More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0031 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_0031  hypothetical protein  100 
 
 		 99 aa  193  8.000000000000001e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000133634  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0093  hypothetical protein  64.65 
 
 		 104 aa  137  7e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.790212  hitchhiker  0.0000035436 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20780  conserved hypothetical protein TIGR00103  64.65 
 
 		 102 aa  136  7.999999999999999e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.81205e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0034  hypothetical protein  63.64 
 
 		 111 aa  129  9e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00230988  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0032  hypothetical protein  59.6 
 
 		 102 aa  129  1.0000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000102998  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0043  hypothetical protein  61.29 
 
 		 105 aa  124  5e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00471711  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0375  hypothetical protein  56.57 
 
 		 104 aa  122  1e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000118916  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2129  hypothetical protein  54.55 
 
 		 102 aa  122  2e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.293939  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0541  hypothetical protein  55.56 
 
 		 103 aa  121  3e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000849008  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2790  hypothetical protein  56.84 
 
 		 110 aa  119  9.999999999999999e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00558888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0067  hypothetical protein  56.57 
 
 		 103 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2143  hypothetical protein  56 
 
 		 113 aa  118  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000000242142  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0300  hypothetical protein  57.29 
 
 		 104 aa  118  3e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0987311  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0028  hypothetical protein  62.79 
 
 		 104 aa  117  3.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.550866  hitchhiker  0.0000076986 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0095  hypothetical protein  56.25 
 
 		 104 aa  117  7e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1143  hypothetical protein  60.61 
 
 		 113 aa  116  7.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0324443  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2270  hypothetical protein  53.54 
 
 		 103 aa  115  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0507  hypothetical protein  51.52 
 
 		 100 aa  114  3e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.845644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0053  hypothetical protein  53.54 
 
 		 112 aa  114  5e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0056  hypothetical protein  53.54 
 
 		 112 aa  114  5e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4328  hypothetical protein  57.29 
 
 		 104 aa  114  6e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0791  hypothetical protein  52.53 
 
 		 112 aa  111  3e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0051  hypothetical protein  67.37 
 
 		 110 aa  110  5e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000883025  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0211  hypothetical protein  53.54 
 
 		 104 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0452861  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0194  hypothetical protein  53.54 
 
 		 104 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.06405e-32 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0243  hypothetical protein  51 
 
 		 115 aa  107  4.0000000000000004e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000366291  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3923  hypothetical protein  48.45 
 
 		 101 aa  107  6e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000153942  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0801  hypothetical protein  50.51 
 
 		 104 aa  106  8.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0017  hypothetical protein  48.48 
 
 		 108 aa  106  9.000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0366  hypothetical protein  57.29 
 
 		 104 aa  105  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000356644  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0188  hypothetical protein  49.49 
 
 		 103 aa  105  2e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0016  hypothetical protein  49.48 
 
 		 105 aa  104  4e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3421  hypothetical protein  58.33 
 
 		 104 aa  104  4e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00145337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1739  hypothetical protein  51.52 
 
 		 127 aa  103  7e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000243349  normal  0.0708671 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02340  conserved hypothetical protein TIGR00103  47.47 
 
 		 102 aa  102  2e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.001975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01590  conserved hypothetical protein TIGR00103  46.46 
 
 		 101 aa  102  2e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000200269 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2146  hypothetical protein  50.51 
 
 		 103 aa  102  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1387  hypothetical protein  47.87 
 
 		 99 aa  101  4e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0195  hypothetical protein  49.49 
 
 		 98 aa  100  5e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.933815  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0116  hypothetical protein  43.88 
 
 		 112 aa  100  9e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000133344  normal  0.143871 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6869  hypothetical protein  47.47 
 
 		 111 aa  99.8  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.273576 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1004  hypothetical protein  50.55 
 
 		 101 aa  98.6  3e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0374061  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0604  hypothetical protein  50 
 
 		 113 aa  97.1  8e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.750239 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0107  hypothetical protein  41.41 
 
 		 103 aa  95.5  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5293  hypothetical protein  49.4 
 
 		 109 aa  94  7e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00134592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0025  hypothetical protein  49.4 
 
 		 109 aa  94  7e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000165828  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0021  hypothetical protein  48.78 
 
 		 109 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0022  hypothetical protein  48.78 
 
 		 109 aa  93.2  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0020  hypothetical protein  48.78 
 
 		 109 aa  93.2  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0020  hypothetical protein  48.78 
 
