80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2539 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2539  hypothetical protein  100 
 
 		 275 aa  540  9.999999999999999e-153  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.613317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1890  Rhodanese domain protein  62.41 
 
 		 276 aa  335  5e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.147742  normal  0.557536 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2238  Rhodanese domain protein  62.41 
 
 		 276 aa  331  1e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.50226  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1474  rhodanese domain-containing protein  61.82 
 
 		 276 aa  330  2e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0999735 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1752  Rhodanese domain protein  61.09 
 
 		 276 aa  326  3e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.708462  normal  0.834811 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6096  Rhodanese domain protein  61.31 
 
 		 276 aa  319  3e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4195  Rhodanese domain protein  61.45 
 
 		 276 aa  318  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4735  Rhodanese domain protein  59.49 
 
 		 276 aa  317  9e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6163  rhodanese domain-containing protein  60.58 
 
 		 276 aa  315  7e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3650  rhodanese domain-containing protein  61.4 
 
 		 273 aa  313  1.9999999999999998e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.867375 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4664  hypothetical protein  59.93 
 
 		 272 aa  310  2e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.168617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0743  rhodanese domain-containing protein  58.93 
 
 		 277 aa  301  1e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.792862 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2390  Rhodanese domain protein  58.39 
 
 		 271 aa  296  3e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2725  Rhodanese domain protein  60.22 
 
 		 271 aa  295  7e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0299  Rhodanese domain protein  57.46 
 
 		 272 aa  281  1e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.248369 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3338  rhodanese domain-containing protein  57.45 
 
 		 281 aa  276  4e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.337326 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3132  rhodanese domain-containing protein  57.45 
 
 		 281 aa  276  4e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4887  hypothetical protein  41.26 
 
 		 297 aa  162  7e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6454  hypothetical protein  51.7 
 
 		 157 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5589  hypothetical protein  51.02 
 
 		 157 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03923  hypothetical protein  53.06 
 
 		 182 aa  160  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0504923 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5953  hypothetical protein  51.02 
 
 		 157 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.241213 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1204  hypothetical protein  54.42 
 
 		 152 aa  160  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0392083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3864  chromate resistance regulator  51.7 
 
 		 152 aa  157  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3380  helix-turn-helix domain-containing protein  50.34 
 
 		 288 aa  150  2e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6199  hypothetical protein  51.43 
 
 		 140 aa  148  8e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00558934 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0054  hypothetical protein  56.34 
 
 		 205 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1562  hypothetical protein  56.34 
 
 		 205 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0065  hypothetical protein  56.34 
 
 		 205 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0065  ChrB protein  56.34 
 
 		 205 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1209  hypothetical protein  56.34 
 
 		 205 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2525  hypothetical protein  50.34 
 
 		 156 aa  146  3e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.368998 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1492  hypothetical protein  56.34 
 
 		 142 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0082  ChrB protein  55.8 
 
 		 142 aa  144  1e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5141  ChrB protein  50.69 
 
 		 143 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.549445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2823  transcriptional regulator, AraC family  50.68 
 
 		 285 aa  140  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2046  transcriptional regulator, AraC family  47.59 
 
 		 287 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.344929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2153  hypothetical protein  48.65 
 
 		 150 aa  138  8.999999999999999e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.594217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5223  chromate resistance regulator  46.9 
 
 		 155 aa  137  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.327811 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3379  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  44.83 
 
 		 285 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5156  hypothetical protein  51.59 
 
 		 128 aa  116  3e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0357  hypothetical protein  43.17 
 
 		 144 aa  103  3e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.721844  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1349  Chromate resistance exported protein  38.03 
 
 		 146 aa  94.4  2e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0074  chromate resistance protein ChrB  42.18 
 
 		 273 aa  91.7  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2675  ChrB protein  36.71 
 
 		 333 aa  90.5  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5054  chromate resistance exported protein  42.96 
 
 		 325 aa  90.9  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.234955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3199  chromate resistance exported protein  43.15 
 
 		 325 aa  90.1  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3573  putative chromate resistance signal peptide protein  40.51 
 
 		 320 aa  89.7  5e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.771292  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3250  putative chromate resistance signal peptide protein  40.51 
 
 		 320 aa  89.4  5e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0056  chromate resistance protein ChrB  40.27 
 
 		 325 aa  89.7  5e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0069  chromate resistance protein ChrB  40.27 
 
 		 325 aa  89.4  7e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0085  chrB protein  40.27 
 
 		 331 aa  89  7e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1213  chromate resistance protein ChrB  40.27 
 
 		 325 aa  89.4  7e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0068  chrB protein  40.27 
 
 		 303 aa  89  8e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1564  chromate resistance exported protein  40.27 
 
 		 273 aa  89  8e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1496  chromate resistance protein ChrB  40.27 
 
 		 303 aa  89  8e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3866  chromate resistance regulator  39.88 
 
 		 335 aa  89  9e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5138  chromate resistance exported protein  36.02 
 
 		 332 aa  86.7  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.374777  normal  0.563482 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6203  putative chromate resistance signal peptide protein  31.88 
 
 		 324 aa  85.1  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.941608  normal  0.0314221 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2524  ChrB protein  32.17 
 
 		 328 aa  84.3  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.555029 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1802  putative chromate resistance protein  37.89 
 
 		 320 aa  84  0.000000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6456  putative chromate resistance signal peptide protein  38.46 
 
 		 320 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.968357 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0554  chromate resistance signal peptide protein  36.9 
 
 		 323 aa  82.4  0.000000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0496701 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0082  Chromate resistance exported protein  42.65 
 
 		 323 aa  82.8  0.000000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.908609 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5955  putative chromate resistance signal peptide protein  38.46 
 
 		 320 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0687386 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5591  putative chromate resistance signal peptide protein  38.46 
 
 		 320 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4366  chromate resistance exported protein  38.36 
 
 		 312 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.883925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2446  chromate resistance exported protein  38.3 
 
 		 316 aa  80.1  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1533  putative chromate resistance protein  42.14 
 
 		 141 aa  79.7  0.00000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1522  chromate resistance signal peptide protein  37.58 
 
 		 324 aa  79.3  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.320502  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2805  ChrB protein  36.88 
 
 		 363 aa  79  0.00000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2248  hypothetical protein  41.38 
 
 		 306 aa  79  0.00000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0295306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1207  putative chromate resistance protein  38.12 
 
 		 320 aa  78.6  0.00000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.609429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3192  chromate resistance exported protein  36.96 
 
 		 309 aa  78.2  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5158  hypothetical protein  37.58 
 
 		 313 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3383  hypothetical protein  36.91 
 
 		 313 aa  75.9  0.0000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.431478  hitchhiker  0.00234809 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4254  hypothetical protein  39.29 
 
 		 143 aa  75.5  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0097  hypothetical protein  37.5 
 
 		 139 aa  73.9  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000827491 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2449  hypothetical protein  53.06 
 
 		 93 aa  59.3  0.00000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.941698  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1227  hypothetical protein  28.48 
 
 		 216 aa  45.4  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.833302 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>