More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0083 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_0083  DNA-binding protein HU (DNA-binding protein II)  100 
 
 		 90 aa  178  2e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0465  histone family protein DNA-binding protein  67.42 
 
 		 90 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0765  nucleoid protein Hbs  68.18 
 
 		 91 aa  123  7e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000296782  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0070  nucleoid protein Hbs  70.11 
 
 		 92 aa  122  1e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0240129  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2154  histone family protein DNA-binding protein  65.17 
 
 		 90 aa  122  2e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000552537  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0687  histone family protein DNA-binding protein  67.82 
 
 		 91 aa  122  2e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.105584  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0648  histone family protein DNA-binding protein  66.29 
 
 		 91 aa  121  4e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000417185  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1604  DNA-binding protein HU  66.29 
 
 		 90 aa  120  5e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000159132 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1637  DNA-binding protein HU  66.29 
 
 		 90 aa  120  5e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00420342  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3779  DNA-binding protein HU  66.29 
 
 		 90 aa  120  5e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000354145  normal  0.961445 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1420  DNA-binding protein HU  66.29 
 
 		 90 aa  120  5e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.190218  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1392  DNA-binding protein HU  66.29 
 
 		 90 aa  120  5e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.011833  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1392  DNA-binding protein HU  66.29 
 
 		 90 aa  120  5e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000512711  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1233  histone family protein DNA-binding protein  66.29 
 
 		 90 aa  120  5e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0133564  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1531  DNA-binding protein HU  66.29 
 
 		 90 aa  120  5e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.259543  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1673  DNA-binding protein HU  66.29 
 
 		 90 aa  120  5e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000325838  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1566  DNA-binding protein HU  66.29 
 
 		 90 aa  120  5e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236067  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1434  histone family protein DNA-binding protein  66.29 
 
 		 90 aa  120  5e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.087278  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0894  nucleoid DNA-binding protein  68.18 
 
 		 91 aa  120  5e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  8.08972e-16  hitchhiker  0.000000000000265027 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2069  histone family protein DNA-binding protein  67.42 
 
 		 95 aa  119  9.999999999999999e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0525  nucleoid protein Hbs  69.32 
 
 		 91 aa  119  1.9999999999999998e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00046461  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0075  histone family protein DNA-binding protein  61.8 
 
 		 91 aa  117  3.9999999999999996e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2424  histone family protein DNA-binding protein  63.22 
 
 		 91 aa  117  4.9999999999999996e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000394497  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1041  DNA-binding protein HU  62.92 
 
 		 90 aa  117  7e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.436255  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1530  histone family protein DNA-binding protein  62.92 
 
 		 90 aa  117  7e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.277737  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1560  histone family protein DNA-binding protein  62.92 
 
 		 90 aa  117  7e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.768925  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0085  nucleoid protein Hbs  62.92 
 
 		 91 aa  117  7e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0539634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1290  nucleoid protein Hbs  68.18 
 
 		 91 aa  117  7.999999999999999e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00000854913  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3085  histone family protein DNA-binding protein  61.8 
 
 		 91 aa  116  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000115471  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0115  histone family protein DNA-binding protein  60.67 
 
 		 95 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.552761  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2657  nucleoid protein Hbs  62.07 
 
 		 91 aa  115  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000194133  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2184  histone family protein DNA-binding protein  64.04 
 
 		 90 aa  114  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170143  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2983  DNA-binding protein HU  62.92 
 
 		 90 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2342  DNA-binding protein HU  62.92 
 
 		 90 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.868034  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2511  histone family protein DNA-binding protein  58.89 
 
 		 92 aa  114  5e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000006954  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2407  DNA-binding protein HU  62.92 
 
 		 90 aa  114  5e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.020348  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2477  DNA-binding protein HU  62.92 
 
 		 90 aa  114  5e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2213  DNA-binding protein HU  62.92 
 
 		 90 aa  114  5e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.519209  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2152  DNA-binding protein HU  62.92 
 
 		 90 aa  114  5e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0274093  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2136  DNA-binding protein HU  62.92 
 
 		 90 aa  114  5e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2395  DNA-binding protein HU  62.92 
 
 		 90 aa  114  5e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2377  DNA-binding protein HU  62.92 
 
 		 90 aa  114  5e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1010  nucleoid protein Hbs  64.77 
 
 		 91 aa  113  6.9999999999999995e-25  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.301873  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0135  histone family protein DNA-binding protein  62.92 
 
 		 91 aa  112  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00267128  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1763  histone family protein DNA-binding protein  62.92 
 
 		 90 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.203917  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0186  histone family protein DNA-binding protein  60.92 
 
 		 90 aa  110  7.000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1175  histone-like DNA-binding protein  62.5 
 
 		 91 aa  110  9e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000211181  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0184  DNA-binding protein HU 1  59.55 
 
 		 90 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0074  DNA-binding protein HU  60.67 
 
 		 90 aa  108  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000000481156  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10570  histone family protein DNA-binding protein  57.73 
 
 		 137 aa  108  3e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0219  histone family protein DNA-binding protein  57.3 
 