 		 109 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00124742  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0027  hypothetical protein  48.78 
 
 		 109 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000699023  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0047  hypothetical protein  48.89 
 
 		 119 aa  92.8  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0020  hypothetical protein  48.78 
 
 		 109 aa  93.2  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.113689  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0024  hypothetical protein  48.78 
 
 		 109 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0019  hypothetical protein  46.99 
 
 		 109 aa  92  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0215941  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0115  hypothetical protein  51.85 
 
 		 105 aa  91.7  3e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0020  hypothetical protein  49.38 
 
 		 108 aa  91.3  4e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000261671  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3636  hypothetical protein  42.71 
 
 		 103 aa  90.5  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.130906  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3777  hypothetical protein  43.75 
 
 		 103 aa  90.9  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0610332  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3694  hypothetical protein  42.71 
 
 		 103 aa  90.1  8e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0019  hypothetical protein  50 
 
 		 109 aa  90.1  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00658876  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0513  hypothetical protein  51.85 
 
 		 105 aa  89.7  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0500  hypothetical protein  51.85 
 
 		 105 aa  89.7  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00615814  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5292  hypothetical protein  51.22 
 
 		 113 aa  89.7  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6147  hypothetical protein  43.4 
 
 		 116 aa  86.3  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.918474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1592  hypothetical protein  38.38 
 
 		 107 aa  85.5  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.107966  normal  0.0589589 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1920  hypothetical protein  38.38 
 
 		 107 aa  85.5  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2167  hypothetical protein  42.55 
 
 		 106 aa  85.9  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.230597  normal  0.38651 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2292  hypothetical protein  40.22 
 
 		 100 aa  85.1  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.99726  normal  0.0988842 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3761  hypothetical protein  44.79 
 
 		 103 aa  84.7  4e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.5138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1534  hypothetical protein  40.22 
 
 		 100 aa  83.6  8e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36560  conserved hypothetical protein TIGR00103  37.96 
 
 		 118 aa  83.6  8e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.29616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1309  hypothetical protein  40.21 
 
 		 109 aa  83.6  9e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000000243937  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3200  hypothetical protein  47.44 
 
 		 100 aa  82.4  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000349451  normal  0.470148 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2910  hypothetical protein  41.49 
 
 		 107 aa  82.4  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0427625 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0253  hypothetical protein  46.46 
 
 		 117 aa  82  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0347307  hitchhiker  0.00450491 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3472  hypothetical protein  39.18 
 
 		 107 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.153266  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1974  hypothetical protein  45.45 
 
 		 101 aa  81.3  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.178453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0327  hypothetical protein  39.58 
 
 		 102 aa  80.9  0.000000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.863681  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1336  valyl-tRNA synthetase  40.21 
 
 		 106 aa  80.9  0.000000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0849671  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1327  hypothetical protein  38.83 
 
 		 107 aa  80.1  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0516  hypothetical protein  46.81 
 
 		 108 aa  79.3  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.384172 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0269  hypothetical protein  39.56 
 
 		 158 aa  80.1  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4847  hypothetical protein  40.43 
 
 		 105 aa  79.3  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.246843  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00422  hypothetical protein  41.24 
 
 		 109 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000789262  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3139  conserved hypothetical protein  41.24 
 
 		 109 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000114318  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0590  hypothetical protein  41.24 
 
 		 109 aa  79  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.849512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0546  hypothetical protein  41.24 
 
 		 109 aa  79  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0403  hypothetical protein  41.24 
 
 		 109 aa  79  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0388761  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0562  hypothetical protein  41.24 
 
 		 109 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0140124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0536  hypothetical protein  41.24 
 
 		 109 aa  79  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.529498  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00427  hypothetical protein  41.24 
 
 		 109 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000717849  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0514  hypothetical protein  41.24 
 
 		 109 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0066094  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3145  hypothetical protein  41.24 
 
 		 109 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000177659  normal  0.0402565 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0530  hypothetical protein  41.24 
 
 		 109 aa  79  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.560508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0548  hypothetical protein  41.24 
 
 		 109 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0978192  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1086  hypothetical protein  40.21 
 
 		 111 aa  79.3  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0530  hypothetical protein  41.24 
 
 		 109 aa  79  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1311  hypothetical protein  41.24 
 
 		 109 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000397187  normal  0.0452389 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4268  hypothetical protein  42.42 
 
 		 111 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0432211  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>