  flagellar protein FliO  37.78 
 
 		 150 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1754  flagellar protein fliO  36.89 
 
 		 136 aa  52.8  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1754  flagellar protein fliO  36.89 
 
 		 136 aa  52.8  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0709  flagellar biosynthetic protein FliO  32.67 
 
 		 211 aa  52  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.942573  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1985  flagellar biosynthesis protein, FliO  28.12 
 
 		 149 aa  50.4  0.000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.271247  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1567  flagellar biosynthesis protein FliO  40.74 
 
 		 138 aa  49.7  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.32485  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0030  flagellar biosynthesis protein, FliO  28.07 
 
 		 188 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0376  flagellar FLIO transmembrane protein  35.42 
 
 		 130 aa  49.7  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0057  flagellar biosynthesis protein FliO  27.35 
 
 		 180 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5882  flagellar biosynthesis protein, FliO  30.77 
 
 		 149 aa  48.9  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.51063  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3779  flagellar biosynthesis protein FliO  27.1 
 
 		 203 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5300  flagellar biosynthesis protein, FliO  33.75 
 
 		 186 aa  49.3  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.592303  normal  0.104724 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0156  flagellar protein fliO  29.25 
 
 		 206 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.517264 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2173  flagellar biogenesis protein-like  34.04 
 
 		 159 aa  49.3  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0038  flagellar biosynthesis protein, FliO  32.91 
 
 		 193 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0032  flagellar biosynthesis protein, FliO  32.91 
 
 		 193 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1549  flagellar biosynthesis protein FliO  37.29 
 
 		 139 aa  48.5  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3679  flagellar biosynthesis protein FliO  35.71 
 
 		 127 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4756  flagellar biosynthesis protein FliO  35.71 
 
 		 127 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.45659  normal  0.854749 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0039  flagellar biosynthesis protein FliO  31.03 
 
 		 186 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2813  flagellar biosynthesis protein, FliO  35 
 
 		 143 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.392806  normal  0.0850882 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2301  flagellar protein fliO  41.79 
 
 		 178 aa  47.4  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2401  flagellar biosynthesis protein FliO  38.81 
 
 		 178 aa  47.4  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0739  flagellar biosynthesis protein, FliO  37.21 
 
 		 152 aa  47.4  0.00007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.548156  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0031  flagellar biosynthesis protein FliO  32.91 
 
 		 221 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3435  flagellar biosynthesis protein FliO  28.83 
 
 		 127 aa  46.6  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0041  flagellar biosynthesis protein FliO  31.65 
 
 		 191 aa  46.6  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3495  flagellar protein FliO  32.91 
 
 		 221 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0242  flagellar protein FliO  32.91 
 
 		 221 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.682736  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1865  flagellar protein FliO  32.91 
 
 		 211 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.511864  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2762  flagellar protein FliO  32.91 
 
 		 164 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1706  flagellar protein FliO  41.56 
 
 		 129 aa  46.2  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0031  flagellar biosynthesis protein FliO  32.91 
 
 		 221 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2687  flagellar protein FliO  32.91 
 
 		 211 aa  46.2  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2163  flagellar biosynthesis protein, FliO  34.04 
 
 		 163 aa  46.6  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3222  flagellar biosynthesis protein, FliO  27.19 
 
 		 187 aa  46.6  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.252328 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1237  flagellar biosynthesis protein FliO  43.75 
 
 		 121 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0462666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0485  flagellar biosynthesis protein, FliO  30.19 
 
 		 153 aa  45.8  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.188569  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3918  flagellar biosynthesis protein FliO  31.25 
 
 		 144 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0029  flagellar biosynthesis protein  30.38 
 
 		 224 aa  44.3  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.241943  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1871  flagellar biosynthesis protein FliO  45.45 
 
 		 139 aa  44.3  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.577074  normal  0.501189 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0977  flagellar biosynthesis protein, FliO  36.49 
 
 		 162 aa  43.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.40867  normal  0.0426342 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1167  flagellar biogenesis protein FliO  29.17 
 
 		 129 aa  42.4  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2909  flagellar biosynthesis protein FliO  30.77 
 
 		 120 aa  42.4  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0500  hypothetical protein  28.95 
 
 		 224 aa  42  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.66012  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1094  flagellar protein FliO  30.67 
 
 		 112 aa  42  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.140384  normal  0.933798 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1330  flagellar biosynthesis protein FliO  30.49 
 
 		 150 aa  40.8  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.443294  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2180  flagellar biosynthesis protein FliO  46.88 
 
 		 121 aa  40  0.01  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000296305  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>