More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0901 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_0901  hypothetical protein  100 
 
 		 122 aa  240  3.9999999999999997e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1445  ribosome-binding factor A  41.59 
 
 		 131 aa  107  5e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000145103  normal  0.2265 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3675  ribosome-binding factor A  40.52 
 
 		 125 aa  107  6e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07850  ribosome-binding factor A  44.74 
 
 		 122 aa  107  7.000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1956  ribosome-binding factor A  42.86 
 
 		 120 aa  104  3e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1661  ribosome-binding factor A  40.17 
 
 		 121 aa  105  3e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.661527  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0610  ribosome-binding factor A  38.21 
 
 		 128 aa  103  6e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0012936  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1335  ribosome-binding factor A  43.97 
 
 		 118 aa  100  6e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0231832  hitchhiker  0.00144693 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3909  ribosome-binding factor A  43.97 
 
 		 118 aa  100  6e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.391027  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3633  ribosome-binding factor A  43.97 
 
 		 118 aa  100  6e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0539851  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3822  ribosome-binding factor A  43.97 
 
 		 118 aa  100  7e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.3299500000000005e-63 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2463  ribosome-binding factor A  43.97 
 
 		 118 aa  100  7e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0350107  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1051  ribosome-binding factor A  42.73 
 
 		 122 aa  100  8e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000570949  hitchhiker  0.000000154001 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3849  ribosome-binding factor A  43.97 
 
 		 118 aa  100  9e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3662  ribosome-binding factor A  43.97 
 
 		 118 aa  99.4  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118279  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3948  ribosome-binding factor A  43.97 
 
 		 118 aa  99.4  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3858  ribosome-binding factor A  43.1 
 
 		 118 aa  99.4  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000036841  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3552  ribosome-binding factor A  42.24 
 
 		 118 aa  98.2  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3570  ribosome-binding factor A  42.24 
 
 		 118 aa  98.2  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1644  ribosome-binding factor A  44.44 
 
 		 119 aa  97.1  7e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2049  ribosome-binding factor A  43.12 
 
 		 127 aa  97.1  8e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0477  ribosome-binding factor A  38.94 
 
 		 126 aa  96.3  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00670849  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1436  ribosome-binding factor A  40.87 
 
 		 118 aa  96.3  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.349731  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1157  ribosome-binding factor A  43.12 
 
 		 126 aa  96.3  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000826248  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0990  ribosome-binding factor A  39.83 
 
 		 123 aa  94.4  5e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.645083  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0909  ribosome-binding factor A  42.73 
 
 		 121 aa  94.4  5e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3187  ribosome-binding factor A  38.98 
 
 		 119 aa  94  6e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.11601  normal  0.332882 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26151  ribosome-binding factor A  38.94 
 
 		 142 aa  93.2  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.549053 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1052  ribosome-binding factor A  42.98 
 
 		 132 aa  92.4  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000164371  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0458  ribosome-binding factor A  40.37 
 
 		 117 aa  92  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0838  ribosome-binding factor A  40.87 
 
 		 134 aa  92.8  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.102995 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01271  ribosome-binding factor A  36.97 
 
 		 130 aa  92.4  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1356  ribosome-binding factor A  38.94 
 
 		 116 aa  90.9  5e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.348543  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1330  ribosome-binding factor A  38.94 
 
 		 130 aa  90.9  6e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.285304  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0837  ribosome-binding factor A  36.44 
 
 		 116 aa  90.5  7e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0402  ribosome-binding factor A  41.07 
 
 		 125 aa  88.6  3e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4927  ribosome-binding factor A  37.39 
 
 		 132 aa  87.4  5e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.128531  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3680  ribosome-binding factor A  36.75 
 
 		 127 aa  87.4  6e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00259102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3223  ribosome-binding factor A  37.86 
 
 		 121 aa  87  7e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.275033 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1589  ribosome-binding factor A  37.29 
 
 		 118 aa  87  8e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00426148  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1210  ribosome-binding factor A  41.44 
 
 		 127 aa  86.7  9e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00755575  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1131  ribosome-binding factor A  40.5 
 
 		 130 aa  86.7  9e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0305445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0696  ribosome-binding factor A  36.52 
 
 		 124 aa  86.7  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.146266  normal  0.222032 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2665  ribosome-binding factor A  37.5 
 
 		 133 aa  85.9  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0640591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3752  ribosome-binding factor A  39.67 
 
 		 130 aa  84.7  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00104734  unclonable  0.0000134979 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1480  ribosome-binding factor A  34.75 
 
 		 123 aa  84.7  4e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.243092  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2350  ribosome-binding factor A  33.63 
 
 		 140 aa  84.7  4e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.840269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1587  ribosome-binding factor A  33.9 
 
 		 118 aa  84.3  5e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00540002  normal  0.129345 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2895  ribosome-binding factor A  38.94 
 
 		 137 aa  84.3  5e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.437558  normal  0.0229957 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0964  ribosome-binding factor A  40.52 
 
