72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_20320 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_20320  uncharacterized AP superfamily protein  100 
 
 		 427 aa  846    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.291938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3574  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  62.5 
 
 		 426 aa  493  9.999999999999999e-139  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3820  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  60.92 
 
 		 398 aa  431  1e-119  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.965003  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3829  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  29.91 
 
 		 312 aa  69.7  0.00000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.750718  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0126  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  27.1 
 
 		 411 aa  69.7  0.0000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000372693 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1643  nucleotide diphosphatase  29.8 
 
 		 411 aa  64.3  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0839592 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0836  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  27.1 
 
 		 499 aa  63.2  0.000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0400  Phosphodiesterase I  26.61 
 
 		 422 aa  58.9  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0422651  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4617  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.11 
 
 		 422 aa  58.9  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3526  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  33.07 
 
 		 455 aa  58.5  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.34184  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1217  Nucleotide diphosphatase  27.46 
 
 		 417 aa  57.8  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.446386  normal  0.0486309 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2615  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  22.91 
 
 		 499 aa  57  0.0000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000242867  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3586  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  29.58 
 
 		 616 aa  56.6  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2550  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25 
 
 		 321 aa  56.2  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.49777  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4875  phosphonoacetate hydrolase  28.97 
 
 		 424 aa  55.5  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.546493 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1449  phosphodiesterase I  23.1 
 
 		 417 aa  55.8  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.982314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4352  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  34.02 
 
 		 725 aa  54.3  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.268784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1865  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.17 
 
 		 430 aa  53.9  0.000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2080  phosphodiesterase I  32.63 
 
 		 433 aa  53.1  0.000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6162  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  20.54 
 
 		 433 aa  53.1  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0270594 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_70997  phosphodiesterase; putative nucleotide pyrophosphatase precursor  38.03 
 
 		 709 aa  53.1  0.000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.42018 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1625  phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  21.07 
 
 		 431 aa  52.8  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.018842  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2169  phosphodiesterase I  32.63 
 
 		 433 aa  53.1  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1244  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  30.95 
 
 		 262 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1526  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  27.27 
 
 		 456 aa  52  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.579511 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04783  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  38.64 
 
 		 384 aa  52.4  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.256465  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2969  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  26.07 
 
 		 558 aa  51.6  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00836901  hitchhiker  0.00161075 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4485  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  34.62 
 
 		 683 aa  50.4  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000194972 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0697  hypothetical protein  23.49 
 
 		 435 aa  50.4  0.00006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.00000533536  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5730  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.78 
 
 		 349 aa  50.1  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0713  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.42 
 
 		 496 aa  49.7  0.00009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1878  phosphodiesterase I  24.09 
 
 		 428 aa  50.1  0.00009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.872565 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4133  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  26.3 
 
 		 377 aa  49.3  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0770784  hitchhiker  0.0000385329 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07550  nucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase family member (Eurofung)  32.39 
 
 		 713 aa  48.9  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.934935  decreased coverage  0.0000816404 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1096  phosphonoacetate hydrolase  29.41 
 
 		 415 aa  48.5  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.111519 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4692  phosphonoacetate hydrolase  30.77 
 
 		 413 aa  48.9  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0732  hypothetical protein  22.35 
 
 		 429 aa  48.9  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.368831  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1106  phosphodiesterase I  22.81 
 
 		 424 aa  48.9  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1841  phosphodiesterase I  22.28 
 
 		 400 aa  47.8  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.126105  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1377  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  43.4 
 
 		 562 aa  48.1  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00130  hypothetical protein  21.86 
 
 		 540 aa  47.8  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.997572  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0459  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  21.74 
 
 		 437 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000352443  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5876  Type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  28.93 
 
 		 411 aa  47.8  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3194  phosphonoacetate hydrolase  31.36 
 
 		 412 aa  47.8  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1181  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  22.83 
 
 		 478 aa  47.4  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0227784  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4913  hypothetical protein  27.34 
 
 		 619 aa  47.4  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.560347 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2529  phosphonoacetate hydrolase  30.51 
 
 		 471 aa  47  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6493  Type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  30.51 
 
 		 412 aa  47  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000588943  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0368  type I phosphodiesterase  20.62 
 
 		 437 aa  47  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000500368  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3142  phosphonoacetate hydrolase  30.51 
 
 		 412 aa  47  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3158  phosphonoacetate hydrolase  30.51 
 
 		 412 aa  47  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19589  normal  0.0309825 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3427  phosphonoacetate hydrolase  30.25 
 
 		 436 aa  45.8  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0619528  normal  0.0462942 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3220  phosphonoacetate hydrolase  30 
 
 		 408 aa  46.6  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.169874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4169  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24.09 
 
 		 445 aa  46.2  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0770281  hitchhiker  0.00388008 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3134  phosphonoacetate hydrolase  30.51 
 
 		 412 aa  46.2  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000133169 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5338  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  26.55 
 
 		 509 aa  46.2  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.935168 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4865  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  22.22 
 
 		 437 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7345  hypothetical protein  26.56 
 
 		 531 aa  45.8  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.617386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0776  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.42 
 
 		 501 aa  45.1  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0542283  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0394  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  20.4 
 
 		 437 aa  44.7  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.143254  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0438  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  20.4 
 
 		 437 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0508  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  20.62 
 
 		 437 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.350178  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0380  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  20.4 
 
 		 437 aa  44.7  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0361814  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0508  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  20.62 
 
 		 437 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0371  type I phosphodiesterase  20.4 
 
 		 437 aa  44.3  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00015541  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03452  putative type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase protein  21.9 
 
 		 447 aa  44.3  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1658  nucleotide diphosphatase  26.34 
 
 		 413 aa  44.3  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2459  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24.69 
 
 		 434 aa  43.9  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0374  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  21.2 
 
 		 437 aa  43.5  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00616587  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3195  hemopexin repeat-containing protein  25.23 
 
 		 262 aa  43.5  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000696311  hitchhiker  0.000000000670294 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2339  phosphonoacetate hydrolase  28.19 
 
 		 421 aa  43.1  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.446144  normal  0.522386 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3077  phosphonoacetate hydrolase  30.61 
 
 		 437 aa  43.1  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0898295 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>