225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2300 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_2300  cobalt ABC transporter permease protein  100 
 
 		 263 aa  512  1e-144  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000489641  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0792  cobalt transport protein  41.96 
 
 		 267 aa  200  1.9999999999999998e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000295698  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1151  cobalt transport protein  41.7 
 
 		 269 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00718127  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0899  cobalt transport protein  42.41 
 
 		 268 aa  194  1e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120093  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2937  cobalt transport protein  39.43 
 
 		 269 aa  186  4e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2681  cobalt ABC transporter, permease protein  36.8 
 
 		 268 aa  179  4e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.02027  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1417  cobalt transport protein  38.74 
 
 		 264 aa  179  4e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3635  cobalt transport protein  40.32 
 
 		 270 aa  178  5.999999999999999e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0135623  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2366  ABC transporter permease protein  36.4 
 
 		 268 aa  178  9e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0381495  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1686  cobalt transport protein  39.76 
 
 		 262 aa  176  3e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01490  cobalt transport protein  40.08 
 
 		 263 aa  171  1e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000135943  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02440  cobalt transport protein  40.08 
 
 		 263 aa  171  1e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000491676  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0247  cobalt transport protein  37.31 
 
 		 269 aa  166  2e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.224698  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1012  cobalt transport protein  39.83 
 
 		 267 aa  162  4.0000000000000004e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000181433  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0318  cobalt transport protein  34.88 
 
 		 262 aa  162  5.0000000000000005e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000082775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0290  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  37.1 
 
 		 266 aa  160  1e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00263469  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0455  cobalt transport protein  36.05 
 
 		 263 aa  159  3e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2427  cobalt transport protein  39.51 
 
 		 264 aa  159  5e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0236294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0135  cobalt transport protein  36.15 
 
 		 264 aa  157  1e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000281903  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2288  cobalt transport protein  33.2 
 
 		 268 aa  158  1e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.256211  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2247  cobalt transport protein  33.2 
 
 		 268 aa  158  1e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000829673  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0162  cobalt transport protein  36.43 
 
 		 264 aa  155  6e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000250375  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0136  cobalt transport protein  36.29 
 
 		 264 aa  155  6e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000517715  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5164  cobalt transport protein  36.29 
 
 		 264 aa  155  7e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000252376  hitchhiker  0.0000000000119077 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0141  cobalt transport protein  35.89 
 
 		 264 aa  154  1e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00214311  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0141  cobalt transport protein  35.89 
 
 		 264 aa  154  1e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0136  cobalt ABC transporter permease  35.89 
 
 		 264 aa  154  1e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000131502  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0134  cobalt ABC transporter permease  35.89 
 
 		 264 aa  154  1e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0906186  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0141  cobalt transport protein  35.89 
 
 		 264 aa  154  1e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00121096  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0172  cobalt transport protein  35.89 
 
 		 264 aa  154  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000818149  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0227  cobalt transport protein  37.94 
 
 		 265 aa  154  1e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000299101  normal  0.638123 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0154  cobalt transport protein  35.89 
 
 		 264 aa  154  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.51702e-41 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0138  cobalt transport protein  38.21 
 
 		 265 aa  153  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0142  cobalt transport protein  38.15 
 
 		 265 aa  151  1e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000226284  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2124  cobalt transport protein  40.42 
 
 		 266 aa  150  1e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.213962  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0929  cobalt transport protein  35.36 
 
 		 271 aa  150  2e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000291148  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1983  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  36.05 
 
 		 264 aa  150  2e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.498842  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0951  cobalt transport protein  34.85 
 
 		 271 aa  150  3e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.222726  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1702  cobalt transport protein  36.11 
 
 		 265 aa  149  3e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1947  cobalt ABC transporter permease protein  37.1 
 
 		 259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.259406  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2149  cobalt transport family protein  34.43 
 
 		 264 aa  145  5e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.476733  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1088  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  32.93 
 
 		 266 aa  145  5e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.477877  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1801  cobalt transport family protein  36.05 
 
 		 268 aa  144  2e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2470  cobalt transport protein  35.06 
 
 		 275 aa  140  3e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.105266  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1453  cobalt transport protein  32.11 
 
 		 267 aa  138  8.999999999999999e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000563289  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0583  cobalt transport family protein  36.33 
 
 		 257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0320  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  34.26 
 
 		 267 aa  134  1.9999999999999998e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00398229  hitchhiker  1.85295e-17 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0227  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  33.06 
 
 		 267 aa  129  5.0000000000000004e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12580  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  33.7 
 
 		 269 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl154  cobalt ABC transporter permease component  28.47 
 
 		 332 aa  122  4e-27  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0828  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  31.76 
 