 		 122 aa  84.3  6e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.404033  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1693  ribosome-binding factor A  34.82 
 
 		 141 aa  84  7e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0101873  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2773  ribosome-binding factor A  36.7 
 
 		 136 aa  82.8  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01851  ribosome-binding factor A  33.9 
 
 		 123 aa  83.2  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.30308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1217  ribosome-binding factor A  36.84 
 
 		 128 aa  83.2  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1247  ribosome-binding factor A  36.84 
 
 		 128 aa  83.2  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0254008 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0341  ribosome-binding factor A  32.74 
 
 		 134 aa  81.3  0.000000000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3073  ribosome-binding factor A  36.94 
 
 		 131 aa  81.3  0.000000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.729556  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1869  ribosome-binding factor A  36.36 
 
 		 131 aa  81.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2980  ribosome-binding factor A  34.48 
 
 		 119 aa  81.3  0.000000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.06185e-26 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1557  ribosome-binding factor A  33.62 
 
 		 119 aa  80.9  0.000000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000452845  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4179  ribosome-binding factor A  35.78 
 
 		 138 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.308306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4711  ribosome-binding factor A  33.94 
 
 		 132 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.31631 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4711  ribosome-binding factor A  33.94 
 
 		 132 aa  80.5  0.000000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.165962  hitchhiker  0.00698134 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0355  ribosome-binding factor A  35.71 
 
 		 137 aa  80.5  0.000000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.417644  normal  0.687785 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4576  ribosome-binding factor A  33.94 
 
 		 132 aa  80.5  0.000000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.63413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0722  ribosome-binding factor A  33.94 
 
 		 132 aa  80.5  0.000000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.041956 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0815  ribosome-binding factor A  36.52 
 
 		 123 aa  80.1  0.000000000000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0116201  normal  0.0354189 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0726  ribosome-binding factor A  36.11 
 
 		 147 aa  79.7  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.237747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5461  ribosome-binding factor A  39.45 
 
 		 128 aa  79.3  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.74875  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3607  ribosome-binding factor A  39.09 
 
 		 129 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.858095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1304  ribosome-binding factor A  33.62 
 
 		 119 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0293197  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42810  ribosome-binding factor A  36.61 
 
 		 129 aa  79  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4489  ribosome-binding factor A  34.86 
 
 		 138 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0856583  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1863  ribosome-binding factor A  37.96 
 
 		 126 aa  79.3  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2707  ribosome-binding factor A  36.7 
 
 		 128 aa  79.3  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.150572 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1939  ribosome-binding factor A  35.34 
 
 		 116 aa  79  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1657  ribosome-binding factor A  35.34 
 
 		 116 aa  79  0.00000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1004  ribosome-binding factor A  32.48 
 
 		 129 aa  79  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.439697  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62740  ribosome-binding factor A  38.53 
 
 		 129 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.232446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1902  ribosome-binding factor A  30 
 
 		 122 aa  78.6  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0066847  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0822  ribosome-binding factor A  34.78 
 
 		 126 aa  78.6  0.00000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.329178  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3474  ribosome-binding factor A  35.14 
 
 		 133 aa  78.2  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0818  ribosome-binding factor A  35.19 
 
 		 133 aa  78.6  0.00000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0100863 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1105  ribosome-binding factor A  38.6 
 
 		 132 aa  78.2  0.00000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.657587  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1670  ribosome-binding factor A  31.4 
 
 		 123 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.014786  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3604  ribosome-binding factor A  35.14 
 
 		 133 aa  78.2  0.00000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0265365 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0780  ribosome-binding factor A  33.94 
 
 		 133 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000489115  normal  0.0558247 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3994  ribosome-binding factor A  35.65 
 
 		 136 aa  77.4  0.00000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.405974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3595  ribosome-binding factor A  35.65 
 
 		 136 aa  77.4  0.00000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000837981  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3729  ribosome-binding factor A  35.65 
 
 		 136 aa  77.4  0.00000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0092978  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3543  ribosome-binding factor A  35.14 
 
 		 133 aa  77.4  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3580  ribosome-binding factor A  35.14 
 
 		 133 aa  77.4  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2030  ribosome-binding factor A  37.04 
 
 		 123 aa  77  0.00000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0111953  normal  0.0437908 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03034  ribosome-binding factor A  35.14 
 
 		 133 aa  76.6  0.00000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.710808  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0538  ribosome-binding factor A  35.14 
 
 		 133 aa  76.6  0.00000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0927  ribosome-binding factor A  33.04 
 
 		 119 aa  77  0.00000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.100451  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0531  ribosome-binding factor A  35.14 
 
 		 133 aa  76.6  0.00000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000335299 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02985  hypothetical protein  35.14 
 
 		 133 aa  76.6  0.00000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.757266  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3359  ribosome-binding factor A  35.14 
 
 		 133 aa  76.6  0.00000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4488  ribosome-binding factor A  35.14 
 
 		 133 aa  76.6  0.00000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>