 		 96 aa  108  3e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.132966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1509  DNA-binding protein HU-beta  57.3 
 
 		 90 aa  107  4.0000000000000004e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000490467  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3133  histone-like DNA-binding protein  56.18 
 
 		 90 aa  107  5e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000045924  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5693  histone family protein DNA-binding protein  59.55 
 
 		 90 aa  107  6e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0471576  normal  0.0346696 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4407  histone family protein DNA-binding protein  59.55 
 
 		 94 aa  107  7.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000192025  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0964  histone family protein DNA-binding protein  58.89 
 
 		 92 aa  107  7.000000000000001e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000994236  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0133  histone family protein DNA-binding protein  60.67 
 
 		 91 aa  107  7.000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116647  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004041  DNA-binding protein HU-beta  57.3 
 
 		 90 aa  106  9.000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000015142  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2403  histone family protein DNA-binding protein  58.43 
 
 		 90 aa  106  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000237544  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01420  nucleoid DNA-binding protein  56.18 
 
 		 90 aa  106  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0183  DNA-binding protein HU 1  57.3 
 
 		 90 aa  106  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000296943  hitchhiker  2.26878e-36 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1900  histone family protein DNA-binding protein  56.18 
 
 		 90 aa  106  1e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0802524 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2285  histone family protein DNA-binding protein  56.18 
 
 		 90 aa  105  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0556838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1837  histone family protein DNA-binding protein  55.06 
 
 		 90 aa  104  4e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00431989  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0016  nucleoid protein HU beta subunit  59.55 
 
 		 90 aa  104  5e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3021  histone family protein DNA-binding protein  51.69 
 
 		 91 aa  103  6e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1797  HU family DNA-binding protein  56.18 
 
 		 90 aa  103  7e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1493  histone family protein DNA-binding protein  56.18 
 
 		 90 aa  103  7e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000000388309  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1596  histone family protein DNA-binding protein  56.18 
 
 		 90 aa  103  7e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000169185  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2747  histone family protein DNA-binding protein  56.18 
 
 		 90 aa  103  7e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000276504  normal  0.581764 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1630  histone family protein DNA-binding protein  56.18 
 
 		 90 aa  103  7e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000159632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2492  histone family protein DNA-binding protein  56.18 
 
 		 90 aa  103  7e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000348442  normal  0.0842071 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2560  histone family protein DNA-binding protein  56.18 
 
 		 90 aa  103  7e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000135506  normal  0.0536414 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1607  histone family protein DNA-binding protein  56.18 
 
 		 90 aa  103  7e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000022491  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3756  DNA-binding protein HU  57.3 
 
 		 90 aa  103  8e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000231467  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3574  DNA-binding protein HU  57.3 
 
 		 90 aa  103  8e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000204463  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3473  DNA-binding protein HU  57.3 
 
 		 90 aa  103  8e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.59147e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3486  DNA-binding protein HU  57.3 
 
 		 90 aa  103  8e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000148823  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3827  DNA-binding protein HU  57.3 
 
 		 90 aa  103  8e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000818253  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3778  DNA-binding protein HU  57.3 
 
 		 90 aa  103  8e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000704337  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1474  DNA-binding protein HU  57.3 
 
 		 90 aa  103  8e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000112809  hitchhiker  0.00000484208 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3858  DNA-binding protein HU  57.3 
 
 		 90 aa  103  8e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000000587043  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3740  DNA-binding protein HU  57.3 
 
 		 90 aa  103  8e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000145695 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1626  histone family protein DNA-binding protein  51.69 
 
 		 90 aa  102  1e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000133039  hitchhiker  0.00000000638901 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1180  histone-like DNA-binding protein  57.3 
 
 		 90 aa  103  1e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  2.95654e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0942  histone family protein DNA-binding protein  52.81 
 
 		 90 aa  103  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3261  transcriptional regulator HU subunit beta  55.06 
 
 		 90 aa  102  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1051  transcriptional regulator HU subunit beta  55.06 
 
 		 90 aa  102  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.593082  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2873  transcriptional regulator HU subunit beta  55.06 
 
 		 90 aa  102  1e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0170  histone family protein DNA-binding protein  57.3 
 
 		 94 aa  102  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000201093 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2650  DNA-binding protein HU  58.43 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0390  histone family protein DNA-binding protein  53.93 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0000165854  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0188  histone family protein DNA-binding protein  57.3 
 
 		 94 aa  102  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3494  histone family protein DNA-binding protein  56.18 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000668206  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2658  histone family protein DNA-binding protein  55.06 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000180426  normal  0.730265 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1181  histone family protein DNA-binding protein  53.93 
 
 		 92 aa  102  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.42545  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0875  histone family protein DNA-binding protein  53.93 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.757232  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3758  histone family protein DNA-binding protein  55.06 
 
 		 90 aa  101  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.639339  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3065  transcriptional regulator HU subunit beta  53.93 
 
 		 90 aa  101  3e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0045  histone family protein DNA-binding protein  56.18 
 
 		 90 aa  102  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000165888  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>