 		 255 aa  113  3e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.404494  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0666  cobalt ABC transporter, permease protein  28.71 
 
 		 336 aa  112  5e-24  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0625  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  26.8 
 
 		 269 aa  112  6e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.068602  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0997  cobalt transport protein  32.06 
 
 		 264 aa  112  8.000000000000001e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.632784  normal  0.445886 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24080  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  33.47 
 
 		 266 aa  111  1.0000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1964  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit  33.2 
 
 		 255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1836  cobalt transport protein  30.13 
 
 		 244 aa  107  2e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.507525  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0629  cobalt transport protein  36.91 
 
 		 438 aa  104  2e-21  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.35082  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0077  cobalt transport protein  28.12 
 
 		 246 aa  103  3e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.67532  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0824  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  27.64 
 
 		 770 aa  99.8  4e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0055  ATPase of ABC-type transport systems  28.51 
 
 		 810 aa  91.3  2e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.165072  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf374  cobalt ABC transporter, permease protein  27.46 
 
 		 314 aa  89.7  4e-17  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.0004205  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1966  cobalt transport protein  26.62 
 
 		 310 aa  87  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000103387  decreased coverage  0.000000125707 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2799  cobalt transport protein  29.64 
 
 		 284 aa  86.7  4e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.161091  hitchhiker  0.0000401783 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0352  cobalt transport protein  29.18 
 
 		 264 aa  84.7  0.000000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1229  cobalt transport protein  28.62 
 
 		 322 aa  84.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.379694 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0884  cobalt transport protein  32.62 
 
 		 291 aa  82.4  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2867  cobalt transport protein  30.04 
 
 		 290 aa  82.4  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3229  cobalt transport protein  30.04 
 
 		 290 aa  82.4  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.500857 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0027  hypothetical protein  28.4 
 
 		 255 aa  82.4  0.000000000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1950  ABC-type cobalt transport system permease component CbiQ and related transporters-like protein  28.57 
 
 		 241 aa  81.3  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2822  cobalt transport protein  28.57 
 
 		 261 aa  79.7  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.234298 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1608  cobalt transport protein  30.08 
 
 		 262 aa  77.8  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.816705 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0652  cobalt transport protein  35.46 
 
 		 246 aa  77.8  0.0000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1879  cobalt transport protein  28.57 
 
 		 252 aa  77.4  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.200735  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2897  cobalt transport protein  31.58 
 
 		 308 aa  76.6  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00540411  hitchhiker  0.000146213 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3887  cobalt transport protein  29.08 
 
 		 270 aa  75.9  0.0000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000020913  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3565  cobalt transport protein  31.82 
 
 		 309 aa  75.9  0.0000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0616568  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0708  cobalt transport protein  24.59 
 
 		 259 aa  75.1  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0246245 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2704  cobalt transport protein  24.44 
 
 		 285 aa  72.8  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19680  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  34.4 
 
 		 231 aa  73.2  0.000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0554754  normal  0.221391 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1302  cobalt transport protein  30.46 
 
 		 267 aa  72.8  0.000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0789486  normal  0.0436887 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1834  putative cobalt ABC transporter, permease protein  29.8 
 
 		 273 aa  72.4  0.000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.983784  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1130  cobalt transport protein  28.16 
 
 		 258 aa  72.4  0.000000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.845294 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1751  cobalt transport protein  26.94 
 
 		 272 aa  72  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.253796  normal  0.0321598 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3660  cobalt transport protein  27.03 
 
 		 196 aa  71.2  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1554  cobalt ABC transporter permease  30.49 
 
 		 273 aa  70.5  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0625005  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3551  cobalt ABC transporter, permease protein  26.01 
 
 		 287 aa  70.1  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0401892  normal  0.225242 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2386  ABC transporter, permease; cobalt transport protein  26.87 
 
 		 287 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00268022  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2659  cobalt transport protein  30.86 
 
 		 266 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000035997 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2462  cobalt transport protein  30.67 
 
 		 287 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0531481  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2642  cobalt transport protein  30.67 
 
 		 273 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.357292  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2498  cobalt transport protein  32.3 
 
 		 266 aa  68.9  0.00000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0358431  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2669  cobalt transport protein  31.48 
 
 		 266 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00761496  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1760  cobalt transport protein  28.63 
 
 		 291 aa  68.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1194  putative biotin ABC transporter, permease protein  28.12 
 
 		 217 aa  68.2  0.0000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2425  ABC transporter, permease; cobalt transport protein  30.25 
 
 		 287 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000434651  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2667  cobalt transport protein  30.77 
 
 		 266 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1788  cobalt transport protein  28.63 
 
 		 291 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.121417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2710  cobalt transport protein  30.86 
 
 		 266 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>